Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G112350.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S5R7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G143400 - -
2 Sobic.007G069800 expressed protein -
3 Sobic.005G052100 expressed protein -
4 Sobic.002G069800 OsFBX221 - F-box domain containing protein, expressed -
5 Sobic.007G127700 DUF581 domain containing protein, expressed -
6 Sobic.001G328350 - -
7 Sobic.004G090200 OsFBX46 - F-box domain containing protein, expressed -
8 Sobic.005G003100 expressed protein -
9 Sobic.009G013200 - -
10 Sobic.003G213100 AAA-type ATPase family protein, putative, expressed -
11 Sobic.001G330600 NAD dependent epimerase/dehydratase family protein, putative, expressed -
12 Sobic.009G051201 - -
13 Sobic.002G211400 OsFBL33 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
14 Sobic.002G147500 early fruit mRNA, putative, expressed -
15 Sobic.008G064100 flavin monooxygenase, putative, expressed K11816: indole-3-pyruvate monooxygenase
16 Sobic.005G075000 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
17 Sobic.002G132100 - -
18 Sobic.003G225800 AAA-type ATPase family protein, putative, expressed -
19 Sobic.005G035500 expressed protein -
20 Sobic.005G197000 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K14411: RNA-binding protein Musashi


Gene co-expression network
sample Sobic001G112350 Sobic001G112350 Sobic008G143400 Sobic008G143400 Sobic001G112350--Sobic008G143400 Sobic007G069800 Sobic007G069800 Sobic001G112350--Sobic007G069800 Sobic005G052100 Sobic005G052100 Sobic001G112350--Sobic005G052100 Sobic002G069800 Sobic002G069800 Sobic001G112350--Sobic002G069800 Sobic007G127700 Sobic007G127700 Sobic001G112350--Sobic007G127700 Sobic001G328350 Sobic001G328350 Sobic001G112350--Sobic001G328350 Sobic004G090200 Sobic004G090200 Sobic001G112350--Sobic004G090200 Sobic005G003100 Sobic005G003100 Sobic001G112350--Sobic005G003100 Sobic009G013200 Sobic009G013200 Sobic001G112350--Sobic009G013200 Sobic008G143400--Sobic001G112350 Sobic008G143400--Sobic007G069800 Sobic008G143400--Sobic001G328350 Sobic008G143400--Sobic005G052100 Sobic008G143400--Sobic002G069800 Sobic008G143400--Sobic007G127700 Sobic008G064100 Sobic008G064100 Sobic008G143400--Sobic008G064100 Sobic002G211400 Sobic002G211400 Sobic008G143400--Sobic002G211400 Sobic004G102600 Sobic004G102600 Sobic008G143400--Sobic004G102600 Sobic007G069800--Sobic005G052100 Sobic007G069800--Sobic001G112350 Sobic007G069800--Sobic007G127700 Sobic007G069800--Sobic002G069800 Sobic007G069800--Sobic008G143400 Sobic007G069800--Sobic005G003100 Sobic009G051201 Sobic009G051201 Sobic007G069800--Sobic009G051201 Sobic003G213100 Sobic003G213100 Sobic007G069800--Sobic003G213100 Sobic007G069800--Sobic009G013200 Sobic005G052100--Sobic007G069800 Sobic005G052100--Sobic001G112350 Sobic005G052100--Sobic002G069800 Sobic005G052100--Sobic005G003100 Sobic005G052100--Sobic007G127700 Sobic005G052100--Sobic009G013200 Sobic005G052100--Sobic008G143400 Sobic005G052100--Sobic003G213100 Sobic001G330600 Sobic001G330600 Sobic005G052100--Sobic001G330600 Sobic002G069800--Sobic003G213100 Sobic002G069800--Sobic005G003100 Sobic002G069800--Sobic009G051201 Sobic002G069800--Sobic005G052100 Sobic002G069800--Sobic007G069800 Sobic005G035500 Sobic005G035500 Sobic002G069800--Sobic005G035500 Sobic003G225800 Sobic003G225800 Sobic002G069800--Sobic003G225800 Sobic005G197000 Sobic005G197000 Sobic002G069800--Sobic005G197000 Sobic002G217000 Sobic002G217000 Sobic002G069800--Sobic002G217000 Sobic007G127700--Sobic007G069800 Sobic007G127700--Sobic009G051201 Sobic007G127700--Sobic005G052100 Sobic007G127700--Sobic002G069800 Sobic007G127700--Sobic003G213100 Sobic007G127700--Sobic001G112350 Sobic007G127700--Sobic009G013200 Sobic007G127700--Sobic005G003100 Sobic007G127700--Sobic001G330600 Sobic001G328350--Sobic004G102600 Sobic001G328350--Sobic008G143400 Sobic001G328350--Sobic001G112350 Sobic007G127900 Sobic007G127900 Sobic001G328350--Sobic007G127900 Sobic001G328350--Sobic007G069800 Sobic009G239400 Sobic009G239400 Sobic001G328350--Sobic009G239400 Sobic001G328350--Sobic005G052100 Sobic004G111650 Sobic004G111650 Sobic001G328350--Sobic004G111650 Sobic001G328350--Sobic002G211400 Sobic004G090200--Sobic001G330600 Sobic002G147500 Sobic002G147500 Sobic004G090200--Sobic002G147500 Sobic004G090200--Sobic005G052100 Sobic004G187200 Sobic004G187200 Sobic004G090200--Sobic004G187200 Sobic006G279000 Sobic006G279000 Sobic004G090200--Sobic006G279000 Sobic004G090200--Sobic009G013200 Sobic004G090200--Sobic001G112350 Sobic004G090200--Sobic007G069800 Sobic004G090300 Sobic004G090300 Sobic004G090200--Sobic004G090300 Sobic005G003100--Sobic003G213100 Sobic005G003100--Sobic002G069800 Sobic005G003100--Sobic009G051201 Sobic005G075000 Sobic005G075000 Sobic005G003100--Sobic005G075000 Sobic005G003100--Sobic003G225800 Sobic005G003100--Sobic009G013200 Sobic002G101200 Sobic002G101200 Sobic005G003100--Sobic002G101200 Sobic005G003100--Sobic002G217000 Sobic005G003100--Sobic005G052100 Sobic009G013200--Sobic001G330600 Sobic007G122932 Sobic007G122932 Sobic009G013200--Sobic007G122932 Sobic009G013200--Sobic002G147500 Sobic009G013200--Sobic003G213100 Sobic009G013200--Sobic005G075000 Sobic009G013200--Sobic005G003100 Sobic007G123000 Sobic007G123000 Sobic009G013200--Sobic007G123000 Sobic009G013200--Sobic009G051201 Sobic009G013200--Sobic003G225800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.