Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G055901.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RLW1
Pfam PF14303
Panther DB PTHR11260 PTHR11260:SF267
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G47680 : DNA binding
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g42890.1 : DNA binding protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G192200 two-component response regulator, putative, expressed K14491: two-component response regulator ARR-B family
2 Sobic.002G057700 - -
3 Sobic.008G140500 expressed protein -
4 Sobic.003G165401 - -
5 Sobic.003G137000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
6 Sobic.002G124832 - -
7 Sobic.010G133275 - -
8 Sobic.002G069300 DNA binding protein, putative, expressed -
9 Sobic.005G179900 OsMADS89 - MADS-box family gene with M-gamma type-box, expressed -
10 Sobic.004G020150 - -
11 Sobic.002G014100 OsFBX212 - F-box domain containing protein, expressed -
12 Sobic.002G344800 - -
13 Sobic.006G142925 - -
14 Sobic.010G143666 - -
15 Sobic.003G155700 transcription initiation factor IID, 18kD subunit family protein, expressed K03127: transcription initiation factor TFIID subunit 13
16 Sobic.003G332300 AP2 domain containing protein, expressed -
17 Sobic.003G281000 - -
18 Sobic.007G072700 - -
19 Sobic.010G011500 - -
20 Sobic.002G202050 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G055901 Sobic004G055901 Sobic010G192200 Sobic010G192200 Sobic004G055901--Sobic010G192200 Sobic002G057700 Sobic002G057700 Sobic004G055901--Sobic002G057700 Sobic008G140500 Sobic008G140500 Sobic004G055901--Sobic008G140500 Sobic003G165401 Sobic003G165401 Sobic004G055901--Sobic003G165401 Sobic003G137000 Sobic003G137000 Sobic004G055901--Sobic003G137000 Sobic002G124832 Sobic002G124832 Sobic004G055901--Sobic002G124832 Sobic010G133275 Sobic010G133275 Sobic004G055901--Sobic010G133275 Sobic002G069300 Sobic002G069300 Sobic004G055901--Sobic002G069300 Sobic005G179900 Sobic005G179900 Sobic004G055901--Sobic005G179900 Sobic010G192200--Sobic004G055901 Sobic010G192200--Sobic002G057700 Sobic010G192200--Sobic003G165401 Sobic010G192200--Sobic008G140500 Sobic010G192200--Sobic003G137000 Sobic010G192200--Sobic010G133275 Sobic010G192200--Sobic005G179900 Sobic010G192200--Sobic002G124832 Sobic002G344800 Sobic002G344800 Sobic010G192200--Sobic002G344800 Sobic002G057700--Sobic005G179900 Sobic002G057700--Sobic010G192200 Sobic002G057700--Sobic004G055901 Sobic002G057700--Sobic010G133275 Sobic002G057700--Sobic003G165401 Sobic002G057700--Sobic008G140500 Sobic002G057700--Sobic003G137000 Sobic002G057700--Sobic002G344800 Sobic003G137500 Sobic003G137500 Sobic002G057700--Sobic003G137500 Sobic008G140500--Sobic003G165401 Sobic008G140500--Sobic003G137000 Sobic004G020150 Sobic004G020150 Sobic008G140500--Sobic004G020150 Sobic006G142925 Sobic006G142925 Sobic008G140500--Sobic006G142925 Sobic008G140500--Sobic004G055901 Sobic008G140500--Sobic002G124832 Sobic008G140500--Sobic010G192200 Sobic009G239400 Sobic009G239400 Sobic008G140500--Sobic009G239400 Sobic008G140500--Sobic002G069300 Sobic003G165401--Sobic003G137000 Sobic003G165401--Sobic008G140500 Sobic003G165401--Sobic002G069300 Sobic003G165401--Sobic002G124832 Sobic003G165401--Sobic006G142925 Sobic002G014100 Sobic002G014100 Sobic003G165401--Sobic002G014100 Sobic010G143666 Sobic010G143666 Sobic003G165401--Sobic010G143666 Sobic003G165401--Sobic010G192200 Sobic003G281000 Sobic003G281000 Sobic003G165401--Sobic003G281000 Sobic003G137000--Sobic003G165401 Sobic003G137000--Sobic002G124832 Sobic003G137000--Sobic002G069300 Sobic003G137000--Sobic002G014100 Sobic003G137000--Sobic010G143666 Sobic003G137000--Sobic003G281000 Sobic003G137000--Sobic006G142925 Sobic003G137000--Sobic008G140500 Sobic003G137000--Sobic002G344800 Sobic002G124832--Sobic003G137000 Sobic002G124832--Sobic003G165401 Sobic002G124832--Sobic002G069300 Sobic002G124832--Sobic002G014100 Sobic002G124832--Sobic006G142925 Sobic002G124832--Sobic010G143666 Sobic002G124832--Sobic003G281000 Sobic002G124832--Sobic008G140500 Sobic002G202050 Sobic002G202050 Sobic002G124832--Sobic002G202050 Sobic010G133275--Sobic002G344800 Sobic010G133275--Sobic002G202050 Sobic006G247200 Sobic006G247200 Sobic010G133275--Sobic006G247200 Sobic010G133275--Sobic010G143666 Sobic010G133275--Sobic002G014100 Sobic002G382200 Sobic002G382200 Sobic010G133275--Sobic002G382200 Sobic002G069300--Sobic006G142925 Sobic002G069300--Sobic010G143666 Sobic002G069300--Sobic002G014100 Sobic002G069300--Sobic003G281000 Sobic002G069300--Sobic002G202050 Sobic002G069300--Sobic006G247200 Sobic005G179900--Sobic002G057700 Sobic005G179900--Sobic010G192200 Sobic005G179900--Sobic010G133275 Sobic005G179900--Sobic004G055901 Sobic005G179900--Sobic003G137500 Sobic005G179900--Sobic002G344800 Sobic001G310000 Sobic001G310000 Sobic005G179900--Sobic001G310000 Sobic004G221800 Sobic004G221800 Sobic005G179900--Sobic004G221800 Sobic008G069100 Sobic008G069100 Sobic005G179900--Sobic008G069100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.