Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G332300.1
Synonym Sb03g037750, WRI1, WRI, ASML1, ATWRI1
Functional annotation AP2 domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6Q6N9
Pfam PF00847
Panther DB PTHR32467 PTHR32467:SF34
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006355; regulation of transcription, DNA-templated GO:0003700DNA-binding transcription factor activity GO:0007275multicellular organism development


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G54320 : Integrase-type DNA-binding superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g03540.1 : AP2 domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a027124
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G332300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G055901 - -
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10 Sobic.003G229900 - -
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13 Sobic.004G264800 expressed protein -
14 Sobic.010G246300 Zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
15 Sobic.004G020150 - -
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18 Sobic.001G310000 - -
19 Sobic.006G049633 - -
20 Sobic.001G242400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G332300 Sobic003G332300 Sobic004G055901 Sobic004G055901 Sobic003G332300--Sobic004G055901 Sobic010G192200 Sobic010G192200 Sobic003G332300--Sobic010G192200 Sobic004G221800 Sobic004G221800 Sobic003G332300--Sobic004G221800 Sobic003G165401 Sobic003G165401 Sobic003G332300--Sobic003G165401 Sobic003G137000 Sobic003G137000 Sobic003G332300--Sobic003G137000 Sobic002G057700 Sobic002G057700 Sobic003G332300--Sobic002G057700 Sobic008G140500 Sobic008G140500 Sobic003G332300--Sobic008G140500 Sobic007G072700 Sobic007G072700 Sobic003G332300--Sobic007G072700 Sobic001G308900 Sobic001G308900 Sobic003G332300--Sobic001G308900 Sobic004G055901--Sobic010G192200 Sobic004G055901--Sobic002G057700 Sobic004G055901--Sobic008G140500 Sobic004G055901--Sobic003G165401 Sobic004G055901--Sobic003G137000 Sobic002G124832 Sobic002G124832 Sobic004G055901--Sobic002G124832 Sobic010G133275 Sobic010G133275 Sobic004G055901--Sobic010G133275 Sobic002G069300 Sobic002G069300 Sobic004G055901--Sobic002G069300 Sobic005G179900 Sobic005G179900 Sobic004G055901--Sobic005G179900 Sobic010G192200--Sobic004G055901 Sobic010G192200--Sobic002G057700 Sobic010G192200--Sobic003G165401 Sobic010G192200--Sobic008G140500 Sobic010G192200--Sobic003G137000 Sobic010G192200--Sobic010G133275 Sobic010G192200--Sobic005G179900 Sobic010G192200--Sobic002G124832 Sobic002G344800 Sobic002G344800 Sobic010G192200--Sobic002G344800 Sobic009G043800 Sobic009G043800 Sobic004G221800--Sobic009G043800 Sobic001G064400 Sobic001G064400 Sobic004G221800--Sobic001G064400 Sobic002G191450 Sobic002G191450 Sobic004G221800--Sobic002G191450 Sobic003G229900 Sobic003G229900 Sobic004G221800--Sobic003G229900 Sobic002G114200 Sobic002G114200 Sobic004G221800--Sobic002G114200 Sobic007G007100 Sobic007G007100 Sobic004G221800--Sobic007G007100 Sobic006G049633 Sobic006G049633 Sobic004G221800--Sobic006G049633 Sobic006G037500 Sobic006G037500 Sobic004G221800--Sobic006G037500 Sobic009G019400 Sobic009G019400 Sobic004G221800--Sobic009G019400 Sobic003G165401--Sobic003G137000 Sobic003G165401--Sobic008G140500 Sobic003G165401--Sobic002G069300 Sobic003G165401--Sobic002G124832 Sobic006G142925 Sobic006G142925 Sobic003G165401--Sobic006G142925 Sobic002G014100 Sobic002G014100 Sobic003G165401--Sobic002G014100 Sobic010G143666 Sobic010G143666 Sobic003G165401--Sobic010G143666 Sobic003G165401--Sobic010G192200 Sobic003G281000 Sobic003G281000 Sobic003G165401--Sobic003G281000 Sobic003G137000--Sobic003G165401 Sobic003G137000--Sobic002G124832 Sobic003G137000--Sobic002G069300 Sobic003G137000--Sobic002G014100 Sobic003G137000--Sobic010G143666 Sobic003G137000--Sobic003G281000 Sobic003G137000--Sobic006G142925 Sobic003G137000--Sobic008G140500 Sobic003G137000--Sobic002G344800 Sobic002G057700--Sobic005G179900 Sobic002G057700--Sobic010G192200 Sobic002G057700--Sobic004G055901 Sobic002G057700--Sobic010G133275 Sobic002G057700--Sobic003G165401 Sobic002G057700--Sobic008G140500 Sobic002G057700--Sobic003G137000 Sobic002G057700--Sobic002G344800 Sobic003G137500 Sobic003G137500 Sobic002G057700--Sobic003G137500 Sobic008G140500--Sobic003G165401 Sobic008G140500--Sobic003G137000 Sobic004G020150 Sobic004G020150 Sobic008G140500--Sobic004G020150 Sobic008G140500--Sobic006G142925 Sobic008G140500--Sobic004G055901 Sobic008G140500--Sobic002G124832 Sobic008G140500--Sobic010G192200 Sobic009G239400 Sobic009G239400 Sobic008G140500--Sobic009G239400 Sobic008G140500--Sobic002G069300 Sobic004G264800 Sobic004G264800 Sobic007G072700--Sobic004G264800 Sobic007G156400 Sobic007G156400 Sobic007G072700--Sobic007G156400 Sobic003G253650 Sobic003G253650 Sobic007G072700--Sobic003G253650 Sobic004G282200 Sobic004G282200 Sobic007G072700--Sobic004G282200 Sobic001G371650 Sobic001G371650 Sobic007G072700--Sobic001G371650 Sobic008G030801 Sobic008G030801 Sobic007G072700--Sobic008G030801 Sobic010G011500 Sobic010G011500 Sobic007G072700--Sobic010G011500 Sobic007G072700--Sobic003G229900 Sobic001G297900 Sobic001G297900 Sobic007G072700--Sobic001G297900 Sobic001G308900--Sobic008G030801 Sobic001G308900--Sobic003G229900 Sobic001G308900--Sobic006G049633 Sobic002G172300 Sobic002G172300 Sobic001G308900--Sobic002G172300 Sobic002G055000 Sobic002G055000 Sobic001G308900--Sobic002G055000 Sobic002G266700 Sobic002G266700 Sobic001G308900--Sobic002G266700 Sobic001G308900--Sobic001G297900 Sobic001G308900--Sobic010G011500 Sobic006G161200 Sobic006G161200 Sobic001G308900--Sobic006G161200
Octagon: transcription factors


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