Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G223100.1
Synonym ATIPT1, IPT1, Sb09g027683
Functional annotation IPP transferase, putative, expressed
UniProt A0A1B6PAP1
Pfam PF01715
Panther DB PTHR11088 PTHR11088:SF32
NCBI CDD KOG1384; tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase
KEGG Orthology K10760; adenylate dimethylallyltransferase (cytokinin synthase)
Gene Ontology GO:0008033; tRNA processing


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G68460 : isopentenyltransferase 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g47840.1 : IPP transferase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a038849 , Zm00025a044474 , Zm00025a057317 , Zm00025a027984
Brachypodium PNT72608 , KQK05019
Barley HORVU1Hr1G083530.2 , HORVU1Hr1G083530.3 , HORVU1Hr1G083530.1
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G043201 - -
2 Sobic.006G148600 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR18 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed K14488: SAUR family protein
3 Sobic.003G071800 - -
4 Sobic.002G336500 OsFBLD5 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
5 Sobic.010G168100 expressed protein -
6 Sobic.002G375000 - -
7 Sobic.002G191400 OsFBX55 - F-box domain containing protein, expressed -
8 Sobic.009G152350 - -
9 Sobic.001G432750 - -
10 Sobic.002G123750 - -
11 Sobic.003G025300 lectin protein kinase family protein, putative, expressed -
12 Sobic.001G079000 - -
13 Sobic.001G510650 - -
14 Sobic.007G010400 - -
15 Sobic.001G228500 - -
16 Sobic.004G068900 cytochrome P450 71D10, putative, expressed -
17 Sobic.004G068600 cytochrome P450 71D10, putative, expressed -
18 Sobic.008G061900 - -
19 Sobic.003G337900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@transcription factor(PubMedID : 30367619)@WRKY21, expressed -
20 Sobic.001G208166 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G223100 Sobic009G223100 Sobic002G043201 Sobic002G043201 Sobic009G223100--Sobic002G043201 Sobic006G148600 Sobic006G148600 Sobic009G223100--Sobic006G148600 Sobic003G071800 Sobic003G071800 Sobic009G223100--Sobic003G071800 Sobic002G336500 Sobic002G336500 Sobic009G223100--Sobic002G336500 Sobic010G168100 Sobic010G168100 Sobic009G223100--Sobic010G168100 Sobic002G375000 Sobic002G375000 Sobic009G223100--Sobic002G375000 Sobic002G191400 Sobic002G191400 Sobic009G223100--Sobic002G191400 Sobic009G152350 Sobic009G152350 Sobic009G223100--Sobic009G152350 Sobic001G432750 Sobic001G432750 Sobic009G223100--Sobic001G432750 Sobic001G208166 Sobic001G208166 Sobic002G043201--Sobic001G208166 Sobic010G187950 Sobic010G187950 Sobic002G043201--Sobic010G187950 Sobic001G228500 Sobic001G228500 Sobic002G043201--Sobic001G228500 Sobic003G079600 Sobic003G079600 Sobic002G043201--Sobic003G079600 Sobic002G043201--Sobic010G168100 Sobic002G043201--Sobic002G336500 Sobic007G010400 Sobic007G010400 Sobic002G043201--Sobic007G010400 Sobic003G337900 Sobic003G337900 Sobic002G043201--Sobic003G337900 Sobic002G043201--Sobic003G071800 Sobic003G016950 Sobic003G016950 Sobic006G148600--Sobic003G016950 Sobic003G401700 Sobic003G401700 Sobic006G148600--Sobic003G401700 Sobic004G193350 Sobic004G193350 Sobic006G148600--Sobic004G193350 Sobic001G422432 Sobic001G422432 Sobic006G148600--Sobic001G422432 Sobic002G157050 Sobic002G157050 Sobic006G148600--Sobic002G157050 Sobic001G016050 Sobic001G016050 Sobic006G148600--Sobic001G016050 Sobic006G177500 Sobic006G177500 Sobic006G148600--Sobic006G177500 Sobic001G400601 Sobic001G400601 Sobic006G148600--Sobic001G400601 Sobic002G297100 Sobic002G297100 Sobic006G148600--Sobic002G297100 Sobic003G071800--Sobic010G168100 Sobic006G161200 Sobic006G161200 Sobic003G071800--Sobic006G161200 Sobic003G438100 Sobic003G438100 Sobic003G071800--Sobic003G438100 Sobic003G253650 Sobic003G253650 Sobic003G071800--Sobic003G253650 Sobic008G030801 Sobic008G030801 Sobic003G071800--Sobic008G030801 Sobic003G071800--Sobic001G432750 Sobic008G061900 Sobic008G061900 Sobic003G071800--Sobic008G061900 Sobic003G229900 Sobic003G229900 Sobic003G071800--Sobic003G229900 Sobic006G049633 Sobic006G049633 Sobic003G071800--Sobic006G049633 Sobic002G336500--Sobic010G168100 Sobic002G336500--Sobic007G010400 Sobic002G336500--Sobic002G043201 Sobic002G336500--Sobic010G187950 Sobic009G122000 Sobic009G122000 Sobic002G336500--Sobic009G122000 Sobic004G081300 Sobic004G081300 Sobic002G336500--Sobic004G081300 Sobic003G025300 Sobic003G025300 Sobic002G336500--Sobic003G025300 Sobic002G336500--Sobic003G438100 Sobic003G149400 Sobic003G149400 Sobic002G336500--Sobic003G149400 Sobic010G168100--Sobic003G438100 Sobic005G205100 Sobic005G205100 Sobic010G168100--Sobic005G205100 Sobic001G310000 Sobic001G310000 Sobic010G168100--Sobic001G310000 Sobic010G168100--Sobic003G337900 Sobic010G168100--Sobic006G161200 Sobic010G168100--Sobic003G071800 Sobic010G168100--Sobic008G061900 Sobic005G156201 Sobic005G156201 Sobic010G168100--Sobic005G156201 Sobic003G019500 Sobic003G019500 Sobic010G168100--Sobic003G019500 Sobic002G375000--Sobic001G432750 Sobic010G226201 Sobic010G226201 Sobic002G375000--Sobic010G226201 Sobic002G375000--Sobic003G071800 Sobic002G347750 Sobic002G347750 Sobic002G375000--Sobic002G347750 Sobic002G114200 Sobic002G114200 Sobic002G375000--Sobic002G114200 Sobic004G071850 Sobic004G071850 Sobic002G375000--Sobic004G071850 Sobic009G019400 Sobic009G019400 Sobic002G375000--Sobic009G019400 Sobic002G191450 Sobic002G191450 Sobic002G375000--Sobic002G191450 Sobic001G064400 Sobic001G064400 Sobic002G375000--Sobic001G064400 Sobic001G469966 Sobic001G469966 Sobic002G191400--Sobic001G469966 Sobic007G179700 Sobic007G179700 Sobic002G191400--Sobic007G179700 Sobic004G155000 Sobic004G155000 Sobic002G191400--Sobic004G155000 Sobic002G191400--Sobic009G152350 Sobic002G191400--Sobic008G061900 Sobic007G072700 Sobic007G072700 Sobic002G191400--Sobic007G072700 Sobic004G207350 Sobic004G207350 Sobic002G191400--Sobic004G207350 Sobic003G165401 Sobic003G165401 Sobic002G191400--Sobic003G165401 Sobic008G140500 Sobic008G140500 Sobic002G191400--Sobic008G140500 Sobic009G152350--Sobic008G061900 Sobic002G202050 Sobic002G202050 Sobic009G152350--Sobic002G202050 Sobic006G247200 Sobic006G247200 Sobic009G152350--Sobic006G247200 Sobic002G344800 Sobic002G344800 Sobic009G152350--Sobic002G344800 Sobic010G143666 Sobic010G143666 Sobic009G152350--Sobic010G143666 Sobic002G014100 Sobic002G014100 Sobic009G152350--Sobic002G014100 Sobic001G432750--Sobic002G375000 Sobic001G432750--Sobic003G071800 Sobic001G432750--Sobic010G226201 Sobic001G432750--Sobic003G229900 Sobic001G432750--Sobic002G114200 Sobic001G432750--Sobic006G049633 Sobic001G432750--Sobic009G019400 Sobic003G281000 Sobic003G281000 Sobic001G432750--Sobic003G281000 Sobic004G296750 Sobic004G296750 Sobic001G432750--Sobic004G296750
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.