Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G191350.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RJF0 , Q8LJX2
Pfam PF00079
Panther DB PTHR11461 PTHR11461:SF169
NCBI CDD -
KEGG Orthology K13963; serpin B
Gene Ontology GO:0005615; extracellular space


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G47710 : Serine protease inhibitor (SERPIN) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g12420.1 : serpin domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley HORVU3Hr1G020090.1
Wheat TraesCS4A02G427600
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G234000 expressed protein -
2 Sobic.007G064400 glycosyl transferase 8 domain containing protein, putative, expressed K18819: inositol 3-alpha-galactosyltransferase
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5 Sobic.009G041301 - -
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8 Sobic.006G011800 - -
9 Sobic.001G530400 expressed protein -
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11 Sobic.002G211501 - -
12 Sobic.003G302466 - -
13 Sobic.010G274300 ZOS6-11 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
14 Sobic.007G072700 - -
15 Sobic.002G291132 - -
16 Sobic.006G022301 - -
17 Sobic.004G264800 expressed protein -
18 Sobic.006G279000 expressed protein -
19 Sobic.002G059100 OsFBX239 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.003G231200 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G191350 Sobic005G191350 Sobic001G234000 Sobic001G234000 Sobic005G191350--Sobic001G234000 Sobic007G064400 Sobic007G064400 Sobic005G191350--Sobic007G064400 Sobic009G029900 Sobic009G029900 Sobic005G191350--Sobic009G029900 Sobic007G156400 Sobic007G156400 Sobic005G191350--Sobic007G156400 Sobic009G041301 Sobic009G041301 Sobic005G191350--Sobic009G041301 Sobic004G187200 Sobic004G187200 Sobic005G191350--Sobic004G187200 Sobic004G105300 Sobic004G105300 Sobic005G191350--Sobic004G105300 Sobic006G011800 Sobic006G011800 Sobic005G191350--Sobic006G011800 Sobic001G530400 Sobic001G530400 Sobic005G191350--Sobic001G530400 Sobic002G211501 Sobic002G211501 Sobic001G234000--Sobic002G211501 Sobic004G090300 Sobic004G090300 Sobic001G234000--Sobic004G090300 Sobic001G234000--Sobic007G064400 Sobic006G279000 Sobic006G279000 Sobic001G234000--Sobic006G279000 Sobic001G234000--Sobic004G187200 Sobic002G291132 Sobic002G291132 Sobic001G234000--Sobic002G291132 Sobic001G234000--Sobic001G530400 Sobic002G147500 Sobic002G147500 Sobic001G234000--Sobic002G147500 Sobic010G274300 Sobic010G274300 Sobic001G234000--Sobic010G274300 Sobic007G064400--Sobic001G234000 Sobic007G064400--Sobic004G187200 Sobic007G064400--Sobic004G090300 Sobic007G064400--Sobic006G279000 Sobic004G090200 Sobic004G090200 Sobic007G064400--Sobic004G090200 Sobic002G059100 Sobic002G059100 Sobic007G064400--Sobic002G059100 Sobic007G064400--Sobic007G156400 Sobic001G297300 Sobic001G297300 Sobic007G064400--Sobic001G297300 Sobic007G064400--Sobic002G147500 Sobic009G029900--Sobic004G187200 Sobic009G029900--Sobic001G530400 Sobic009G029900--Sobic001G234000 Sobic009G029900--Sobic004G090300 Sobic009G029900--Sobic006G011800 Sobic009G029900--Sobic006G279000 Sobic009G029900--Sobic007G064400 Sobic009G029900--Sobic004G090200 Sobic009G029900--Sobic009G041301 Sobic007G072700 Sobic007G072700 Sobic007G156400--Sobic007G072700 Sobic004G264800 Sobic004G264800 Sobic007G156400--Sobic004G264800 Sobic004G282200 Sobic004G282200 Sobic007G156400--Sobic004G282200 Sobic001G371650 Sobic001G371650 Sobic007G156400--Sobic001G371650 Sobic003G253650 Sobic003G253650 Sobic007G156400--Sobic003G253650 Sobic007G156400--Sobic007G064400 Sobic002G172300 Sobic002G172300 Sobic007G156400--Sobic002G172300 Sobic007G032200 Sobic007G032200 Sobic007G156400--Sobic007G032200 Sobic002G054800 Sobic002G054800 Sobic007G156400--Sobic002G054800 Sobic004G068000 Sobic004G068000 Sobic009G041301--Sobic004G068000 Sobic009G041301--Sobic001G234000 Sobic009G041301--Sobic001G530400 Sobic009G041301--Sobic009G029900 Sobic009G041301--Sobic004G105300 Sobic003G302466 Sobic003G302466 Sobic009G041301--Sobic003G302466 Sobic010G198700 Sobic010G198700 Sobic009G041301--Sobic010G198700 Sobic009G041301--Sobic004G187200 Sobic009G041301--Sobic004G090300 Sobic004G187200--Sobic001G234000 Sobic004G187200--Sobic004G090300 Sobic004G187200--Sobic009G029900 Sobic004G187200--Sobic004G090200 Sobic004G187200--Sobic002G147500 Sobic004G187200--Sobic006G279000 Sobic004G187200--Sobic007G064400 Sobic001G330600 Sobic001G330600 Sobic004G187200--Sobic001G330600 Sobic004G187200--Sobic001G530400 Sobic004G105300--Sobic010G274300 Sobic001G166500 Sobic001G166500 Sobic004G105300--Sobic001G166500 Sobic004G105300--Sobic003G302466 Sobic001G203100 Sobic001G203100 Sobic004G105300--Sobic001G203100 Sobic007G172800 Sobic007G172800 Sobic004G105300--Sobic007G172800 Sobic004G105300--Sobic002G211501 Sobic004G105300--Sobic004G068000 Sobic010G216800 Sobic010G216800 Sobic004G105300--Sobic010G216800 Sobic004G105300--Sobic002G291132 Sobic006G011800--Sobic009G029900 Sobic006G011800--Sobic004G187200 Sobic006G011800--Sobic004G090200 Sobic006G011800--Sobic004G090300 Sobic006G011800--Sobic001G234000 Sobic006G011800--Sobic001G530400 Sobic006G011800--Sobic007G064400 Sobic006G011800--Sobic005G191350 Sobic006G011800--Sobic009G041301 Sobic001G530400--Sobic002G291132 Sobic006G036201 Sobic006G036201 Sobic001G530400--Sobic006G036201 Sobic009G061800 Sobic009G061800 Sobic001G530400--Sobic009G061800 Sobic001G530400--Sobic002G211501 Sobic001G530400--Sobic004G090300 Sobic005G074900 Sobic005G074900 Sobic001G530400--Sobic005G074900 Sobic009G086800 Sobic009G086800 Sobic001G530400--Sobic009G086800 Sobic001G530400--Sobic001G234000 Sobic009G051301 Sobic009G051301 Sobic001G530400--Sobic009G051301
Octagon: transcription factors


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