Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G072700.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PG89
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G264800 expressed protein -
2 Sobic.007G156400 Up-reguralion under drought(PubMedID : 24916767)@alpha-amylase precursor, putative, expressed K01176: AMY, amyA, alpha-amylase
3 Sobic.003G253650 - -
4 Sobic.004G282200 DUF623 domain containing protein, expressed -
5 Sobic.001G371650 - -
6 Sobic.008G030801 - -
7 Sobic.010G011500 - -
8 Sobic.003G229900 - -
9 Sobic.001G297900 aminotransferase, classes I and II, domain containing protein, expressed K00652: 8-amino-7-oxononanoate synthase
10 Sobic.002G172300 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
11 Sobic.003G165401 - -
12 Sobic.002G055000 bZIP transcription factor domain containing protein, expressed -
13 Sobic.008G140500 expressed protein -
14 Sobic.001G421100 - -
15 Sobic.003G137000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
16 Sobic.002G054800 "O2(Ortholog in maize:Hartings et al., 1989)"(PubMedID : 31659852)@bZIP transcription factor domain containing protein, expressed -
17 Sobic.006G161200 cysteine-rich repeat secretory protein precursor, putative, expressed -
18 Sobic.006G049633 - -
19 Sobic.002G124832 - -
20 Sobic.001G071500 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G072700 Sobic007G072700 Sobic004G264800 Sobic004G264800 Sobic007G072700--Sobic004G264800 Sobic007G156400 Sobic007G156400 Sobic007G072700--Sobic007G156400 Sobic003G253650 Sobic003G253650 Sobic007G072700--Sobic003G253650 Sobic004G282200 Sobic004G282200 Sobic007G072700--Sobic004G282200 Sobic001G371650 Sobic001G371650 Sobic007G072700--Sobic001G371650 Sobic008G030801 Sobic008G030801 Sobic007G072700--Sobic008G030801 Sobic010G011500 Sobic010G011500 Sobic007G072700--Sobic010G011500 Sobic003G229900 Sobic003G229900 Sobic007G072700--Sobic003G229900 Sobic001G297900 Sobic001G297900 Sobic007G072700--Sobic001G297900 Sobic004G264800--Sobic007G072700 Sobic004G264800--Sobic007G156400 Sobic004G264800--Sobic004G282200 Sobic004G264800--Sobic003G253650 Sobic002G172300 Sobic002G172300 Sobic004G264800--Sobic002G172300 Sobic004G264800--Sobic001G371650 Sobic004G264800--Sobic008G030801 Sobic004G264800--Sobic003G229900 Sobic004G264800--Sobic010G011500 Sobic007G156400--Sobic007G072700 Sobic007G156400--Sobic004G264800 Sobic007G156400--Sobic004G282200 Sobic007G156400--Sobic001G371650 Sobic007G156400--Sobic003G253650 Sobic007G064400 Sobic007G064400 Sobic007G156400--Sobic007G064400 Sobic007G156400--Sobic002G172300 Sobic007G032200 Sobic007G032200 Sobic007G156400--Sobic007G032200 Sobic002G054800 Sobic002G054800 Sobic007G156400--Sobic002G054800 Sobic003G253650--Sobic002G054800 Sobic001G421100 Sobic001G421100 Sobic003G253650--Sobic001G421100 Sobic002G132201 Sobic002G132201 Sobic003G253650--Sobic002G132201 Sobic003G253650--Sobic008G030801 Sobic001G071500 Sobic001G071500 Sobic003G253650--Sobic001G071500 Sobic006G141200 Sobic006G141200 Sobic003G253650--Sobic006G141200 Sobic003G253650--Sobic007G072700 Sobic003G253650--Sobic002G172300 Sobic005G073300 Sobic005G073300 Sobic003G253650--Sobic005G073300 Sobic004G282200--Sobic004G264800 Sobic004G282200--Sobic007G072700 Sobic004G282200--Sobic001G371650 Sobic004G282200--Sobic007G156400 Sobic004G282200--Sobic007G032200 Sobic004G282200--Sobic008G030801 Sobic004G282200--Sobic002G172300 Sobic009G239400 Sobic009G239400 Sobic004G282200--Sobic009G239400 Sobic004G020150 Sobic004G020150 Sobic004G282200--Sobic004G020150 Sobic001G371650--Sobic002G054800 Sobic002G240200 Sobic002G240200 Sobic001G371650--Sobic002G240200 Sobic001G371650--Sobic002G132201 Sobic001G371650--Sobic001G071500 Sobic010G215201 Sobic010G215201 Sobic001G371650--Sobic010G215201 Sobic001G371650--Sobic005G073300 Sobic001G371650--Sobic007G032200 Sobic001G371650--Sobic008G030801 Sobic001G371650--Sobic002G172300 Sobic008G030801--Sobic001G071500 Sobic008G030801--Sobic010G011500 Sobic008G030801--Sobic001G297900 Sobic002G055000 Sobic002G055000 Sobic008G030801--Sobic002G055000 Sobic008G030801--Sobic010G215201 Sobic001G480900 Sobic001G480900 Sobic008G030801--Sobic001G480900 Sobic008G030801--Sobic003G229900 Sobic006G049633 Sobic006G049633 Sobic008G030801--Sobic006G049633 Sobic008G030801--Sobic002G054800 Sobic010G011500--Sobic002G055000 Sobic010G011500--Sobic001G480900 Sobic004G296750 Sobic004G296750 Sobic010G011500--Sobic004G296750 Sobic003G281000 Sobic003G281000 Sobic010G011500--Sobic003G281000 Sobic010G011500--Sobic006G049633 Sobic002G266700 Sobic002G266700 Sobic010G011500--Sobic002G266700 Sobic010G011500--Sobic001G297900 Sobic010G011500--Sobic003G229900 Sobic010G011500--Sobic008G030801 Sobic003G229900--Sobic006G049633 Sobic003G229900--Sobic002G055000 Sobic003G229900--Sobic010G011500 Sobic003G229900--Sobic001G480900 Sobic003G229900--Sobic002G266700 Sobic003G229900--Sobic004G296750 Sobic008G061900 Sobic008G061900 Sobic003G229900--Sobic008G061900 Sobic007G007100 Sobic007G007100 Sobic003G229900--Sobic007G007100 Sobic009G019400 Sobic009G019400 Sobic003G229900--Sobic009G019400 Sobic001G297900--Sobic002G055000 Sobic001G297900--Sobic010G011500 Sobic001G297900--Sobic001G480900 Sobic001G297900--Sobic008G030801 Sobic001G297900--Sobic006G049633 Sobic001G297900--Sobic004G296750 Sobic001G297900--Sobic002G266700 Sobic001G297900--Sobic003G229900 Sobic001G297900--Sobic003G281000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.