Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G083900.1
Synonym Sb07g006880, NGA1
Functional annotation B3 DNA binding domain containing protein, expressed
UniProt C5YJ24
Pfam PF02362
Panther DB PTHR31140 PTHR31140:SF19
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0003677; DNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G46870 : AP2/B3-like transcriptional factor family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g45850.1 : B3 DNA binding domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G012000 - -
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18 Sobic.003G179300 DEF9 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
19 Sobic.005G150000 - -
20 Sobic.002G098100 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G083900 Sobic007G083900 Sobic008G012000 Sobic008G012000 Sobic007G083900--Sobic008G012000 Sobic004G090500 Sobic004G090500 Sobic007G083900--Sobic004G090500 Sobic009G020000 Sobic009G020000 Sobic007G083900--Sobic009G020000 Sobic010G258900 Sobic010G258900 Sobic007G083900--Sobic010G258900 Sobic007G040900 Sobic007G040900 Sobic007G083900--Sobic007G040900 Sobic003G099800 Sobic003G099800 Sobic007G083900--Sobic003G099800 Sobic002G164866 Sobic002G164866 Sobic007G083900--Sobic002G164866 Sobic003G129100 Sobic003G129100 Sobic007G083900--Sobic003G129100 Sobic003G139400 Sobic003G139400 Sobic007G083900--Sobic003G139400 Sobic008G012000--Sobic004G090500 Sobic008G012000--Sobic007G083900 Sobic007G024000 Sobic007G024000 Sobic008G012000--Sobic007G024000 Sobic008G068850 Sobic008G068850 Sobic008G012000--Sobic008G068850 Sobic008G069200 Sobic008G069200 Sobic008G012000--Sobic008G069200 Sobic005G058500 Sobic005G058500 Sobic008G012000--Sobic005G058500 Sobic008G012000--Sobic009G020000 Sobic008G068900 Sobic008G068900 Sobic008G012000--Sobic008G068900 Sobic008G188200 Sobic008G188200 Sobic008G012000--Sobic008G188200 Sobic004G090500--Sobic008G012000 Sobic004G090500--Sobic008G069200 Sobic004G090500--Sobic007G083900 Sobic004G090500--Sobic007G024000 Sobic004G090500--Sobic008G188200 Sobic004G090500--Sobic005G058500 Sobic004G090500--Sobic009G020000 Sobic004G090500--Sobic008G068850 Sobic004G354500 Sobic004G354500 Sobic004G090500--Sobic004G354500 Sobic004G114700 Sobic004G114700 Sobic009G020000--Sobic004G114700 Sobic004G316300 Sobic004G316300 Sobic009G020000--Sobic004G316300 Sobic005G150000 Sobic005G150000 Sobic009G020000--Sobic005G150000 Sobic005G052200 Sobic005G052200 Sobic009G020000--Sobic005G052200 Sobic009G020000--Sobic003G099800 Sobic002G098100 Sobic002G098100 Sobic009G020000--Sobic002G098100 Sobic005G148201 Sobic005G148201 Sobic009G020000--Sobic005G148201 Sobic004G008700 Sobic004G008700 Sobic009G020000--Sobic004G008700 Sobic009G020000--Sobic007G083900 Sobic008G182100 Sobic008G182100 Sobic010G258900--Sobic008G182100 Sobic003G330800 Sobic003G330800 Sobic010G258900--Sobic003G330800 Sobic003G179300 Sobic003G179300 Sobic010G258900--Sobic003G179300 Sobic010G191301 Sobic010G191301 Sobic010G258900--Sobic010G191301 Sobic002G332500 Sobic002G332500 Sobic010G258900--Sobic002G332500 Sobic010G258900--Sobic007G040900 Sobic004G316200 Sobic004G316200 Sobic010G258900--Sobic004G316200 Sobic008G070100 Sobic008G070100 Sobic010G258900--Sobic008G070100 Sobic010G258900--Sobic003G139400 Sobic007G040900--Sobic003G179300 Sobic007G040900--Sobic010G258900 Sobic007G040900--Sobic008G182100 Sobic004G048300 Sobic004G048300 Sobic007G040900--Sobic004G048300 Sobic007G040900--Sobic008G070100 Sobic007G040900--Sobic003G330800 Sobic007G040900--Sobic004G316200 Sobic003G010000 Sobic003G010000 Sobic007G040900--Sobic003G010000 Sobic007G040900--Sobic003G099800 Sobic003G099800--Sobic004G008700 Sobic003G099800--Sobic002G098100 Sobic003G099800--Sobic009G020000 Sobic003G099800--Sobic007G040900 Sobic003G099800--Sobic004G114700 Sobic003G099800--Sobic005G052200 Sobic003G099800--Sobic004G316300 Sobic003G099800--Sobic010G258900 Sobic003G099800--Sobic005G150000 Sobic002G164866--Sobic003G129100 Sobic002G164866--Sobic003G139400 Sobic002G164866--Sobic002G332500 Sobic002G164866--Sobic010G191301 Sobic002G164866--Sobic008G182100 Sobic002G164866--Sobic010G258900 Sobic002G164866--Sobic003G330800 Sobic002G164866--Sobic004G316200 Sobic002G164866--Sobic003G099800 Sobic003G129100--Sobic002G164866 Sobic003G129100--Sobic003G139400 Sobic003G129100--Sobic002G332500 Sobic003G129100--Sobic010G191301 Sobic003G129100--Sobic008G182100 Sobic003G129100--Sobic010G258900 Sobic003G129100--Sobic003G330800 Sobic003G129100--Sobic004G316200 Sobic003G129100--Sobic003G099800 Sobic003G139400--Sobic003G129100 Sobic003G139400--Sobic002G164866 Sobic003G139400--Sobic002G332500 Sobic003G139400--Sobic010G191301 Sobic003G139400--Sobic008G182100 Sobic003G139400--Sobic010G258900 Sobic003G139400--Sobic003G330800 Sobic003G139400--Sobic004G316200 Sobic003G139400--Sobic003G099800
Octagon: transcription factors


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