Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G156400.1
Synonym AMY1, ATAMY1, Sb07g023010
Functional annotation Up-reguralion under drought (PubMedID : 24916767)
alpha-amylase precursor, putative, expressed
UniProt C5YMA9
Pfam PF00128 PF07821
Panther DB PTHR10357 PTHR10357:SF153
NCBI CDD KOG0471; Alpha-amylase
KEGG Orthology K01176; AMY, amyA, alpha-amylase
Gene Ontology GO:0005975; carbohydrate metabolic process GO:0003824catalytic activity GO:0005509calcium ion binding GO:0004556alpha-amylase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G25000 : alpha-amylase-like
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g28420.1 : alpha-amylase precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a022221 , Zm00025a014064 , Zm00025a046841 , Zm00025a005424
Brachypodium KQJ90515 , KQK01755
Barley HORVU5Hr1G068350.1 , HORVU5Hr1G068350.2 , HORVU7Hr1G091150.1 , HORVU7Hr1G091150.2
Wheat TraesCS5A02G464500 , TraesCS4D02G284400 , TraesCS7D02G380500 , TraesCS5B02G236600 , TraesCS5D02G477100 , TraesCS5B02G476000 , TraesCS5D02G245000 , TraesCS4B02G285600 , TraesCS4B02G285400 , TraesCS7B02G286700 , TraesCS7B02G286000 , TraesCS5B02G475700 , TraesCS5A02G238100
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic007G156400 Sobic007G156400 Sobic007G072700 Sobic007G072700 Sobic007G156400--Sobic007G072700 Sobic004G264800 Sobic004G264800 Sobic007G156400--Sobic004G264800 Sobic004G282200 Sobic004G282200 Sobic007G156400--Sobic004G282200 Sobic001G371650 Sobic001G371650 Sobic007G156400--Sobic001G371650 Sobic003G253650 Sobic003G253650 Sobic007G156400--Sobic003G253650 Sobic007G064400 Sobic007G064400 Sobic007G156400--Sobic007G064400 Sobic002G172300 Sobic002G172300 Sobic007G156400--Sobic002G172300 Sobic007G032200 Sobic007G032200 Sobic007G156400--Sobic007G032200 Sobic002G054800 Sobic002G054800 Sobic007G156400--Sobic002G054800 Sobic007G072700--Sobic004G264800 Sobic007G072700--Sobic007G156400 Sobic007G072700--Sobic003G253650 Sobic007G072700--Sobic004G282200 Sobic007G072700--Sobic001G371650 Sobic008G030801 Sobic008G030801 Sobic007G072700--Sobic008G030801 Sobic010G011500 Sobic010G011500 Sobic007G072700--Sobic010G011500 Sobic003G229900 Sobic003G229900 Sobic007G072700--Sobic003G229900 Sobic001G297900 Sobic001G297900 Sobic007G072700--Sobic001G297900 Sobic004G264800--Sobic007G072700 Sobic004G264800--Sobic007G156400 Sobic004G264800--Sobic004G282200 Sobic004G264800--Sobic003G253650 Sobic004G264800--Sobic002G172300 Sobic004G264800--Sobic001G371650 Sobic004G264800--Sobic008G030801 Sobic004G264800--Sobic003G229900 Sobic004G264800--Sobic010G011500 Sobic004G282200--Sobic004G264800 Sobic004G282200--Sobic007G072700 Sobic004G282200--Sobic001G371650 Sobic004G282200--Sobic007G156400 Sobic004G282200--Sobic007G032200 Sobic004G282200--Sobic008G030801 Sobic004G282200--Sobic002G172300 Sobic009G239400 Sobic009G239400 Sobic004G282200--Sobic009G239400 Sobic004G020150 Sobic004G020150 Sobic004G282200--Sobic004G020150 Sobic001G371650--Sobic002G054800 Sobic002G240200 Sobic002G240200 Sobic001G371650--Sobic002G240200 Sobic002G132201 Sobic002G132201 Sobic001G371650--Sobic002G132201 Sobic001G071500 Sobic001G071500 Sobic001G371650--Sobic001G071500 Sobic010G215201 Sobic010G215201 Sobic001G371650--Sobic010G215201 Sobic005G073300 Sobic005G073300 Sobic001G371650--Sobic005G073300 Sobic001G371650--Sobic007G032200 Sobic001G371650--Sobic008G030801 Sobic001G371650--Sobic002G172300 Sobic003G253650--Sobic002G054800 Sobic001G421100 Sobic001G421100 Sobic003G253650--Sobic001G421100 Sobic003G253650--Sobic002G132201 Sobic003G253650--Sobic008G030801 Sobic003G253650--Sobic001G071500 Sobic006G141200 Sobic006G141200 Sobic003G253650--Sobic006G141200 Sobic003G253650--Sobic007G072700 Sobic003G253650--Sobic002G172300 Sobic003G253650--Sobic005G073300 Sobic001G234000 Sobic001G234000 Sobic007G064400--Sobic001G234000 Sobic004G187200 Sobic004G187200 Sobic007G064400--Sobic004G187200 Sobic004G090300 Sobic004G090300 Sobic007G064400--Sobic004G090300 Sobic006G279000 Sobic006G279000 Sobic007G064400--Sobic006G279000 Sobic004G090200 Sobic004G090200 Sobic007G064400--Sobic004G090200 Sobic002G059100 Sobic002G059100 Sobic007G064400--Sobic002G059100 Sobic007G064400--Sobic007G156400 Sobic001G297300 Sobic001G297300 Sobic007G064400--Sobic001G297300 Sobic002G147500 Sobic002G147500 Sobic007G064400--Sobic002G147500 Sobic002G172300--Sobic002G054800 Sobic002G172300--Sobic001G071500 Sobic002G172300--Sobic008G030801 Sobic002G172300--Sobic010G215201 Sobic002G172300--Sobic005G073300 Sobic002G172300--Sobic002G132201 Sobic002G172300--Sobic002G240200 Sobic002G172300--Sobic001G371650 Sobic002G172300--Sobic001G421100 Sobic007G032200--Sobic001G371650 Sobic007G032200--Sobic002G132201 Sobic007G032200--Sobic002G054800 Sobic007G032200--Sobic002G240200 Sobic007G032200--Sobic004G282200 Sobic007G032200--Sobic005G073300 Sobic003G048900 Sobic003G048900 Sobic007G032200--Sobic003G048900 Sobic007G032200--Sobic001G071500 Sobic009G022600 Sobic009G022600 Sobic007G032200--Sobic009G022600 Sobic002G054800--Sobic005G073300 Sobic002G054800--Sobic002G132201 Sobic002G054800--Sobic001G071500 Sobic002G054800--Sobic002G240200 Sobic002G054800--Sobic010G215201 Sobic003G149700 Sobic003G149700 Sobic002G054800--Sobic003G149700 Sobic002G054800--Sobic001G371650 Sobic002G054800--Sobic009G022600 Sobic002G054800--Sobic008G030801
Octagon: transcription factors


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