Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G011800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PJE4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G029900 C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein, expressed -
2 Sobic.004G187200 ICE-like protease p20 domain containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.004G090200 OsFBX46 - F-box domain containing protein, expressed -
4 Sobic.004G090300 OsFBX46 - F-box domain containing protein, expressed -
5 Sobic.001G234000 expressed protein -
6 Sobic.001G530400 expressed protein -
7 Sobic.007G064400 glycosyl transferase 8 domain containing protein, putative, expressed K18819: inositol 3-alpha-galactosyltransferase
8 Sobic.005G191350 - K13963: serpin B
9 Sobic.009G041301 - -
10 Sobic.006G279000 expressed protein -
11 Sobic.002G147500 early fruit mRNA, putative, expressed -
12 Sobic.002G291132 - -
13 Sobic.002G211501 - -
14 Sobic.006G036201 - -
15 Sobic.001G330600 NAD dependent epimerase/dehydratase family protein, putative, expressed -
16 Sobic.001G313100 CAMK_CAMK_like.8 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K13412: calcium-dependent protein kinase
17 Sobic.007G060550 - -
18 Sobic.009G086800 no apical meristem protein, putative, expressed -
19 Sobic.004G105300 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
20 Sobic.008G140500 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic006G011800 Sobic006G011800 Sobic009G029900 Sobic009G029900 Sobic006G011800--Sobic009G029900 Sobic004G187200 Sobic004G187200 Sobic006G011800--Sobic004G187200 Sobic004G090200 Sobic004G090200 Sobic006G011800--Sobic004G090200 Sobic004G090300 Sobic004G090300 Sobic006G011800--Sobic004G090300 Sobic001G234000 Sobic001G234000 Sobic006G011800--Sobic001G234000 Sobic001G530400 Sobic001G530400 Sobic006G011800--Sobic001G530400 Sobic007G064400 Sobic007G064400 Sobic006G011800--Sobic007G064400 Sobic005G191350 Sobic005G191350 Sobic006G011800--Sobic005G191350 Sobic009G041301 Sobic009G041301 Sobic006G011800--Sobic009G041301 Sobic009G029900--Sobic004G187200 Sobic009G029900--Sobic001G530400 Sobic009G029900--Sobic001G234000 Sobic009G029900--Sobic004G090300 Sobic009G029900--Sobic006G011800 Sobic006G279000 Sobic006G279000 Sobic009G029900--Sobic006G279000 Sobic009G029900--Sobic007G064400 Sobic009G029900--Sobic004G090200 Sobic009G029900--Sobic009G041301 Sobic004G187200--Sobic001G234000 Sobic004G187200--Sobic004G090300 Sobic004G187200--Sobic009G029900 Sobic004G187200--Sobic004G090200 Sobic002G147500 Sobic002G147500 Sobic004G187200--Sobic002G147500 Sobic004G187200--Sobic006G279000 Sobic004G187200--Sobic007G064400 Sobic001G330600 Sobic001G330600 Sobic004G187200--Sobic001G330600 Sobic004G187200--Sobic001G530400 Sobic004G090200--Sobic001G330600 Sobic004G090200--Sobic002G147500 Sobic005G052100 Sobic005G052100 Sobic004G090200--Sobic005G052100 Sobic004G090200--Sobic004G187200 Sobic004G090200--Sobic006G279000 Sobic009G013200 Sobic009G013200 Sobic004G090200--Sobic009G013200 Sobic001G112350 Sobic001G112350 Sobic004G090200--Sobic001G112350 Sobic007G069800 Sobic007G069800 Sobic004G090200--Sobic007G069800 Sobic004G090200--Sobic004G090300 Sobic004G090300--Sobic006G279000 Sobic004G090300--Sobic001G234000 Sobic004G090300--Sobic002G147500 Sobic002G291132 Sobic002G291132 Sobic004G090300--Sobic002G291132 Sobic004G090300--Sobic001G530400 Sobic004G090300--Sobic004G187200 Sobic002G211501 Sobic002G211501 Sobic004G090300--Sobic002G211501 Sobic004G090300--Sobic001G330600 Sobic006G036201 Sobic006G036201 Sobic004G090300--Sobic006G036201 Sobic001G234000--Sobic002G211501 Sobic001G234000--Sobic004G090300 Sobic001G234000--Sobic007G064400 Sobic001G234000--Sobic006G279000 Sobic001G234000--Sobic004G187200 Sobic001G234000--Sobic002G291132 Sobic001G234000--Sobic001G530400 Sobic001G234000--Sobic002G147500 Sobic010G274300 Sobic010G274300 Sobic001G234000--Sobic010G274300 Sobic001G530400--Sobic002G291132 Sobic001G530400--Sobic006G036201 Sobic009G061800 Sobic009G061800 Sobic001G530400--Sobic009G061800 Sobic001G530400--Sobic002G211501 Sobic001G530400--Sobic004G090300 Sobic005G074900 Sobic005G074900 Sobic001G530400--Sobic005G074900 Sobic009G086800 Sobic009G086800 Sobic001G530400--Sobic009G086800 Sobic001G530400--Sobic001G234000 Sobic009G051301 Sobic009G051301 Sobic001G530400--Sobic009G051301 Sobic007G064400--Sobic001G234000 Sobic007G064400--Sobic004G187200 Sobic007G064400--Sobic004G090300 Sobic007G064400--Sobic006G279000 Sobic007G064400--Sobic004G090200 Sobic002G059100 Sobic002G059100 Sobic007G064400--Sobic002G059100 Sobic007G156400 Sobic007G156400 Sobic007G064400--Sobic007G156400 Sobic001G297300 Sobic001G297300 Sobic007G064400--Sobic001G297300 Sobic007G064400--Sobic002G147500 Sobic005G191350--Sobic001G234000 Sobic005G191350--Sobic007G064400 Sobic005G191350--Sobic009G029900 Sobic005G191350--Sobic007G156400 Sobic005G191350--Sobic009G041301 Sobic005G191350--Sobic004G187200 Sobic004G105300 Sobic004G105300 Sobic005G191350--Sobic004G105300 Sobic005G191350--Sobic006G011800 Sobic005G191350--Sobic001G530400 Sobic004G068000 Sobic004G068000 Sobic009G041301--Sobic004G068000 Sobic009G041301--Sobic001G234000 Sobic009G041301--Sobic001G530400 Sobic009G041301--Sobic009G029900 Sobic009G041301--Sobic004G105300 Sobic003G302466 Sobic003G302466 Sobic009G041301--Sobic003G302466 Sobic010G198700 Sobic010G198700 Sobic009G041301--Sobic010G198700 Sobic009G041301--Sobic004G187200 Sobic009G041301--Sobic004G090300
Octagon: transcription factors


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