Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G012000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PB69
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G090500 - -
2 Sobic.007G083900 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
3 Sobic.007G024000 - -
4 Sobic.008G068850 - -
5 Sobic.008G069200 OsMADS13 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed -
6 Sobic.005G058500 - -
7 Sobic.009G020000 - -
8 Sobic.008G068900 expressed protein -
9 Sobic.008G188200 - -
10 Sobic.006G034900 homeobox and START domains containing protein, putative, expressed K09338: homeobox-leucine zipper protein
11 Sobic.008G068450 - -
12 Sobic.005G148201 - -
13 Sobic.005G150000 - -
14 Sobic.004G354500 expressed protein -
15 Sobic.004G114700 - -
16 Sobic.004G316300 - -
17 Sobic.004G132200 - -
18 Sobic.006G077800 expressed protein -
19 Sobic.005G178200 hypothetical protein -
20 Sobic.002G164866 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G012000 Sobic008G012000 Sobic004G090500 Sobic004G090500 Sobic008G012000--Sobic004G090500 Sobic007G083900 Sobic007G083900 Sobic008G012000--Sobic007G083900 Sobic007G024000 Sobic007G024000 Sobic008G012000--Sobic007G024000 Sobic008G068850 Sobic008G068850 Sobic008G012000--Sobic008G068850 Sobic008G069200 Sobic008G069200 Sobic008G012000--Sobic008G069200 Sobic005G058500 Sobic005G058500 Sobic008G012000--Sobic005G058500 Sobic009G020000 Sobic009G020000 Sobic008G012000--Sobic009G020000 Sobic008G068900 Sobic008G068900 Sobic008G012000--Sobic008G068900 Sobic008G188200 Sobic008G188200 Sobic008G012000--Sobic008G188200 Sobic004G090500--Sobic008G012000 Sobic004G090500--Sobic008G069200 Sobic004G090500--Sobic007G083900 Sobic004G090500--Sobic007G024000 Sobic004G090500--Sobic008G188200 Sobic004G090500--Sobic005G058500 Sobic004G090500--Sobic009G020000 Sobic004G090500--Sobic008G068850 Sobic004G354500 Sobic004G354500 Sobic004G090500--Sobic004G354500 Sobic007G083900--Sobic008G012000 Sobic007G083900--Sobic004G090500 Sobic007G083900--Sobic009G020000 Sobic010G258900 Sobic010G258900 Sobic007G083900--Sobic010G258900 Sobic007G040900 Sobic007G040900 Sobic007G083900--Sobic007G040900 Sobic003G099800 Sobic003G099800 Sobic007G083900--Sobic003G099800 Sobic002G164866 Sobic002G164866 Sobic007G083900--Sobic002G164866 Sobic003G129100 Sobic003G129100 Sobic007G083900--Sobic003G129100 Sobic003G139400 Sobic003G139400 Sobic007G083900--Sobic003G139400 Sobic007G024000--Sobic004G354500 Sobic007G024000--Sobic004G090500 Sobic007G024000--Sobic008G069200 Sobic007G024000--Sobic005G058500 Sobic005G178200 Sobic005G178200 Sobic007G024000--Sobic005G178200 Sobic007G024000--Sobic008G012000 Sobic007G024000--Sobic008G188200 Sobic003G415300 Sobic003G415300 Sobic007G024000--Sobic003G415300 Sobic010G195301 Sobic010G195301 Sobic007G024000--Sobic010G195301 Sobic006G034900 Sobic006G034900 Sobic008G068850--Sobic006G034900 Sobic008G068850--Sobic008G068900 Sobic008G068450 Sobic008G068450 Sobic008G068850--Sobic008G068450 Sobic005G148201 Sobic005G148201 Sobic008G068850--Sobic005G148201 Sobic005G150000 Sobic005G150000 Sobic008G068850--Sobic005G150000 Sobic004G132200 Sobic004G132200 Sobic008G068850--Sobic004G132200 Sobic005G146000 Sobic005G146000 Sobic008G068850--Sobic005G146000 Sobic004G316300 Sobic004G316300 Sobic008G068850--Sobic004G316300 Sobic008G068850--Sobic009G020000 Sobic008G069200--Sobic008G188200 Sobic008G069200--Sobic004G090500 Sobic008G069200--Sobic005G178200 Sobic008G069200--Sobic003G415300 Sobic003G326300 Sobic003G326300 Sobic008G069200--Sobic003G326300 Sobic008G069200--Sobic007G024000 Sobic008G184000 Sobic008G184000 Sobic008G069200--Sobic008G184000 Sobic008G069200--Sobic005G058500 Sobic008G082300 Sobic008G082300 Sobic008G069200--Sobic008G082300 Sobic005G058500--Sobic005G178200 Sobic005G189800 Sobic005G189800 Sobic005G058500--Sobic005G189800 Sobic009G086100 Sobic009G086100 Sobic005G058500--Sobic009G086100 Sobic005G058500--Sobic003G415300 Sobic009G019700 Sobic009G019700 Sobic005G058500--Sobic009G019700 Sobic010G136100 Sobic010G136100 Sobic005G058500--Sobic010G136100 Sobic005G058500--Sobic008G188200 Sobic005G058500--Sobic004G354500 Sobic005G148100 Sobic005G148100 Sobic005G058500--Sobic005G148100 Sobic004G114700 Sobic004G114700 Sobic009G020000--Sobic004G114700 Sobic009G020000--Sobic004G316300 Sobic009G020000--Sobic005G150000 Sobic005G052200 Sobic005G052200 Sobic009G020000--Sobic005G052200 Sobic009G020000--Sobic003G099800 Sobic002G098100 Sobic002G098100 Sobic009G020000--Sobic002G098100 Sobic009G020000--Sobic005G148201 Sobic004G008700 Sobic004G008700 Sobic009G020000--Sobic004G008700 Sobic009G020000--Sobic007G083900 Sobic008G068900--Sobic006G034900 Sobic008G068900--Sobic008G068850 Sobic008G068900--Sobic008G068450 Sobic008G068900--Sobic005G148201 Sobic008G068900--Sobic005G150000 Sobic008G068900--Sobic004G132200 Sobic008G068900--Sobic004G316300 Sobic008G068900--Sobic005G146000 Sobic008G068900--Sobic002G164866 Sobic008G188200--Sobic008G069200 Sobic008G188200--Sobic005G178200 Sobic008G188200--Sobic003G415300 Sobic008G188200--Sobic003G326300 Sobic008G188200--Sobic005G058500 Sobic008G188200--Sobic008G082300 Sobic008G188200--Sobic010G195301 Sobic008G188200--Sobic009G086100 Sobic008G188200--Sobic008G184000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.