Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G019500.1
Synonym Sb02g001830
Functional annotation OsFBX234 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt C5X8M7
Pfam PF00646
Panther DB PTHR33186 PTHR33186:SF6
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G18330 : F-box family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g23900.1 : OsFBX234 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS6A02G083600 , TraesCS6A02G083600 , TraesCS5D02G506700 , TraesCS5D02G506700 , TraesCS5B02G506300 , TraesCS5B02G506300 , TraesCS4A02G366600 , TraesCS2B02G276500
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G019750 - -
2 Sobic.006G223800 ZOS8-01 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
3 Sobic.008G155600 ankyrin-1, putative, expressed -
4 Sobic.002G106000 OsFBD15 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
5 Sobic.006G212500 - -
6 Sobic.010G153000 expressed protein -
7 Sobic.002G059866 - -
8 Sobic.004G313300 expressed protein -
9 Sobic.001G489150 - -
10 Sobic.008G104300 OsFBX164 - F-box domain containing protein, expressed -
11 Sobic.009G159300 expressed protein -
12 Sobic.007G070500 OsFBL41 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
13 Sobic.008G012700 GRAS family transcription factor containing protein, expressed -
14 Sobic.002G059800 - -
15 Sobic.002G419000 AGC_AGC_other_RS6K_like.2 - ACG kinases include homologs to PKA, PKG and PKC, expressed K04688: ribosomal protein S6 kinase beta
16 Sobic.004G005900 expressed protein -
17 Sobic.002G019600 OsFBX234 - F-box domain containing protein, expressed -
18 Sobic.006G268000 phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit P, putative, expressed K03861: PIGP, GPI19, phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit P
19 Sobic.007G199300 MBTB32 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed -
20 Sobic.002G431200 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G019500 Sobic002G019500 Sobic002G019750 Sobic002G019750 Sobic002G019500--Sobic002G019750 Sobic006G223800 Sobic006G223800 Sobic002G019500--Sobic006G223800 Sobic008G155600 Sobic008G155600 Sobic002G019500--Sobic008G155600 Sobic002G106000 Sobic002G106000 Sobic002G019500--Sobic002G106000 Sobic006G212500 Sobic006G212500 Sobic002G019500--Sobic006G212500 Sobic010G153000 Sobic010G153000 Sobic002G019500--Sobic010G153000 Sobic002G059866 Sobic002G059866 Sobic002G019500--Sobic002G059866 Sobic004G313300 Sobic004G313300 Sobic002G019500--Sobic004G313300 Sobic001G489150 Sobic001G489150 Sobic002G019500--Sobic001G489150 Sobic002G019750--Sobic002G019500 Sobic007G070500 Sobic007G070500 Sobic002G019750--Sobic007G070500 Sobic002G019750--Sobic001G489150 Sobic006G199700 Sobic006G199700 Sobic002G019750--Sobic006G199700 Sobic002G019750--Sobic006G223800 Sobic002G019750--Sobic008G155600 Sobic005G170700 Sobic005G170700 Sobic002G019750--Sobic005G170700 Sobic002G019750--Sobic002G106000 Sobic005G064700 Sobic005G064700 Sobic002G019750--Sobic005G064700 Sobic008G010900 Sobic008G010900 Sobic006G223800--Sobic008G010900 Sobic006G017600 Sobic006G017600 Sobic006G223800--Sobic006G017600 Sobic002G014200 Sobic002G014200 Sobic006G223800--Sobic002G014200 Sobic005G110421 Sobic005G110421 Sobic006G223800--Sobic005G110421 Sobic006G223800--Sobic002G019500 Sobic006G223800--Sobic002G019750 Sobic006G223800--Sobic008G155600 Sobic010G093400 Sobic010G093400 Sobic006G223800--Sobic010G093400 Sobic001G112000 Sobic001G112000 Sobic006G223800--Sobic001G112000 Sobic008G155600--Sobic002G019750 Sobic008G155600--Sobic006G223800 Sobic008G155600--Sobic002G019500 Sobic008G155600--Sobic005G110421 Sobic008G155600--Sobic001G112000 Sobic008G155600--Sobic008G010900 Sobic009G156600 Sobic009G156600 Sobic008G155600--Sobic009G156600 Sobic008G155600--Sobic006G212500 Sobic001G510400 Sobic001G510400 Sobic008G155600--Sobic001G510400 Sobic007G048900 Sobic007G048900 Sobic002G106000--Sobic007G048900 Sobic002G106200 Sobic002G106200 Sobic002G106000--Sobic002G106200 Sobic007G216800 Sobic007G216800 Sobic002G106000--Sobic007G216800 Sobic007G214800 Sobic007G214800 Sobic002G106000--Sobic007G214800 Sobic007G118075 Sobic007G118075 Sobic002G106000--Sobic007G118075 Sobic010G090700 Sobic010G090700 Sobic002G106000--Sobic010G090700 Sobic007G080200 Sobic007G080200 Sobic002G106000--Sobic007G080200 Sobic002G158300 Sobic002G158300 Sobic002G106000--Sobic002G158300 Sobic002G106000--Sobic002G019500 Sobic010G087000 Sobic010G087000 Sobic006G212500--Sobic010G087000 Sobic005G202000 Sobic005G202000 Sobic006G212500--Sobic005G202000 Sobic006G212500--Sobic002G019500 Sobic009G205400 Sobic009G205400 Sobic006G212500--Sobic009G205400 Sobic002G103700 Sobic002G103700 Sobic006G212500--Sobic002G103700 Sobic003G009400 Sobic003G009400 Sobic006G212500--Sobic003G009400 Sobic004G148600 Sobic004G148600 Sobic006G212500--Sobic004G148600 Sobic006G250100 Sobic006G250100 Sobic006G212500--Sobic006G250100 Sobic006G212500--Sobic008G155600 Sobic006G262700 Sobic006G262700 Sobic010G153000--Sobic006G262700 Sobic010G153000--Sobic007G118075 Sobic002G011100 Sobic002G011100 Sobic010G153000--Sobic002G011100 Sobic009G116400 Sobic009G116400 Sobic010G153000--Sobic009G116400 Sobic005G154700 Sobic005G154700 Sobic010G153000--Sobic005G154700 Sobic004G089500 Sobic004G089500 Sobic010G153000--Sobic004G089500 Sobic001G204700 Sobic001G204700 Sobic010G153000--Sobic001G204700 Sobic003G397100 Sobic003G397100 Sobic010G153000--Sobic003G397100 Sobic006G028700 Sobic006G028700 Sobic010G153000--Sobic006G028700 Sobic002G016900 Sobic002G016900 Sobic002G059866--Sobic002G016900 Sobic010G270800 Sobic010G270800 Sobic002G059866--Sobic010G270800 Sobic003G022200 Sobic003G022200 Sobic002G059866--Sobic003G022200 Sobic002G253600 Sobic002G253600 Sobic002G059866--Sobic002G253600 Sobic003G244700 Sobic003G244700 Sobic002G059866--Sobic003G244700 Sobic002G019600 Sobic002G019600 Sobic002G059866--Sobic002G019600 Sobic010G262900 Sobic010G262900 Sobic002G059866--Sobic010G262900 Sobic003G174200 Sobic003G174200 Sobic002G059866--Sobic003G174200 Sobic008G156200 Sobic008G156200 Sobic002G059866--Sobic008G156200 Sobic006G144000 Sobic006G144000 Sobic004G313300--Sobic006G144000 Sobic010G063300 Sobic010G063300 Sobic004G313300--Sobic010G063300 Sobic006G224300 Sobic006G224300 Sobic004G313300--Sobic006G224300 Sobic003G070700 Sobic003G070700 Sobic004G313300--Sobic003G070700 Sobic004G353400 Sobic004G353400 Sobic004G313300--Sobic004G353400 Sobic009G125000 Sobic009G125000 Sobic004G313300--Sobic009G125000 Sobic005G040900 Sobic005G040900 Sobic004G313300--Sobic005G040900 Sobic005G198200 Sobic005G198200 Sobic004G313300--Sobic005G198200 Sobic004G152000 Sobic004G152000 Sobic004G313300--Sobic004G152000 Sobic001G489150--Sobic007G070500 Sobic004G010800 Sobic004G010800 Sobic001G489150--Sobic004G010800 Sobic001G489150--Sobic002G019750 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic001G489150--Sobic008G065400 Sobic003G266700 Sobic003G266700 Sobic001G489150--Sobic003G266700 Sobic003G084750 Sobic003G084750 Sobic001G489150--Sobic003G084750 Sobic004G152601 Sobic004G152601 Sobic001G489150--Sobic004G152601 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic001G489150--Sobic003G366850 Sobic009G159300 Sobic009G159300 Sobic001G489150--Sobic009G159300
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.