Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G242400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QKQ2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G229900 - -
2 Sobic.006G049633 - -
3 Sobic.001G273950 - -
4 Sobic.006G141200 - -
5 Sobic.008G030801 - -
6 Sobic.007G007100 expressed protein -
7 Sobic.006G161200 cysteine-rich repeat secretory protein precursor, putative, expressed -
8 Sobic.010G215201 - -
9 Sobic.004G221800 DUF584 domain containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.009G169300 expressed protein -
11 Sobic.008G061900 - -
12 Sobic.010G090850 - -
13 Sobic.003G245000 expressed protein -
14 Sobic.003G253650 - -
15 Sobic.002G055000 bZIP transcription factor domain containing protein, expressed -
16 Sobic.001G071500 - -
17 Sobic.001G308900 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K15691: E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3
18 Sobic.002G266700 - -
19 Sobic.001G480900 glyoxalase family protein, putative, expressed -
20 Sobic.009G019400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G242400 Sobic001G242400 Sobic003G229900 Sobic003G229900 Sobic001G242400--Sobic003G229900 Sobic006G049633 Sobic006G049633 Sobic001G242400--Sobic006G049633 Sobic001G273950 Sobic001G273950 Sobic001G242400--Sobic001G273950 Sobic006G141200 Sobic006G141200 Sobic001G242400--Sobic006G141200 Sobic008G030801 Sobic008G030801 Sobic001G242400--Sobic008G030801 Sobic007G007100 Sobic007G007100 Sobic001G242400--Sobic007G007100 Sobic006G161200 Sobic006G161200 Sobic001G242400--Sobic006G161200 Sobic010G215201 Sobic010G215201 Sobic001G242400--Sobic010G215201 Sobic004G221800 Sobic004G221800 Sobic001G242400--Sobic004G221800 Sobic003G229900--Sobic006G049633 Sobic002G055000 Sobic002G055000 Sobic003G229900--Sobic002G055000 Sobic010G011500 Sobic010G011500 Sobic003G229900--Sobic010G011500 Sobic001G480900 Sobic001G480900 Sobic003G229900--Sobic001G480900 Sobic002G266700 Sobic002G266700 Sobic003G229900--Sobic002G266700 Sobic004G296750 Sobic004G296750 Sobic003G229900--Sobic004G296750 Sobic008G061900 Sobic008G061900 Sobic003G229900--Sobic008G061900 Sobic003G229900--Sobic007G007100 Sobic009G019400 Sobic009G019400 Sobic003G229900--Sobic009G019400 Sobic006G049633--Sobic003G229900 Sobic006G049633--Sobic002G055000 Sobic006G049633--Sobic004G296750 Sobic006G049633--Sobic001G480900 Sobic006G049633--Sobic002G266700 Sobic006G049633--Sobic010G011500 Sobic006G049633--Sobic008G061900 Sobic003G281000 Sobic003G281000 Sobic006G049633--Sobic003G281000 Sobic006G049633--Sobic007G007100 Sobic001G273950--Sobic006G161200 Sobic001G273950--Sobic008G030801 Sobic001G273950--Sobic006G141200 Sobic001G071500 Sobic001G071500 Sobic001G273950--Sobic001G071500 Sobic006G049000 Sobic006G049000 Sobic001G273950--Sobic006G049000 Sobic001G273950--Sobic003G229900 Sobic001G273950--Sobic006G049633 Sobic001G273950--Sobic010G215201 Sobic002G054800 Sobic002G054800 Sobic001G273950--Sobic002G054800 Sobic003G149700 Sobic003G149700 Sobic006G141200--Sobic003G149700 Sobic002G132201 Sobic002G132201 Sobic006G141200--Sobic002G132201 Sobic006G141200--Sobic002G054800 Sobic006G141200--Sobic001G071500 Sobic006G141200--Sobic001G273950 Sobic003G245000 Sobic003G245000 Sobic006G141200--Sobic003G245000 Sobic005G073300 Sobic005G073300 Sobic006G141200--Sobic005G073300 Sobic006G141200--Sobic010G215201 Sobic003G253650 Sobic003G253650 Sobic006G141200--Sobic003G253650 Sobic008G030801--Sobic001G071500 Sobic008G030801--Sobic010G011500 Sobic001G297900 Sobic001G297900 Sobic008G030801--Sobic001G297900 Sobic008G030801--Sobic002G055000 Sobic008G030801--Sobic010G215201 Sobic008G030801--Sobic001G480900 Sobic008G030801--Sobic003G229900 Sobic008G030801--Sobic006G049633 Sobic008G030801--Sobic002G054800 Sobic007G007100--Sobic006G049633 Sobic007G007100--Sobic003G229900 Sobic007G007100--Sobic002G266700 Sobic007G007100--Sobic002G055000 Sobic007G007100--Sobic004G296750 Sobic007G007100--Sobic008G061900 Sobic007G007100--Sobic001G480900 Sobic007G007100--Sobic010G011500 Sobic007G007100--Sobic001G297900 Sobic006G161200--Sobic008G030801 Sobic006G161200--Sobic003G229900 Sobic006G161200--Sobic001G273950 Sobic006G161200--Sobic006G049633 Sobic006G161200--Sobic002G055000 Sobic006G161200--Sobic010G011500 Sobic006G161200--Sobic008G061900 Sobic006G161200--Sobic010G215201 Sobic005G205100 Sobic005G205100 Sobic006G161200--Sobic005G205100 Sobic010G215201--Sobic002G054800 Sobic010G215201--Sobic001G071500 Sobic002G240200 Sobic002G240200 Sobic010G215201--Sobic002G240200 Sobic010G215201--Sobic005G073300 Sobic010G215201--Sobic008G030801 Sobic010G215201--Sobic002G132201 Sobic002G172300 Sobic002G172300 Sobic010G215201--Sobic002G172300 Sobic001G371650 Sobic001G371650 Sobic010G215201--Sobic001G371650 Sobic001G421100 Sobic001G421100 Sobic010G215201--Sobic001G421100 Sobic009G043800 Sobic009G043800 Sobic004G221800--Sobic009G043800 Sobic001G064400 Sobic001G064400 Sobic004G221800--Sobic001G064400 Sobic002G191450 Sobic002G191450 Sobic004G221800--Sobic002G191450 Sobic004G221800--Sobic003G229900 Sobic002G114200 Sobic002G114200 Sobic004G221800--Sobic002G114200 Sobic004G221800--Sobic007G007100 Sobic004G221800--Sobic006G049633 Sobic006G037500 Sobic006G037500 Sobic004G221800--Sobic006G037500 Sobic004G221800--Sobic009G019400
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.