Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G080300.1
Synonym BPM2, Sb07g006440, ATBPM2
Functional annotation MBTB20 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed
UniProt A0A1B6PGD8
Pfam PF00651
Panther DB PTHR26379 PTHR26379:SF157
NCBI CDD -
KEGG Orthology K10523; speckle-type POZ protein
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G06190 : BTB-POZ and MATH domain 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g13000.1 : MBTB20 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic007G080300 Sobic007G080300 Sobic010G022900 Sobic010G022900 Sobic007G080300--Sobic010G022900 Sobic005G110448 Sobic005G110448 Sobic007G080300--Sobic005G110448 Sobic003G137500 Sobic003G137500 Sobic007G080300--Sobic003G137500 Sobic006G077800 Sobic006G077800 Sobic007G080300--Sobic006G077800 Sobic003G010000 Sobic003G010000 Sobic007G080300--Sobic003G010000 Sobic010G119100 Sobic010G119100 Sobic007G080300--Sobic010G119100 Sobic007G024100 Sobic007G024100 Sobic007G080300--Sobic007G024100 Sobic003G167566 Sobic003G167566 Sobic007G080300--Sobic003G167566 Sobic010G008200 Sobic010G008200 Sobic007G080300--Sobic010G008200 Sobic010G022900--Sobic003G010000 Sobic003G179300 Sobic003G179300 Sobic010G022900--Sobic003G179300 Sobic003G330800 Sobic003G330800 Sobic010G022900--Sobic003G330800 Sobic007G040900 Sobic007G040900 Sobic010G022900--Sobic007G040900 Sobic010G022900--Sobic003G167566 Sobic006G144201 Sobic006G144201 Sobic010G022900--Sobic006G144201 Sobic010G258900 Sobic010G258900 Sobic010G022900--Sobic010G258900 Sobic008G070100 Sobic008G070100 Sobic010G022900--Sobic008G070100 Sobic005G174800 Sobic005G174800 Sobic010G022900--Sobic005G174800 Sobic005G110448--Sobic010G022900 Sobic005G110448--Sobic010G008200 Sobic005G110448--Sobic003G167566 Sobic008G069600 Sobic008G069600 Sobic005G110448--Sobic008G069600 Sobic005G110448--Sobic007G024100 Sobic005G141400 Sobic005G141400 Sobic005G110448--Sobic005G141400 Sobic010G011300 Sobic010G011300 Sobic005G110448--Sobic010G011300 Sobic008G071550 Sobic008G071550 Sobic005G110448--Sobic008G071550 Sobic005G213900 Sobic005G213900 Sobic005G110448--Sobic005G213900 Sobic003G137500--Sobic007G080300 Sobic007G127900 Sobic007G127900 Sobic003G137500--Sobic007G127900 Sobic004G102600 Sobic004G102600 Sobic003G137500--Sobic004G102600 Sobic005G179900 Sobic005G179900 Sobic003G137500--Sobic005G179900 Sobic002G057700 Sobic002G057700 Sobic003G137500--Sobic002G057700 Sobic001G328350 Sobic001G328350 Sobic003G137500--Sobic001G328350 Sobic008G069100 Sobic008G069100 Sobic003G137500--Sobic008G069100 Sobic009G239400 Sobic009G239400 Sobic003G137500--Sobic009G239400 Sobic003G137500--Sobic006G077800 Sobic004G126900 Sobic004G126900 Sobic006G077800--Sobic004G126900 Sobic004G090500 Sobic004G090500 Sobic006G077800--Sobic004G090500 Sobic008G012000 Sobic008G012000 Sobic006G077800--Sobic008G012000 Sobic007G024000 Sobic007G024000 Sobic006G077800--Sobic007G024000 Sobic008G069200 Sobic008G069200 Sobic006G077800--Sobic008G069200 Sobic007G083900 Sobic007G083900 Sobic006G077800--Sobic007G083900 Sobic010G137600 Sobic010G137600 Sobic006G077800--Sobic010G137600 Sobic001G443500 Sobic001G443500 Sobic006G077800--Sobic001G443500 Sobic001G029700 Sobic001G029700 Sobic006G077800--Sobic001G029700 Sobic003G010000--Sobic006G144201 Sobic003G010000--Sobic003G179300 Sobic003G010000--Sobic008G070100 Sobic003G010000--Sobic005G174800 Sobic005G058400 Sobic005G058400 Sobic003G010000--Sobic005G058400 Sobic004G048300 Sobic004G048300 Sobic003G010000--Sobic004G048300 Sobic003G010000--Sobic003G330800 Sobic003G010000--Sobic008G069600 Sobic004G316200 Sobic004G316200 Sobic003G010000--Sobic004G316200 Sobic007G109000 Sobic007G109000 Sobic010G119100--Sobic007G109000 Sobic005G074700 Sobic005G074700 Sobic010G119100--Sobic005G074700 Sobic005G152932 Sobic005G152932 Sobic010G119100--Sobic005G152932 Sobic007G047000 Sobic007G047000 Sobic010G119100--Sobic007G047000 Sobic009G039000 Sobic009G039000 Sobic010G119100--Sobic009G039000 Sobic004G017700 Sobic004G017700 Sobic010G119100--Sobic004G017700 Sobic010G233500 Sobic010G233500 Sobic010G119100--Sobic010G233500 Sobic005G148700 Sobic005G148700 Sobic010G119100--Sobic005G148700 Sobic002G345600 Sobic002G345600 Sobic010G119100--Sobic002G345600 Sobic003G245500 Sobic003G245500 Sobic007G024100--Sobic003G245500 Sobic005G152700 Sobic005G152700 Sobic007G024100--Sobic005G152700 Sobic002G053201 Sobic002G053201 Sobic007G024100--Sobic002G053201 Sobic002G094900 Sobic002G094900 Sobic007G024100--Sobic002G094900 Sobic009G078600 Sobic009G078600 Sobic007G024100--Sobic009G078600 Sobic008G182200 Sobic008G182200 Sobic007G024100--Sobic008G182200 Sobic002G162200 Sobic002G162200 Sobic007G024100--Sobic002G162200 Sobic008G071200 Sobic008G071200 Sobic007G024100--Sobic008G071200 Sobic008G073800 Sobic008G073800 Sobic007G024100--Sobic008G073800 Sobic003G167566--Sobic005G058400 Sobic003G167566--Sobic010G008200 Sobic003G167566--Sobic005G213900 Sobic003G167566--Sobic005G141400 Sobic003G167566--Sobic008G069600 Sobic003G167566--Sobic005G174800 Sobic003G167566--Sobic010G011300 Sobic003G238900 Sobic003G238900 Sobic003G167566--Sobic003G238900 Sobic003G207800 Sobic003G207800 Sobic003G167566--Sobic003G207800 Sobic010G008200--Sobic010G011300 Sobic010G008200--Sobic005G141400 Sobic010G008200--Sobic005G213900 Sobic010G008200--Sobic008G071550 Sobic010G008200--Sobic005G058400 Sobic010G008200--Sobic003G167566 Sobic010G008200--Sobic009G078600 Sobic010G008200--Sobic008G069600 Sobic010G008200--Sobic003G207800
Octagon: transcription factors


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