Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G034900.2,Sobic.006G034900.5,Sobic.006G034900.6,Sobic.006G034900.3,Sobic.006G034900.1,Sobic.006G034900.4
Synonym AHDP, Sb06g004510, ANL2
Functional annotation homeobox and START domains containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RCT8 , A0A1Z5RD06 , A0A1Z5RC05 , A0A1B6PJU6
Pfam PF00046 PF01852
Panther DB PTHR24326 PTHR24326:SF258
NCBI CDD KOG0490; Transcription factor, contains HOX domain
KEGG Orthology K09338; homeobox-leucine zipper protein
Gene Ontology GO:0003677; DNA binding GO:0008289lipid binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G61150 : homeodomain GLABROUS 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g35760.2 : homeobox and START domains containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G068900 expressed protein -
2 Sobic.008G068850 - -
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11 Sobic.002G164866 - -
12 Sobic.003G129100 MYB family transcription factor, putative, expressed -
13 Sobic.003G139400 zinc knuckle domain containing protein, expressed -
14 Sobic.002G098100 - -
15 Sobic.007G196100 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein, expressed K11844: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16/45
16 Sobic.010G119200 tentative name(PubMedID : 31536532)@histone-like transcription factor and archaeal histone, putative, expressed -
17 Sobic.004G114700 - -
18 Sobic.003G099800 expressed protein -
19 Sobic.005G058500 - -
20 Sobic.005G148100 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G034900 Sobic006G034900 Sobic008G068900 Sobic008G068900 Sobic006G034900--Sobic008G068900 Sobic008G068850 Sobic008G068850 Sobic006G034900--Sobic008G068850 Sobic008G068450 Sobic008G068450 Sobic006G034900--Sobic008G068450 Sobic005G148201 Sobic005G148201 Sobic006G034900--Sobic005G148201 Sobic005G150000 Sobic005G150000 Sobic006G034900--Sobic005G150000 Sobic004G132200 Sobic004G132200 Sobic006G034900--Sobic004G132200 Sobic005G146000 Sobic005G146000 Sobic006G034900--Sobic005G146000 Sobic004G316300 Sobic004G316300 Sobic006G034900--Sobic004G316300 Sobic004G076900 Sobic004G076900 Sobic006G034900--Sobic004G076900 Sobic008G068900--Sobic006G034900 Sobic008G068900--Sobic008G068850 Sobic008G068900--Sobic008G068450 Sobic008G068900--Sobic005G148201 Sobic008G068900--Sobic005G150000 Sobic008G068900--Sobic004G132200 Sobic008G068900--Sobic004G316300 Sobic008G068900--Sobic005G146000 Sobic002G164866 Sobic002G164866 Sobic008G068900--Sobic002G164866 Sobic008G068850--Sobic006G034900 Sobic008G068850--Sobic008G068900 Sobic008G068850--Sobic008G068450 Sobic008G068850--Sobic005G148201 Sobic008G068850--Sobic005G150000 Sobic008G068850--Sobic004G132200 Sobic008G068850--Sobic005G146000 Sobic008G068850--Sobic004G316300 Sobic009G020000 Sobic009G020000 Sobic008G068850--Sobic009G020000 Sobic008G068450--Sobic006G034900 Sobic008G068450--Sobic008G068850 Sobic008G068450--Sobic008G068900 Sobic008G068450--Sobic005G148201 Sobic008G068450--Sobic005G150000 Sobic008G068450--Sobic004G132200 Sobic008G068450--Sobic004G076900 Sobic008G068450--Sobic005G146000 Sobic008G068450--Sobic002G164866 Sobic005G148201--Sobic005G150000 Sobic005G148201--Sobic004G132200 Sobic005G148201--Sobic004G316300 Sobic005G148201--Sobic005G146000 Sobic005G148201--Sobic006G034900 Sobic005G148201--Sobic008G068900 Sobic007G196100 Sobic007G196100 Sobic005G148201--Sobic007G196100 Sobic005G148201--Sobic008G068850 Sobic004G114700 Sobic004G114700 Sobic005G148201--Sobic004G114700 Sobic005G150000--Sobic004G316300 Sobic005G150000--Sobic005G148201 Sobic005G150000--Sobic004G132200 Sobic005G150000--Sobic008G068900 Sobic005G150000--Sobic006G034900 Sobic005G150000--Sobic005G146000 Sobic005G150000--Sobic004G114700 Sobic005G150000--Sobic009G020000 Sobic005G150000--Sobic007G196100 Sobic004G132200--Sobic005G146000 Sobic004G132200--Sobic005G148201 Sobic004G132200--Sobic005G150000 Sobic004G132200--Sobic007G196100 Sobic004G132200--Sobic004G316300 Sobic004G132200--Sobic006G034900 Sobic004G132200--Sobic008G068900 Sobic003G326300 Sobic003G326300 Sobic004G132200--Sobic003G326300 Sobic005G148100 Sobic005G148100 Sobic004G132200--Sobic005G148100 Sobic005G146000--Sobic004G132200 Sobic005G146000--Sobic007G196100 Sobic005G146000--Sobic005G148201 Sobic005G146000--Sobic005G148100 Sobic005G146000--Sobic005G150000 Sobic005G146000--Sobic003G326300 Sobic005G189800 Sobic005G189800 Sobic005G146000--Sobic005G189800 Sobic009G019700 Sobic009G019700 Sobic005G146000--Sobic009G019700 Sobic005G146000--Sobic004G316300 Sobic004G316300--Sobic005G150000 Sobic004G316300--Sobic005G148201 Sobic004G316300--Sobic004G114700 Sobic004G316300--Sobic004G132200 Sobic005G052200 Sobic005G052200 Sobic004G316300--Sobic005G052200 Sobic004G316300--Sobic009G020000 Sobic002G098100 Sobic002G098100 Sobic004G316300--Sobic002G098100 Sobic004G316300--Sobic005G146000 Sobic004G316300--Sobic007G196100 Sobic010G136100 Sobic010G136100 Sobic004G076900--Sobic010G136100 Sobic009G196600 Sobic009G196600 Sobic004G076900--Sobic009G196600 Sobic004G076900--Sobic005G189800 Sobic004G076900--Sobic005G148100 Sobic001G220132 Sobic001G220132 Sobic004G076900--Sobic001G220132
Octagon: transcription factors


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