Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G137500.1
Synonym AGL80, Sb03g011705, FEM111
Functional annotation OsMADS87 - MADS-box family gene with M-gamma type-box, expressed
UniProt A0A1B6Q319
Pfam PF00319
Panther DB PTHR11945 PTHR11945:SF161
NCBI CDD KOG0014; MADS box transcription factor
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0003677; DNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G65300 : AGAMOUS-like 38
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g38610.1 : OsMADS87 - MADS-box family gene with M-gamma type-box, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G080300 MBTB20 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
2 Sobic.007G127900 DUF581 domain containing protein, expressed -
3 Sobic.004G102600 - -
4 Sobic.005G179900 OsMADS89 - MADS-box family gene with M-gamma type-box, expressed -
5 Sobic.002G057700 - -
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10 Sobic.004G020150 - -
11 Sobic.010G192200 two-component response regulator, putative, expressed K14491: two-component response regulator ARR-B family
12 Sobic.010G133275 - -
13 Sobic.008G140500 expressed protein -
14 Sobic.009G041900 - -
15 Sobic.006G142925 - -
16 Sobic.004G055901 - -
17 Sobic.010G119100 - -
18 Sobic.009G088575 - -
19 Sobic.003G165401 - -
20 Sobic.009G019400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G137500 Sobic003G137500 Sobic007G080300 Sobic007G080300 Sobic003G137500--Sobic007G080300 Sobic007G127900 Sobic007G127900 Sobic003G137500--Sobic007G127900 Sobic004G102600 Sobic004G102600 Sobic003G137500--Sobic004G102600 Sobic005G179900 Sobic005G179900 Sobic003G137500--Sobic005G179900 Sobic002G057700 Sobic002G057700 Sobic003G137500--Sobic002G057700 Sobic001G328350 Sobic001G328350 Sobic003G137500--Sobic001G328350 Sobic008G069100 Sobic008G069100 Sobic003G137500--Sobic008G069100 Sobic009G239400 Sobic009G239400 Sobic003G137500--Sobic009G239400 Sobic006G077800 Sobic006G077800 Sobic003G137500--Sobic006G077800 Sobic010G022900 Sobic010G022900 Sobic007G080300--Sobic010G022900 Sobic005G110448 Sobic005G110448 Sobic007G080300--Sobic005G110448 Sobic007G080300--Sobic003G137500 Sobic007G080300--Sobic006G077800 Sobic003G010000 Sobic003G010000 Sobic007G080300--Sobic003G010000 Sobic010G119100 Sobic010G119100 Sobic007G080300--Sobic010G119100 Sobic007G024100 Sobic007G024100 Sobic007G080300--Sobic007G024100 Sobic003G167566 Sobic003G167566 Sobic007G080300--Sobic003G167566 Sobic010G008200 Sobic010G008200 Sobic007G080300--Sobic010G008200 Sobic007G127900--Sobic009G239400 Sobic007G127900--Sobic004G102600 Sobic007G127900--Sobic008G069100 Sobic006G142925 Sobic006G142925 Sobic007G127900--Sobic006G142925 Sobic002G069300 Sobic002G069300 Sobic007G127900--Sobic002G069300 Sobic009G019400 Sobic009G019400 Sobic007G127900--Sobic009G019400 Sobic004G020150 Sobic004G020150 Sobic007G127900--Sobic004G020150 Sobic010G143666 Sobic010G143666 Sobic007G127900--Sobic010G143666 Sobic008G140500 Sobic008G140500 Sobic007G127900--Sobic008G140500 Sobic004G102600--Sobic001G328350 Sobic004G102600--Sobic007G127900 Sobic004G102600--Sobic009G239400 Sobic004G102600--Sobic004G020150 Sobic004G102600--Sobic008G069100 Sobic004G102600--Sobic006G142925 Sobic004G111650 Sobic004G111650 Sobic004G102600--Sobic004G111650 Sobic008G143400 Sobic008G143400 Sobic004G102600--Sobic008G143400 Sobic004G102600--Sobic008G140500 Sobic005G179900--Sobic002G057700 Sobic010G192200 Sobic010G192200 Sobic005G179900--Sobic010G192200 Sobic010G133275 Sobic010G133275 Sobic005G179900--Sobic010G133275 Sobic004G055901 Sobic004G055901 Sobic005G179900--Sobic004G055901 Sobic005G179900--Sobic003G137500 Sobic002G344800 Sobic002G344800 Sobic005G179900--Sobic002G344800 Sobic001G310000 Sobic001G310000 Sobic005G179900--Sobic001G310000 Sobic004G221800 Sobic004G221800 Sobic005G179900--Sobic004G221800 Sobic005G179900--Sobic008G069100 Sobic002G057700--Sobic005G179900 Sobic002G057700--Sobic010G192200 Sobic002G057700--Sobic004G055901 Sobic002G057700--Sobic010G133275 Sobic003G165401 Sobic003G165401 Sobic002G057700--Sobic003G165401 Sobic002G057700--Sobic008G140500 Sobic003G137000 Sobic003G137000 Sobic002G057700--Sobic003G137000 Sobic002G057700--Sobic002G344800 Sobic002G057700--Sobic003G137500 Sobic001G328350--Sobic004G102600 Sobic001G328350--Sobic008G143400 Sobic001G112350 Sobic001G112350 Sobic001G328350--Sobic001G112350 Sobic001G328350--Sobic007G127900 Sobic007G069800 Sobic007G069800 Sobic001G328350--Sobic007G069800 Sobic001G328350--Sobic009G239400 Sobic005G052100 Sobic005G052100 Sobic001G328350--Sobic005G052100 Sobic001G328350--Sobic004G111650 Sobic002G211400 Sobic002G211400 Sobic001G328350--Sobic002G211400 Sobic008G069100--Sobic006G142925 Sobic008G069100--Sobic002G069300 Sobic008G069100--Sobic010G143666 Sobic008G069100--Sobic009G019400 Sobic008G069100--Sobic009G239400 Sobic008G069100--Sobic007G127900 Sobic003G281000 Sobic003G281000 Sobic008G069100--Sobic003G281000 Sobic008G069100--Sobic002G344800 Sobic002G202050 Sobic002G202050 Sobic008G069100--Sobic002G202050 Sobic009G239400--Sobic006G142925 Sobic009G239400--Sobic007G127900 Sobic009G239400--Sobic008G069100 Sobic009G239400--Sobic002G069300 Sobic009G239400--Sobic004G020150 Sobic009G239400--Sobic009G019400 Sobic009G239400--Sobic004G102600 Sobic009G239400--Sobic010G143666 Sobic009G239400--Sobic003G165401 Sobic004G126900 Sobic004G126900 Sobic006G077800--Sobic004G126900 Sobic004G090500 Sobic004G090500 Sobic006G077800--Sobic004G090500 Sobic008G012000 Sobic008G012000 Sobic006G077800--Sobic008G012000 Sobic007G024000 Sobic007G024000 Sobic006G077800--Sobic007G024000 Sobic008G069200 Sobic008G069200 Sobic006G077800--Sobic008G069200 Sobic007G083900 Sobic007G083900 Sobic006G077800--Sobic007G083900 Sobic010G137600 Sobic010G137600 Sobic006G077800--Sobic010G137600 Sobic001G443500 Sobic001G443500 Sobic006G077800--Sobic001G443500 Sobic001G029700 Sobic001G029700 Sobic006G077800--Sobic001G029700
Octagon: transcription factors


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