Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G041301.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R1I8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g05290.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a038095
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G068000 expressed protein -
2 Sobic.001G234000 expressed protein -
3 Sobic.001G530400 expressed protein -
4 Sobic.009G029900 C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein, expressed -
5 Sobic.004G105300 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
6 Sobic.003G302466 - -
7 Sobic.010G198700 expressed protein -
8 Sobic.004G187200 ICE-like protease p20 domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.004G090300 OsFBX46 - F-box domain containing protein, expressed -
10 Sobic.002G211501 - -
11 Sobic.005G191350 - K13963: serpin B
12 Sobic.002G291132 - -
13 Sobic.007G064400 glycosyl transferase 8 domain containing protein, putative, expressed K18819: inositol 3-alpha-galactosyltransferase
14 Sobic.010G274300 ZOS6-11 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
15 Sobic.006G011800 - -
16 Sobic.006G036201 - -
17 Sobic.006G279000 expressed protein -
18 Sobic.002G381750 - K03094: SKP1, S-phase kinase-associated protein 1
19 Sobic.001G166500 gibberellin 20 oxidase 2, putative, expressed -
20 Sobic.010G216800 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic009G041301 Sobic009G041301 Sobic004G068000 Sobic004G068000 Sobic009G041301--Sobic004G068000 Sobic001G234000 Sobic001G234000 Sobic009G041301--Sobic001G234000 Sobic001G530400 Sobic001G530400 Sobic009G041301--Sobic001G530400 Sobic009G029900 Sobic009G029900 Sobic009G041301--Sobic009G029900 Sobic004G105300 Sobic004G105300 Sobic009G041301--Sobic004G105300 Sobic003G302466 Sobic003G302466 Sobic009G041301--Sobic003G302466 Sobic010G198700 Sobic010G198700 Sobic009G041301--Sobic010G198700 Sobic004G187200 Sobic004G187200 Sobic009G041301--Sobic004G187200 Sobic004G090300 Sobic004G090300 Sobic009G041301--Sobic004G090300 Sobic006G096200 Sobic006G096200 Sobic004G068000--Sobic006G096200 Sobic001G166500 Sobic001G166500 Sobic004G068000--Sobic001G166500 Sobic004G068000--Sobic004G105300 Sobic010G274300 Sobic010G274300 Sobic004G068000--Sobic010G274300 Sobic007G036600 Sobic007G036600 Sobic004G068000--Sobic007G036600 Sobic001G203100 Sobic001G203100 Sobic004G068000--Sobic001G203100 Sobic003G438700 Sobic003G438700 Sobic004G068000--Sobic003G438700 Sobic009G231500 Sobic009G231500 Sobic004G068000--Sobic009G231500 Sobic001G259300 Sobic001G259300 Sobic004G068000--Sobic001G259300 Sobic002G211501 Sobic002G211501 Sobic001G234000--Sobic002G211501 Sobic001G234000--Sobic004G090300 Sobic007G064400 Sobic007G064400 Sobic001G234000--Sobic007G064400 Sobic006G279000 Sobic006G279000 Sobic001G234000--Sobic006G279000 Sobic001G234000--Sobic004G187200 Sobic002G291132 Sobic002G291132 Sobic001G234000--Sobic002G291132 Sobic001G234000--Sobic001G530400 Sobic002G147500 Sobic002G147500 Sobic001G234000--Sobic002G147500 Sobic001G234000--Sobic010G274300 Sobic001G530400--Sobic002G291132 Sobic006G036201 Sobic006G036201 Sobic001G530400--Sobic006G036201 Sobic009G061800 Sobic009G061800 Sobic001G530400--Sobic009G061800 Sobic001G530400--Sobic002G211501 Sobic001G530400--Sobic004G090300 Sobic005G074900 Sobic005G074900 Sobic001G530400--Sobic005G074900 Sobic009G086800 Sobic009G086800 Sobic001G530400--Sobic009G086800 Sobic001G530400--Sobic001G234000 Sobic009G051301 Sobic009G051301 Sobic001G530400--Sobic009G051301 Sobic009G029900--Sobic004G187200 Sobic009G029900--Sobic001G530400 Sobic009G029900--Sobic001G234000 Sobic009G029900--Sobic004G090300 Sobic006G011800 Sobic006G011800 Sobic009G029900--Sobic006G011800 Sobic009G029900--Sobic006G279000 Sobic009G029900--Sobic007G064400 Sobic004G090200 Sobic004G090200 Sobic009G029900--Sobic004G090200 Sobic009G029900--Sobic009G041301 Sobic004G105300--Sobic010G274300 Sobic004G105300--Sobic001G166500 Sobic004G105300--Sobic003G302466 Sobic004G105300--Sobic001G203100 Sobic007G172800 Sobic007G172800 Sobic004G105300--Sobic007G172800 Sobic004G105300--Sobic002G211501 Sobic004G105300--Sobic004G068000 Sobic010G216800 Sobic010G216800 Sobic004G105300--Sobic010G216800 Sobic004G105300--Sobic002G291132 Sobic003G302466--Sobic010G274300 Sobic003G302466--Sobic004G105300 Sobic003G302466--Sobic002G211501 Sobic001G059800 Sobic001G059800 Sobic003G302466--Sobic001G059800 Sobic003G302466--Sobic007G172800 Sobic002G059100 Sobic002G059100 Sobic003G302466--Sobic002G059100 Sobic003G302466--Sobic010G216800 Sobic003G302466--Sobic001G203100 Sobic003G302466--Sobic004G068000 Sobic010G198700--Sobic009G041301 Sobic010G198700--Sobic003G302466 Sobic010G198700--Sobic004G068000 Sobic001G052900 Sobic001G052900 Sobic010G198700--Sobic001G052900 Sobic009G199300 Sobic009G199300 Sobic010G198700--Sobic009G199300 Sobic010G198700--Sobic001G234000 Sobic007G182500 Sobic007G182500 Sobic010G198700--Sobic007G182500 Sobic010G198700--Sobic009G029900 Sobic010G198700--Sobic007G064400 Sobic004G187200--Sobic001G234000 Sobic004G187200--Sobic004G090300 Sobic004G187200--Sobic009G029900 Sobic004G187200--Sobic004G090200 Sobic004G187200--Sobic002G147500 Sobic004G187200--Sobic006G279000 Sobic004G187200--Sobic007G064400 Sobic001G330600 Sobic001G330600 Sobic004G187200--Sobic001G330600 Sobic004G187200--Sobic001G530400 Sobic004G090300--Sobic006G279000 Sobic004G090300--Sobic001G234000 Sobic004G090300--Sobic002G147500 Sobic004G090300--Sobic002G291132 Sobic004G090300--Sobic001G530400 Sobic004G090300--Sobic004G187200 Sobic004G090300--Sobic002G211501 Sobic004G090300--Sobic001G330600 Sobic004G090300--Sobic006G036201
Octagon: transcription factors


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