Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G122500.5,Sobic.008G122500.3,Sobic.008G122500.4
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5R676 , A0A1Z5R758 , A0A1Z5R7D8
Pfam -
Panther DB PTHR33913 PTHR33913:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G05950 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g33940.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a047651
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.008G122500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G086500 alpha-1,2-fucosidase, putative, expressed K15923: AXY8, FUC95A, alpha-L-fucosidase 2
2 Sobic.005G052100 expressed protein -
3 Sobic.002G069800 OsFBX221 - F-box domain containing protein, expressed -
4 Sobic.007G127700 DUF581 domain containing protein, expressed -
5 Sobic.007G069800 expressed protein -
6 Sobic.003G076400 ZOS1-07 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
7 Sobic.005G003100 expressed protein -
8 Sobic.003G149600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@FAD dependent oxidoreductase domain containing protein, expressed K00306: sarcosine oxidase / L-pipecolate oxidase
9 Sobic.001G112350 - -
10 Sobic.001G029700 ELM2 domain containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.005G075000 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
12 Sobic.009G051201 - -
13 Sobic.008G143400 - -
14 Sobic.010G111400 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
15 Sobic.010G010300 - -
16 Sobic.004G126900 expressed protein -
17 Sobic.003G213100 AAA-type ATPase family protein, putative, expressed -
18 Sobic.007G054700 tentative name(PubMedID : 31536532)@histone-like transcription factor and archaeal histone, putative, expressed K08066: NFYC, nuclear transcription factor Y, gamma
19 Sobic.009G139500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@- -
20 Sobic.005G035500 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic008G122500 Sobic008G122500 Sobic002G086500 Sobic002G086500 Sobic008G122500--Sobic002G086500 Sobic005G052100 Sobic005G052100 Sobic008G122500--Sobic005G052100 Sobic002G069800 Sobic002G069800 Sobic008G122500--Sobic002G069800 Sobic007G127700 Sobic007G127700 Sobic008G122500--Sobic007G127700 Sobic007G069800 Sobic007G069800 Sobic008G122500--Sobic007G069800 Sobic003G076400 Sobic003G076400 Sobic008G122500--Sobic003G076400 Sobic005G003100 Sobic005G003100 Sobic008G122500--Sobic005G003100 Sobic003G149600 Sobic003G149600 Sobic008G122500--Sobic003G149600 Sobic001G112350 Sobic001G112350 Sobic008G122500--Sobic001G112350 Sobic002G086500--Sobic003G076400 Sobic001G029700 Sobic001G029700 Sobic002G086500--Sobic001G029700 Sobic009G139500 Sobic009G139500 Sobic002G086500--Sobic009G139500 Sobic006G161300 Sobic006G161300 Sobic002G086500--Sobic006G161300 Sobic010G111400 Sobic010G111400 Sobic002G086500--Sobic010G111400 Sobic002G101200 Sobic002G101200 Sobic002G086500--Sobic002G101200 Sobic002G058900 Sobic002G058900 Sobic002G086500--Sobic002G058900 Sobic005G035500 Sobic005G035500 Sobic002G086500--Sobic005G035500 Sobic005G033600 Sobic005G033600 Sobic002G086500--Sobic005G033600 Sobic005G052100--Sobic007G069800 Sobic005G052100--Sobic001G112350 Sobic005G052100--Sobic002G069800 Sobic005G052100--Sobic005G003100 Sobic005G052100--Sobic007G127700 Sobic009G013200 Sobic009G013200 Sobic005G052100--Sobic009G013200 Sobic008G143400 Sobic008G143400 Sobic005G052100--Sobic008G143400 Sobic003G213100 Sobic003G213100 Sobic005G052100--Sobic003G213100 Sobic001G330600 Sobic001G330600 Sobic005G052100--Sobic001G330600 Sobic002G069800--Sobic003G213100 Sobic002G069800--Sobic005G003100 Sobic009G051201 Sobic009G051201 Sobic002G069800--Sobic009G051201 Sobic002G069800--Sobic005G052100 Sobic002G069800--Sobic007G069800 Sobic002G069800--Sobic005G035500 Sobic003G225800 Sobic003G225800 Sobic002G069800--Sobic003G225800 Sobic005G197000 Sobic005G197000 Sobic002G069800--Sobic005G197000 Sobic002G217000 Sobic002G217000 Sobic002G069800--Sobic002G217000 Sobic007G127700--Sobic007G069800 Sobic007G127700--Sobic009G051201 Sobic007G127700--Sobic005G052100 Sobic007G127700--Sobic002G069800 Sobic007G127700--Sobic003G213100 Sobic007G127700--Sobic001G112350 Sobic007G127700--Sobic009G013200 Sobic007G127700--Sobic005G003100 Sobic007G127700--Sobic001G330600 Sobic007G069800--Sobic005G052100 Sobic007G069800--Sobic001G112350 Sobic007G069800--Sobic007G127700 Sobic007G069800--Sobic002G069800 Sobic007G069800--Sobic008G143400 Sobic007G069800--Sobic005G003100 Sobic007G069800--Sobic009G051201 Sobic007G069800--Sobic003G213100 Sobic007G069800--Sobic009G013200 Sobic003G076400--Sobic010G111400 Sobic003G076400--Sobic009G139500 Sobic003G076400--Sobic001G029700 Sobic003G076400--Sobic005G035500 Sobic010G137600 Sobic010G137600 Sobic003G076400--Sobic010G137600 Sobic003G076400--Sobic002G058900 Sobic001G495700 Sobic001G495700 Sobic003G076400--Sobic001G495700 Sobic007G025100 Sobic007G025100 Sobic003G076400--Sobic007G025100 Sobic002G059500 Sobic002G059500 Sobic003G076400--Sobic002G059500 Sobic005G003100--Sobic003G213100 Sobic005G003100--Sobic002G069800 Sobic005G003100--Sobic009G051201 Sobic005G075000 Sobic005G075000 Sobic005G003100--Sobic005G075000 Sobic005G003100--Sobic003G225800 Sobic005G003100--Sobic009G013200 Sobic005G003100--Sobic002G101200 Sobic005G003100--Sobic002G217000 Sobic005G003100--Sobic005G052100 Sobic003G149600--Sobic009G051201 Sobic003G149600--Sobic007G127700 Sobic007G209700 Sobic007G209700 Sobic003G149600--Sobic007G209700 Sobic002G234100 Sobic002G234100 Sobic003G149600--Sobic002G234100 Sobic003G378700 Sobic003G378700 Sobic003G149600--Sobic003G378700 Sobic010G020100 Sobic010G020100 Sobic003G149600--Sobic010G020100 Sobic003G149600--Sobic002G101200 Sobic007G054700 Sobic007G054700 Sobic003G149600--Sobic007G054700 Sobic003G149600--Sobic002G217000 Sobic001G112350--Sobic008G143400 Sobic001G112350--Sobic007G069800 Sobic001G112350--Sobic005G052100 Sobic001G112350--Sobic002G069800 Sobic001G112350--Sobic007G127700 Sobic001G328350 Sobic001G328350 Sobic001G112350--Sobic001G328350 Sobic004G090200 Sobic004G090200 Sobic001G112350--Sobic004G090200 Sobic001G112350--Sobic005G003100 Sobic001G112350--Sobic009G013200
Octagon: transcription factors


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