Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G075000.1
Synonym
Functional annotation LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed
UniProt A0A1B6PQQ9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g13960.1 : LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G271400 methyl-CpG binding domain containing protein, expressed -
2 Sobic.010G209300 expressed protein -
3 Sobic.006G031000 MYB family transcription factor, putative, expressed -
4 Sobic.005G003100 expressed protein -
5 Sobic.009G013200 - -
6 Sobic.007G122932 - -
7 Sobic.001G330600 NAD dependent epimerase/dehydratase family protein, putative, expressed -
8 Sobic.009G051201 - -
9 Sobic.003G291100 - -
10 Sobic.002G101200 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10638: UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1
11 Sobic.002G147500 early fruit mRNA, putative, expressed -
12 Sobic.002G166800 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.010G010300 - -
14 Sobic.003G363300 hydrolase, alpha/beta fold family protein, putative, expressed -
15 Sobic.002G408700 OsFBX259 - F-box domain containing protein, expressed -
16 Sobic.007G123000 sex determination protein tasselseed-2, putative, expressed -
17 Sobic.006G279000 expressed protein -
18 Sobic.007G147300 Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed K09286: EREBP-like factor
19 Sobic.010G058000 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
20 Sobic.009G021300 Jacalin-like lectin domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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