Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G469966.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5SAZ4
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Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G191400 OsFBX55 - F-box domain containing protein, expressed -
2 Sobic.007G072700 - -
3 Sobic.007G156400 Up-reguralion under drought(PubMedID : 24916767)@alpha-amylase precursor, putative, expressed K01176: AMY, amyA, alpha-amylase
4 Sobic.001G371650 - -
5 Sobic.004G264800 expressed protein -
6 Sobic.004G207350 - -
7 Sobic.004G282200 DUF623 domain containing protein, expressed -
8 Sobic.007G032200 - -
9 Sobic.004G037401 - -
10 Sobic.009G022600 - -
11 Sobic.003G253650 - -
12 Sobic.007G064400 glycosyl transferase 8 domain containing protein, putative, expressed K18819: inositol 3-alpha-galactosyltransferase
13 Sobic.008G030801 - -
14 Sobic.002G054800 "O2(Ortholog in maize:Hartings et al., 1989)"(PubMedID : 31659852)@bZIP transcription factor domain containing protein, expressed -
15 Sobic.002G172300 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
16 Sobic.001G421100 - -
17 Sobic.008G061900 - -
18 Sobic.008G140500 expressed protein -
19 Sobic.002G132201 - -
20 Sobic.010G011500 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G469966 Sobic001G469966 Sobic002G191400 Sobic002G191400 Sobic001G469966--Sobic002G191400 Sobic007G072700 Sobic007G072700 Sobic001G469966--Sobic007G072700 Sobic007G156400 Sobic007G156400 Sobic001G469966--Sobic007G156400 Sobic001G371650 Sobic001G371650 Sobic001G469966--Sobic001G371650 Sobic004G264800 Sobic004G264800 Sobic001G469966--Sobic004G264800 Sobic004G207350 Sobic004G207350 Sobic001G469966--Sobic004G207350 Sobic004G282200 Sobic004G282200 Sobic001G469966--Sobic004G282200 Sobic007G032200 Sobic007G032200 Sobic001G469966--Sobic007G032200 Sobic004G037401 Sobic004G037401 Sobic001G469966--Sobic004G037401 Sobic002G191400--Sobic001G469966 Sobic007G179700 Sobic007G179700 Sobic002G191400--Sobic007G179700 Sobic004G155000 Sobic004G155000 Sobic002G191400--Sobic004G155000 Sobic009G152350 Sobic009G152350 Sobic002G191400--Sobic009G152350 Sobic008G061900 Sobic008G061900 Sobic002G191400--Sobic008G061900 Sobic002G191400--Sobic007G072700 Sobic002G191400--Sobic004G207350 Sobic003G165401 Sobic003G165401 Sobic002G191400--Sobic003G165401 Sobic008G140500 Sobic008G140500 Sobic002G191400--Sobic008G140500 Sobic007G072700--Sobic004G264800 Sobic007G072700--Sobic007G156400 Sobic003G253650 Sobic003G253650 Sobic007G072700--Sobic003G253650 Sobic007G072700--Sobic004G282200 Sobic007G072700--Sobic001G371650 Sobic008G030801 Sobic008G030801 Sobic007G072700--Sobic008G030801 Sobic010G011500 Sobic010G011500 Sobic007G072700--Sobic010G011500 Sobic003G229900 Sobic003G229900 Sobic007G072700--Sobic003G229900 Sobic001G297900 Sobic001G297900 Sobic007G072700--Sobic001G297900 Sobic007G156400--Sobic007G072700 Sobic007G156400--Sobic004G264800 Sobic007G156400--Sobic004G282200 Sobic007G156400--Sobic001G371650 Sobic007G156400--Sobic003G253650 Sobic007G064400 Sobic007G064400 Sobic007G156400--Sobic007G064400 Sobic002G172300 Sobic002G172300 Sobic007G156400--Sobic002G172300 Sobic007G156400--Sobic007G032200 Sobic002G054800 Sobic002G054800 Sobic007G156400--Sobic002G054800 Sobic001G371650--Sobic002G054800 Sobic002G240200 Sobic002G240200 Sobic001G371650--Sobic002G240200 Sobic002G132201 Sobic002G132201 Sobic001G371650--Sobic002G132201 Sobic001G071500 Sobic001G071500 Sobic001G371650--Sobic001G071500 Sobic010G215201 Sobic010G215201 Sobic001G371650--Sobic010G215201 Sobic005G073300 Sobic005G073300 Sobic001G371650--Sobic005G073300 Sobic001G371650--Sobic007G032200 Sobic001G371650--Sobic008G030801 Sobic001G371650--Sobic002G172300 Sobic004G264800--Sobic007G072700 Sobic004G264800--Sobic007G156400 Sobic004G264800--Sobic004G282200 Sobic004G264800--Sobic003G253650 Sobic004G264800--Sobic002G172300 Sobic004G264800--Sobic001G371650 Sobic004G264800--Sobic008G030801 Sobic004G264800--Sobic003G229900 Sobic004G264800--Sobic010G011500 Sobic004G207350--Sobic004G037401 Sobic003G406120 Sobic003G406120 Sobic004G207350--Sobic003G406120 Sobic009G022600 Sobic009G022600 Sobic004G207350--Sobic009G022600 Sobic005G230900 Sobic005G230900 Sobic004G207350--Sobic005G230900 Sobic006G108766 Sobic006G108766 Sobic004G207350--Sobic006G108766 Sobic001G421450 Sobic001G421450 Sobic004G207350--Sobic001G421450 Sobic007G137201 Sobic007G137201 Sobic004G207350--Sobic007G137201 Sobic003G149700 Sobic003G149700 Sobic004G207350--Sobic003G149700 Sobic001G084133 Sobic001G084133 Sobic004G207350--Sobic001G084133 Sobic004G282200--Sobic004G264800 Sobic004G282200--Sobic007G072700 Sobic004G282200--Sobic001G371650 Sobic004G282200--Sobic007G156400 Sobic004G282200--Sobic007G032200 Sobic004G282200--Sobic008G030801 Sobic004G282200--Sobic002G172300 Sobic009G239400 Sobic009G239400 Sobic004G282200--Sobic009G239400 Sobic004G020150 Sobic004G020150 Sobic004G282200--Sobic004G020150 Sobic007G032200--Sobic001G371650 Sobic007G032200--Sobic002G132201 Sobic007G032200--Sobic002G054800 Sobic007G032200--Sobic002G240200 Sobic007G032200--Sobic004G282200 Sobic007G032200--Sobic005G073300 Sobic003G048900 Sobic003G048900 Sobic007G032200--Sobic003G048900 Sobic007G032200--Sobic001G071500 Sobic007G032200--Sobic009G022600 Sobic004G037401--Sobic009G022600 Sobic004G037401--Sobic003G149700 Sobic005G150250 Sobic005G150250 Sobic004G037401--Sobic005G150250 Sobic006G155400 Sobic006G155400 Sobic004G037401--Sobic006G155400 Sobic004G037401--Sobic002G132201 Sobic004G037401--Sobic005G073300 Sobic004G037401--Sobic002G054800 Sobic004G037401--Sobic004G207350 Sobic003G356500 Sobic003G356500 Sobic004G037401--Sobic003G356500
Octagon: transcription factors


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