Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G191400.1
Synonym Sb02g023870
Functional annotation OsFBX55 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6QCB1
Pfam PF00646
Panther DB PTHR33127 PTHR33127:SF8
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g38499.1 : F-box domain containing protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G469966 - -
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18 Sobic.003G281000 - -
19 Sobic.007G156400 Up-reguralion under drought(PubMedID : 24916767)@alpha-amylase precursor, putative, expressed K01176: AMY, amyA, alpha-amylase
20 Sobic.002G055000 bZIP transcription factor domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G191400 Sobic002G191400 Sobic001G469966 Sobic001G469966 Sobic002G191400--Sobic001G469966 Sobic007G179700 Sobic007G179700 Sobic002G191400--Sobic007G179700 Sobic004G155000 Sobic004G155000 Sobic002G191400--Sobic004G155000 Sobic009G152350 Sobic009G152350 Sobic002G191400--Sobic009G152350 Sobic008G061900 Sobic008G061900 Sobic002G191400--Sobic008G061900 Sobic007G072700 Sobic007G072700 Sobic002G191400--Sobic007G072700 Sobic004G207350 Sobic004G207350 Sobic002G191400--Sobic004G207350 Sobic003G165401 Sobic003G165401 Sobic002G191400--Sobic003G165401 Sobic008G140500 Sobic008G140500 Sobic002G191400--Sobic008G140500 Sobic001G469966--Sobic002G191400 Sobic001G469966--Sobic007G072700 Sobic007G156400 Sobic007G156400 Sobic001G469966--Sobic007G156400 Sobic001G371650 Sobic001G371650 Sobic001G469966--Sobic001G371650 Sobic004G264800 Sobic004G264800 Sobic001G469966--Sobic004G264800 Sobic001G469966--Sobic004G207350 Sobic004G282200 Sobic004G282200 Sobic001G469966--Sobic004G282200 Sobic007G032200 Sobic007G032200 Sobic001G469966--Sobic007G032200 Sobic004G037401 Sobic004G037401 Sobic001G469966--Sobic004G037401 Sobic007G179700--Sobic002G191400 Sobic007G179700--Sobic004G155000 Sobic001G352666 Sobic001G352666 Sobic007G179700--Sobic001G352666 Sobic004G019000 Sobic004G019000 Sobic007G179700--Sobic004G019000 Sobic007G179700--Sobic001G469966 Sobic009G223100 Sobic009G223100 Sobic007G179700--Sobic009G223100 Sobic007G208700 Sobic007G208700 Sobic007G179700--Sobic007G208700 Sobic007G179700--Sobic009G152350 Sobic007G179700--Sobic004G207350 Sobic004G155000--Sobic004G019000 Sobic004G155000--Sobic007G179700 Sobic004G155000--Sobic002G191400 Sobic004G155000--Sobic007G208700 Sobic004G155000--Sobic009G223100 Sobic010G257200 Sobic010G257200 Sobic004G155000--Sobic010G257200 Sobic004G155000--Sobic001G352666 Sobic004G155000--Sobic001G469966 Sobic004G155000--Sobic004G207350 Sobic009G152350--Sobic008G061900 Sobic002G202050 Sobic002G202050 Sobic009G152350--Sobic002G202050 Sobic006G247200 Sobic006G247200 Sobic009G152350--Sobic006G247200 Sobic002G344800 Sobic002G344800 Sobic009G152350--Sobic002G344800 Sobic010G143666 Sobic010G143666 Sobic009G152350--Sobic010G143666 Sobic002G014100 Sobic002G014100 Sobic009G152350--Sobic002G014100 Sobic006G049633 Sobic006G049633 Sobic008G061900--Sobic006G049633 Sobic003G229900 Sobic003G229900 Sobic008G061900--Sobic003G229900 Sobic004G296750 Sobic004G296750 Sobic008G061900--Sobic004G296750 Sobic002G055000 Sobic002G055000 Sobic008G061900--Sobic002G055000 Sobic001G480900 Sobic001G480900 Sobic008G061900--Sobic001G480900 Sobic010G011500 Sobic010G011500 Sobic008G061900--Sobic010G011500 Sobic002G266700 Sobic002G266700 Sobic008G061900--Sobic002G266700 Sobic008G030801 Sobic008G030801 Sobic008G061900--Sobic008G030801 Sobic001G297900 Sobic001G297900 Sobic008G061900--Sobic001G297900 Sobic007G072700--Sobic004G264800 Sobic007G072700--Sobic007G156400 Sobic003G253650 Sobic003G253650 Sobic007G072700--Sobic003G253650 Sobic007G072700--Sobic004G282200 Sobic007G072700--Sobic001G371650 Sobic007G072700--Sobic008G030801 Sobic007G072700--Sobic010G011500 Sobic007G072700--Sobic003G229900 Sobic007G072700--Sobic001G297900 Sobic004G207350--Sobic004G037401 Sobic003G406120 Sobic003G406120 Sobic004G207350--Sobic003G406120 Sobic009G022600 Sobic009G022600 Sobic004G207350--Sobic009G022600 Sobic005G230900 Sobic005G230900 Sobic004G207350--Sobic005G230900 Sobic006G108766 Sobic006G108766 Sobic004G207350--Sobic006G108766 Sobic001G421450 Sobic001G421450 Sobic004G207350--Sobic001G421450 Sobic007G137201 Sobic007G137201 Sobic004G207350--Sobic007G137201 Sobic003G149700 Sobic003G149700 Sobic004G207350--Sobic003G149700 Sobic001G084133 Sobic001G084133 Sobic004G207350--Sobic001G084133 Sobic003G137000 Sobic003G137000 Sobic003G165401--Sobic003G137000 Sobic003G165401--Sobic008G140500 Sobic002G069300 Sobic002G069300 Sobic003G165401--Sobic002G069300 Sobic002G124832 Sobic002G124832 Sobic003G165401--Sobic002G124832 Sobic006G142925 Sobic006G142925 Sobic003G165401--Sobic006G142925 Sobic003G165401--Sobic002G014100 Sobic003G165401--Sobic010G143666 Sobic010G192200 Sobic010G192200 Sobic003G165401--Sobic010G192200 Sobic003G281000 Sobic003G281000 Sobic003G165401--Sobic003G281000 Sobic008G140500--Sobic003G165401 Sobic008G140500--Sobic003G137000 Sobic004G020150 Sobic004G020150 Sobic008G140500--Sobic004G020150 Sobic008G140500--Sobic006G142925 Sobic004G055901 Sobic004G055901 Sobic008G140500--Sobic004G055901 Sobic008G140500--Sobic002G124832 Sobic008G140500--Sobic010G192200 Sobic009G239400 Sobic009G239400 Sobic008G140500--Sobic009G239400 Sobic008G140500--Sobic002G069300
Octagon: transcription factors


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