Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G089200.4,Sobic.003G089200.3
Synonym Sb03g007510
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XE32
Pfam -
Panther DB PTHR38393 PTHR38393:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G17460 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g03500.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a035527
Brachypodium KQK02494
Barley HORVU3Hr1G004440.5 , HORVU3Hr1G004440.10 , HORVU3Hr1G004440.11 , HORVU3Hr1G004440.4 , HORVU3Hr1G004440.7 , HORVU3Hr1G004440.1 , HORVU3Hr1G004440.3 , HORVU3Hr1G004440.2 , HORVU3Hr1G004440.9 , HORVU3Hr1G004440.8
Wheat TraesCS3D02G031500
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G089200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G050600 protein of unknown function domain containing protein, expressed -
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16 Sobic.006G011800 - -
17 Sobic.004G065850 - -
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19 Sobic.004G090300 OsFBX46 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.002G154400 MIM, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G089200 Sobic003G089200 Sobic005G050600 Sobic005G050600 Sobic003G089200--Sobic005G050600 Sobic010G009250 Sobic010G009250 Sobic003G089200--Sobic010G009250 Sobic007G018700 Sobic007G018700 Sobic003G089200--Sobic007G018700 Sobic002G046300 Sobic002G046300 Sobic003G089200--Sobic002G046300 Sobic004G200400 Sobic004G200400 Sobic003G089200--Sobic004G200400 Sobic009G122375 Sobic009G122375 Sobic003G089200--Sobic009G122375 Sobic001G299800 Sobic001G299800 Sobic003G089200--Sobic001G299800 Sobic009G042100 Sobic009G042100 Sobic003G089200--Sobic009G042100 Sobic001G466600 Sobic001G466600 Sobic003G089200--Sobic001G466600 Sobic003G004500 Sobic003G004500 Sobic005G050600--Sobic003G004500 Sobic001G033400 Sobic001G033400 Sobic005G050600--Sobic001G033400 Sobic003G412200 Sobic003G412200 Sobic005G050600--Sobic003G412200 Sobic001G041400 Sobic001G041400 Sobic005G050600--Sobic001G041400 Sobic005G050600--Sobic007G018700 Sobic005G032400 Sobic005G032400 Sobic005G050600--Sobic005G032400 Sobic001G042800 Sobic001G042800 Sobic005G050600--Sobic001G042800 Sobic010G250900 Sobic010G250900 Sobic005G050600--Sobic010G250900 Sobic008G160500 Sobic008G160500 Sobic005G050600--Sobic008G160500 Sobic010G009250--Sobic004G200400 Sobic010G009250--Sobic009G122375 Sobic004G187200 Sobic004G187200 Sobic010G009250--Sobic004G187200 Sobic010G009250--Sobic003G412200 Sobic005G052100 Sobic005G052100 Sobic010G009250--Sobic005G052100 Sobic002G104300 Sobic002G104300 Sobic010G009250--Sobic002G104300 Sobic001G330600 Sobic001G330600 Sobic010G009250--Sobic001G330600 Sobic004G090200 Sobic004G090200 Sobic010G009250--Sobic004G090200 Sobic001G083900 Sobic001G083900 Sobic010G009250--Sobic001G083900 Sobic008G156200 Sobic008G156200 Sobic007G018700--Sobic008G156200 Sobic007G018700--Sobic005G050600 Sobic002G390400 Sobic002G390400 Sobic007G018700--Sobic002G390400 Sobic010G207400 Sobic010G207400 Sobic007G018700--Sobic010G207400 Sobic005G072400 Sobic005G072400 Sobic007G018700--Sobic005G072400 Sobic006G061100 Sobic006G061100 Sobic007G018700--Sobic006G061100 Sobic007G018700--Sobic003G412200 Sobic007G018700--Sobic004G200400 Sobic005G131800 Sobic005G131800 Sobic007G018700--Sobic005G131800 Sobic002G046300--Sobic005G050600 Sobic002G046300--Sobic004G200400 Sobic002G278600 Sobic002G278600 Sobic002G046300--Sobic002G278600 Sobic002G046300--Sobic010G009250 Sobic007G150700 Sobic007G150700 Sobic002G046300--Sobic007G150700 Sobic010G241600 Sobic010G241600 Sobic002G046300--Sobic010G241600 Sobic002G046300--Sobic003G089200 Sobic002G046300--Sobic005G032400 Sobic002G046300--Sobic001G466600 Sobic009G207500 Sobic009G207500 Sobic004G200400--Sobic009G207500 Sobic007G204600 Sobic007G204600 Sobic004G200400--Sobic007G204600 Sobic004G200400--Sobic005G052100 Sobic005G075000 Sobic005G075000 Sobic004G200400--Sobic005G075000 Sobic005G003100 Sobic005G003100 Sobic004G200400--Sobic005G003100 Sobic002G069800 Sobic002G069800 Sobic004G200400--Sobic002G069800 Sobic004G200400--Sobic001G330600 Sobic009G013200 Sobic009G013200 Sobic004G200400--Sobic009G013200 Sobic003G213100 Sobic003G213100 Sobic004G200400--Sobic003G213100 Sobic009G122375--Sobic004G187200 Sobic009G122375--Sobic007G204600 Sobic009G122375--Sobic004G200400 Sobic009G122375--Sobic001G330600 Sobic002G147500 Sobic002G147500 Sobic009G122375--Sobic002G147500 Sobic009G122375--Sobic004G090200 Sobic009G122375--Sobic009G013200 Sobic009G122375--Sobic005G052100 Sobic009G122375--Sobic010G009250 Sobic002G312800 Sobic002G312800 Sobic001G299800--Sobic002G312800 Sobic001G299800--Sobic001G466600 Sobic001G299800--Sobic003G089200 Sobic004G020150 Sobic004G020150 Sobic001G299800--Sobic004G020150 Sobic003G349000 Sobic003G349000 Sobic001G299800--Sobic003G349000 Sobic009G088575 Sobic009G088575 Sobic001G299800--Sobic009G088575 Sobic010G087000 Sobic010G087000 Sobic001G299800--Sobic010G087000 Sobic009G239400 Sobic009G239400 Sobic001G299800--Sobic009G239400 Sobic008G140500 Sobic008G140500 Sobic001G299800--Sobic008G140500 Sobic001G206500 Sobic001G206500 Sobic009G042100--Sobic001G206500 Sobic002G154400 Sobic002G154400 Sobic009G042100--Sobic002G154400 Sobic003G206600 Sobic003G206600 Sobic009G042100--Sobic003G206600 Sobic009G069200 Sobic009G069200 Sobic009G042100--Sobic009G069200 Sobic008G017900 Sobic008G017900 Sobic009G042100--Sobic008G017900 Sobic009G043400 Sobic009G043400 Sobic009G042100--Sobic009G043400 Sobic009G042100--Sobic003G349000 Sobic009G042100--Sobic002G312800 Sobic010G240800 Sobic010G240800 Sobic009G042100--Sobic010G240800 Sobic001G466600--Sobic002G312800 Sobic001G466600--Sobic010G241600 Sobic006G095400 Sobic006G095400 Sobic001G466600--Sobic006G095400 Sobic001G466600--Sobic001G299800 Sobic001G466600--Sobic002G046300 Sobic002G329700 Sobic002G329700 Sobic001G466600--Sobic002G329700 Sobic001G152360 Sobic001G152360 Sobic001G466600--Sobic001G152360 Sobic001G466600--Sobic003G089200 Sobic009G228900 Sobic009G228900 Sobic001G466600--Sobic009G228900
Octagon: transcription factors


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