Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G119200.1
Synonym SbNF-YB17, Sb10g010520, LEC1, Nuclear Factor Y, EMB212, NF-YB9
Functional annotation tentative name (PubMedID : 31536532)
histone-like transcription factor and archaeal histone, putative, expressed
UniProt A0A1W0VSL1
Pfam PF00808
Panther DB PTHR11064 PTHR11064:SF20
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G47670 : nuclear factor Y, subunit B6
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g49370.1 : histone-like transcription factor and archaeal histone, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a050499 , Zm00025a030028 , Zm00025a026114
Brachypodium KQK04759 , KQJ95195
Barley HORVU3Hr1G098500.1 , HORVU3Hr1G098500.2 , HORVU7Hr1G043520.2 , HORVU2Hr1G087460.1 , HORVU7Hr1G043520.3 , HORVU7Hr1G043520.1
Wheat TraesCS7A02G214600 , TraesCS7A02G214900
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G146000 - -
2 Sobic.004G132200 - -
3 Sobic.005G148201 - -
4 Sobic.005G148100 - -
5 Sobic.006G034900 homeobox and START domains containing protein, putative, expressed K09338: homeobox-leucine zipper protein
6 Sobic.005G189800 - -
7 Sobic.004G076900 - -
8 Sobic.005G150000 - -
9 Sobic.007G196100 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein, expressed K11844: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16/45
10 Sobic.009G019700 - -
11 Sobic.008G181250 - -
12 Sobic.008G068900 expressed protein -
13 Sobic.010G136100 "kafirin seed storage protein, delta-kafirin precursor"(PubMedID : 21853065)@- -
14 Sobic.008G068450 - -
15 Sobic.003G415200 DEF1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
16 Sobic.008G068850 - -
17 Sobic.008G144201 - -
18 Sobic.004G316300 - -
19 Sobic.005G058500 - -
20 Sobic.009G196600 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic010G119200 Sobic010G119200 Sobic005G146000 Sobic005G146000 Sobic010G119200--Sobic005G146000 Sobic004G132200 Sobic004G132200 Sobic010G119200--Sobic004G132200 Sobic005G148201 Sobic005G148201 Sobic010G119200--Sobic005G148201 Sobic005G148100 Sobic005G148100 Sobic010G119200--Sobic005G148100 Sobic006G034900 Sobic006G034900 Sobic010G119200--Sobic006G034900 Sobic005G189800 Sobic005G189800 Sobic010G119200--Sobic005G189800 Sobic004G076900 Sobic004G076900 Sobic010G119200--Sobic004G076900 Sobic005G150000 Sobic005G150000 Sobic010G119200--Sobic005G150000 Sobic007G196100 Sobic007G196100 Sobic010G119200--Sobic007G196100 Sobic005G146000--Sobic004G132200 Sobic005G146000--Sobic007G196100 Sobic005G146000--Sobic005G148201 Sobic005G146000--Sobic005G148100 Sobic005G146000--Sobic005G150000 Sobic003G326300 Sobic003G326300 Sobic005G146000--Sobic003G326300 Sobic005G146000--Sobic005G189800 Sobic009G019700 Sobic009G019700 Sobic005G146000--Sobic009G019700 Sobic004G316300 Sobic004G316300 Sobic005G146000--Sobic004G316300 Sobic004G132200--Sobic005G146000 Sobic004G132200--Sobic005G148201 Sobic004G132200--Sobic005G150000 Sobic004G132200--Sobic007G196100 Sobic004G132200--Sobic004G316300 Sobic004G132200--Sobic006G034900 Sobic008G068900 Sobic008G068900 Sobic004G132200--Sobic008G068900 Sobic004G132200--Sobic003G326300 Sobic004G132200--Sobic005G148100 Sobic005G148201--Sobic005G150000 Sobic005G148201--Sobic004G132200 Sobic005G148201--Sobic004G316300 Sobic005G148201--Sobic005G146000 Sobic005G148201--Sobic006G034900 Sobic005G148201--Sobic008G068900 Sobic005G148201--Sobic007G196100 Sobic008G068850 Sobic008G068850 Sobic005G148201--Sobic008G068850 Sobic004G114700 Sobic004G114700 Sobic005G148201--Sobic004G114700 Sobic005G148100--Sobic009G019700 Sobic003G415200 Sobic003G415200 Sobic005G148100--Sobic003G415200 Sobic005G148100--Sobic005G189800 Sobic008G144201 Sobic008G144201 Sobic005G148100--Sobic008G144201 Sobic008G181250 Sobic008G181250 Sobic005G148100--Sobic008G181250 Sobic010G136100 Sobic010G136100 Sobic005G148100--Sobic010G136100 Sobic009G086100 Sobic009G086100 Sobic005G148100--Sobic009G086100 Sobic005G083220 Sobic005G083220 Sobic005G148100--Sobic005G083220 Sobic005G148100--Sobic005G146000 Sobic006G034900--Sobic008G068900 Sobic006G034900--Sobic008G068850 Sobic008G068450 Sobic008G068450 Sobic006G034900--Sobic008G068450 Sobic006G034900--Sobic005G148201 Sobic006G034900--Sobic005G150000 Sobic006G034900--Sobic004G132200 Sobic006G034900--Sobic005G146000 Sobic006G034900--Sobic004G316300 Sobic006G034900--Sobic004G076900 Sobic005G189800--Sobic009G019700 Sobic005G189800--Sobic005G148100 Sobic005G189800--Sobic003G415200 Sobic005G189800--Sobic008G181250 Sobic005G189800--Sobic010G136100 Sobic005G189800--Sobic009G086100 Sobic005G189800--Sobic008G144201 Sobic009G196600 Sobic009G196600 Sobic005G189800--Sobic009G196600 Sobic005G189800--Sobic005G083220 Sobic004G076900--Sobic010G136100 Sobic004G076900--Sobic009G196600 Sobic004G076900--Sobic005G189800 Sobic004G076900--Sobic005G148100 Sobic001G220132 Sobic001G220132 Sobic004G076900--Sobic001G220132 Sobic005G150000--Sobic004G316300 Sobic005G150000--Sobic005G148201 Sobic005G150000--Sobic004G132200 Sobic005G150000--Sobic008G068900 Sobic005G150000--Sobic006G034900 Sobic005G150000--Sobic005G146000 Sobic005G150000--Sobic004G114700 Sobic009G020000 Sobic009G020000 Sobic005G150000--Sobic009G020000 Sobic005G150000--Sobic007G196100 Sobic007G196100--Sobic003G326300 Sobic007G196100--Sobic005G146000 Sobic002G105900 Sobic002G105900 Sobic007G196100--Sobic002G105900 Sobic005G227151 Sobic005G227151 Sobic007G196100--Sobic005G227151 Sobic007G196100--Sobic004G132200 Sobic003G099900 Sobic003G099900 Sobic007G196100--Sobic003G099900 Sobic004G207500 Sobic004G207500 Sobic007G196100--Sobic004G207500 Sobic007G196100--Sobic005G083220 Sobic007G196100--Sobic005G148100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.