Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G139400.1
Synonym
Functional annotation zinc knuckle domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6Q327
Pfam -
Panther DB PTHR22639 PTHR22639:SF44
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g40490.1 : zinc knuckle domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G129100 MYB family transcription factor, putative, expressed -
2 Sobic.002G164866 - -
3 Sobic.002G332500 - -
4 Sobic.010G191301 - -
5 Sobic.008G182100 - -
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7 Sobic.003G330800 LTPL29 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
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9 Sobic.003G099800 expressed protein -
10 Sobic.008G068900 expressed protein -
11 Sobic.007G040900 expressed protein -
12 Sobic.003G179300 DEF9 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
13 Sobic.007G083900 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
14 Sobic.008G068850 - -
15 Sobic.006G034900 homeobox and START domains containing protein, putative, expressed K09338: homeobox-leucine zipper protein
16 Sobic.008G070100 CRP7 - Cysteine-rich family protein precursor, expressed -
17 Sobic.008G068450 - -
18 Sobic.004G048300 - -
19 Sobic.002G098100 - -
20 Sobic.009G020000 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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