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Transcriptome id Sobic.009G041900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6P6M1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G290900 - -
2 Sobic.005G035800 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
3 Sobic.005G179900 OsMADS89 - MADS-box family gene with M-gamma type-box, expressed -
4 Sobic.002G057700 - -
5 Sobic.003G137500 OsMADS87 - MADS-box family gene with M-gamma type-box, expressed -
6 Sobic.010G192200 two-component response regulator, putative, expressed K14491: two-component response regulator ARR-B family
7 Sobic.010G133275 - -
8 Sobic.004G055901 - -
9 Sobic.010G119100 - -
10 Sobic.005G225901 - -
11 Sobic.001G052350 - -
12 Sobic.003G231400 lignin modification(PubMedID : 28529519)@laccase precursor protein, putative, expressed K05909: laccase
13 Sobic.001G450200 - -
14 Sobic.007G127900 DUF581 domain containing protein, expressed -
15 Sobic.008G140500 expressed protein -
16 Sobic.008G069100 expressed protein -
17 Sobic.009G152350 - -
18 Sobic.007G080300 MBTB20 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
19 Sobic.003G165401 - -
20 Sobic.009G079975 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G041900 Sobic009G041900 Sobic001G290900 Sobic001G290900 Sobic009G041900--Sobic001G290900 Sobic005G035800 Sobic005G035800 Sobic009G041900--Sobic005G035800 Sobic005G179900 Sobic005G179900 Sobic009G041900--Sobic005G179900 Sobic002G057700 Sobic002G057700 Sobic009G041900--Sobic002G057700 Sobic003G137500 Sobic003G137500 Sobic009G041900--Sobic003G137500 Sobic010G192200 Sobic010G192200 Sobic009G041900--Sobic010G192200 Sobic010G133275 Sobic010G133275 Sobic009G041900--Sobic010G133275 Sobic004G055901 Sobic004G055901 Sobic009G041900--Sobic004G055901 Sobic010G119100 Sobic010G119100 Sobic009G041900--Sobic010G119100 Sobic001G290900--Sobic009G041900 Sobic007G032200 Sobic007G032200 Sobic001G290900--Sobic007G032200 Sobic002G211400 Sobic002G211400 Sobic001G290900--Sobic002G211400 Sobic001G290900--Sobic005G035800 Sobic001G198300 Sobic001G198300 Sobic001G290900--Sobic001G198300 Sobic001G371650 Sobic001G371650 Sobic001G290900--Sobic001G371650 Sobic003G193900 Sobic003G193900 Sobic001G290900--Sobic003G193900 Sobic004G264800 Sobic004G264800 Sobic001G290900--Sobic004G264800 Sobic001G421450 Sobic001G421450 Sobic001G290900--Sobic001G421450 Sobic005G225901 Sobic005G225901 Sobic005G035800--Sobic005G225901 Sobic009G152350 Sobic009G152350 Sobic005G035800--Sobic009G152350 Sobic001G052350 Sobic001G052350 Sobic005G035800--Sobic001G052350 Sobic004G071850 Sobic004G071850 Sobic005G035800--Sobic004G071850 Sobic008G061900 Sobic008G061900 Sobic005G035800--Sobic008G061900 Sobic004G081300 Sobic004G081300 Sobic005G035800--Sobic004G081300 Sobic005G035800--Sobic009G041900 Sobic002G114200 Sobic002G114200 Sobic005G035800--Sobic002G114200 Sobic002G411200 Sobic002G411200 Sobic005G035800--Sobic002G411200 Sobic005G179900--Sobic002G057700 Sobic005G179900--Sobic010G192200 Sobic005G179900--Sobic010G133275 Sobic005G179900--Sobic004G055901 Sobic005G179900--Sobic003G137500 Sobic002G344800 Sobic002G344800 Sobic005G179900--Sobic002G344800 Sobic001G310000 Sobic001G310000 Sobic005G179900--Sobic001G310000 Sobic004G221800 Sobic004G221800 Sobic005G179900--Sobic004G221800 Sobic008G069100 Sobic008G069100 Sobic005G179900--Sobic008G069100 Sobic002G057700--Sobic005G179900 Sobic002G057700--Sobic010G192200 Sobic002G057700--Sobic004G055901 Sobic002G057700--Sobic010G133275 Sobic003G165401 Sobic003G165401 Sobic002G057700--Sobic003G165401 Sobic008G140500 Sobic008G140500 Sobic002G057700--Sobic008G140500 Sobic003G137000 Sobic003G137000 Sobic002G057700--Sobic003G137000 Sobic002G057700--Sobic002G344800 Sobic002G057700--Sobic003G137500 Sobic007G080300 Sobic007G080300 Sobic003G137500--Sobic007G080300 Sobic007G127900 Sobic007G127900 Sobic003G137500--Sobic007G127900 Sobic004G102600 Sobic004G102600 Sobic003G137500--Sobic004G102600 Sobic003G137500--Sobic005G179900 Sobic003G137500--Sobic002G057700 Sobic001G328350 Sobic001G328350 Sobic003G137500--Sobic001G328350 Sobic003G137500--Sobic008G069100 Sobic009G239400 Sobic009G239400 Sobic003G137500--Sobic009G239400 Sobic006G077800 Sobic006G077800 Sobic003G137500--Sobic006G077800 Sobic010G192200--Sobic004G055901 Sobic010G192200--Sobic002G057700 Sobic010G192200--Sobic003G165401 Sobic010G192200--Sobic008G140500 Sobic010G192200--Sobic003G137000 Sobic010G192200--Sobic010G133275 Sobic010G192200--Sobic005G179900 Sobic002G124832 Sobic002G124832 Sobic010G192200--Sobic002G124832 Sobic010G192200--Sobic002G344800 Sobic010G133275--Sobic002G344800 Sobic002G202050 Sobic002G202050 Sobic010G133275--Sobic002G202050 Sobic006G247200 Sobic006G247200 Sobic010G133275--Sobic006G247200 Sobic010G143666 Sobic010G143666 Sobic010G133275--Sobic010G143666 Sobic002G014100 Sobic002G014100 Sobic010G133275--Sobic002G014100 Sobic002G382200 Sobic002G382200 Sobic010G133275--Sobic002G382200 Sobic004G055901--Sobic010G192200 Sobic004G055901--Sobic002G057700 Sobic004G055901--Sobic008G140500 Sobic004G055901--Sobic003G165401 Sobic004G055901--Sobic003G137000 Sobic004G055901--Sobic002G124832 Sobic004G055901--Sobic010G133275 Sobic002G069300 Sobic002G069300 Sobic004G055901--Sobic002G069300 Sobic004G055901--Sobic005G179900 Sobic007G109000 Sobic007G109000 Sobic010G119100--Sobic007G109000 Sobic005G074700 Sobic005G074700 Sobic010G119100--Sobic005G074700 Sobic005G152932 Sobic005G152932 Sobic010G119100--Sobic005G152932 Sobic007G047000 Sobic007G047000 Sobic010G119100--Sobic007G047000 Sobic009G039000 Sobic009G039000 Sobic010G119100--Sobic009G039000 Sobic004G017700 Sobic004G017700 Sobic010G119100--Sobic004G017700 Sobic010G233500 Sobic010G233500 Sobic010G119100--Sobic010G233500 Sobic005G148700 Sobic005G148700 Sobic010G119100--Sobic005G148700 Sobic002G345600 Sobic002G345600 Sobic010G119100--Sobic002G345600
Octagon: transcription factors


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