Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G005900.5,Sobic.004G005900.4,Sobic.004G005900.6,Sobic.004G005900.7,Sobic.004G005900.8,Sobic.004G005900.3,Sobic.004G005900.1,Sobic.004G005900.2
Synonym Sb04g000710
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RKB0 , A0A194YN53 , A0A194YM13 , A0A194YM33 , A0A1Z5RKA0 , A0A1Z5RK98 , A0A194YM25 , A0A1Z5RKS1
Pfam PF13365
Panther DB PTHR18868 PTHR18868:SF18 PTHR18868:SF18 PTHR18868
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g33490.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium PNT62246 , PNT62247 , KQJ85544 , KQJ85545 , KQJ85543 , PNT73879
Barley -
Wheat TraesCS6B02G189900 , TraesCS2B02G239000
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.004G005900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G132100 ATP binding protein, putative, expressed -
2 Sobic.005G127300 expressed protein K14289: exportin-5
3 Sobic.002G289000 expressed protein -
4 Sobic.002G019600 OsFBX234 - F-box domain containing protein, expressed -
5 Sobic.002G400900 expressed protein -
6 Sobic.003G366850 - -
7 Sobic.004G005400 U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase, putative, expressed K12854: SNRNP200, pre-mRNA-splicing helicase BRR2
8 Sobic.006G110400 csAtPR5, putative, expressed -
9 Sobic.005G096800 - -
10 Sobic.002G059800 - -
11 Sobic.002G019500 OsFBX234 - F-box domain containing protein, expressed -
12 Sobic.001G278600 - -
13 Sobic.001G261480 - K01489: cdd, cytidine deaminase
14 Sobic.008G177950 - -
15 Sobic.004G204400 OsFBX309 - F-box domain containing protein, expressed -
16 Sobic.001G186850 - -
17 Sobic.009G000400 expressed protein -
18 Sobic.004G200866 - -
19 Sobic.007G143300 expressed protein -
20 Sobic.008G043900 bZIP transcription factor, putative, expressed K14432: ABA responsive element binding factor


Gene co-expression network
sample Sobic004G005900 Sobic004G005900 Sobic004G132100 Sobic004G132100 Sobic004G005900--Sobic004G132100 Sobic005G127300 Sobic005G127300 Sobic004G005900--Sobic005G127300 Sobic002G289000 Sobic002G289000 Sobic004G005900--Sobic002G289000 Sobic002G019600 Sobic002G019600 Sobic004G005900--Sobic002G019600 Sobic002G400900 Sobic002G400900 Sobic004G005900--Sobic002G400900 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic004G005900--Sobic003G366850 Sobic004G005400 Sobic004G005400 Sobic004G005900--Sobic004G005400 Sobic006G110400 Sobic006G110400 Sobic004G005900--Sobic006G110400 Sobic005G096800 Sobic005G096800 Sobic004G005900--Sobic005G096800 Sobic004G132100--Sobic005G096800 Sobic006G022500 Sobic006G022500 Sobic004G132100--Sobic006G022500 Sobic004G204400 Sobic004G204400 Sobic004G132100--Sobic004G204400 Sobic004G132100--Sobic004G005400 Sobic004G132100--Sobic005G127300 Sobic004G132100--Sobic002G019600 Sobic004G045566 Sobic004G045566 Sobic004G132100--Sobic004G045566 Sobic002G182300 Sobic002G182300 Sobic004G132100--Sobic002G182300 Sobic010G033700 Sobic010G033700 Sobic004G132100--Sobic010G033700 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic005G127300--Sobic009G101600 Sobic004G200866 Sobic004G200866 Sobic005G127300--Sobic004G200866 SobicK010000 SobicK010000 Sobic005G127300--SobicK010000 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic005G127300--Sobic005G142200 Sobic005G127300--Sobic003G366850 Sobic001G261480 Sobic001G261480 Sobic005G127300--Sobic001G261480 Sobic009G026400 Sobic009G026400 Sobic005G127300--Sobic009G026400 Sobic002G060500 Sobic002G060500 Sobic005G127300--Sobic002G060500 Sobic003G156766 Sobic003G156766 Sobic005G127300--Sobic003G156766 Sobic002G289000--Sobic005G127300 Sobic002G289000--Sobic004G204400 Sobic002G289000--Sobic004G132100 Sobic002G289000--Sobic002G400900 Sobic002G289000--Sobic004G005400 Sobic005G154700 Sobic005G154700 Sobic002G289000--Sobic005G154700 Sobic002G316500 Sobic002G316500 Sobic002G289000--Sobic002G316500 Sobic003G092500 Sobic003G092500 Sobic002G289000--Sobic003G092500 Sobic003G066700 Sobic003G066700 Sobic002G289000--Sobic003G066700 Sobic002G019600--Sobic004G005400 Sobic003G244700 Sobic003G244700 Sobic002G019600--Sobic003G244700 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic002G019600--Sobic002G062300 Sobic002G019600--Sobic001G261480 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic002G019600--Sobic005G139800 Sobic003G031750 Sobic003G031750 Sobic002G019600--Sobic003G031750 Sobic005G117801 Sobic005G117801 Sobic002G019600--Sobic005G117801 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic002G019600--Sobic009G209800 Sobic008G079100 Sobic008G079100 Sobic002G019600--Sobic008G079100 Sobic001G287101 Sobic001G287101 Sobic002G400900--Sobic001G287101 Sobic002G224450 Sobic002G224450 Sobic002G400900--Sobic002G224450 Sobic002G400900--Sobic004G005400 Sobic002G400900--Sobic005G096800 Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic002G400900--Sobic005G110427 Sobic002G400900--Sobic003G366850 Sobic008G025900 Sobic008G025900 Sobic002G400900--Sobic008G025900 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic002G400900--Sobic004G121000 Sobic001G022100 Sobic001G022100 Sobic002G400900--Sobic001G022100 Sobic003G366850--Sobic004G121000 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic003G366850--Sobic008G065400 Sobic003G366850--Sobic001G261480 Sobic003G429500 Sobic003G429500 Sobic003G366850--Sobic003G429500 Sobic003G366850--Sobic004G200866 Sobic002G431200 Sobic002G431200 Sobic003G366850--Sobic002G431200 Sobic001G278600 Sobic001G278600 Sobic003G366850--Sobic001G278600 Sobic003G366850--Sobic005G142200 Sobic003G366850--Sobic009G101600 Sobic004G005400--Sobic005G110427 Sobic006G262200 Sobic006G262200 Sobic004G005400--Sobic006G262200 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic004G005400--Sobic006G009400 Sobic010G263800 Sobic010G263800 Sobic004G005400--Sobic010G263800 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic004G005400--Sobic005G221425 Sobic004G005400--Sobic009G209800 Sobic003G346000 Sobic003G346000 Sobic004G005400--Sobic003G346000 Sobic004G005400--Sobic003G031750 Sobic004G005400--Sobic008G079100 Sobic002G414500 Sobic002G414500 Sobic006G110400--Sobic002G414500 Sobic001G107900 Sobic001G107900 Sobic006G110400--Sobic001G107900 Sobic004G216500 Sobic004G216500 Sobic006G110400--Sobic004G216500 Sobic004G151700 Sobic004G151700 Sobic006G110400--Sobic004G151700 Sobic003G088700 Sobic003G088700 Sobic006G110400--Sobic003G088700 Sobic001G261521 Sobic001G261521 Sobic006G110400--Sobic001G261521 Sobic001G542700 Sobic001G542700 Sobic006G110400--Sobic001G542700 Sobic006G251900 Sobic006G251900 Sobic006G110400--Sobic006G251900 Sobic008G192600 Sobic008G192600 Sobic006G110400--Sobic008G192600 Sobic002G166600 Sobic002G166600 Sobic005G096800--Sobic002G166600 Sobic005G096800--Sobic002G400900 Sobic005G096800--Sobic005G110427 Sobic005G096800--Sobic001G022100 Sobic005G096800--Sobic005G139800 Sobic007G144200 Sobic007G144200 Sobic005G096800--Sobic007G144200 Sobic001G055900 Sobic001G055900 Sobic005G096800--Sobic001G055900 Sobic005G096800--Sobic004G132100 Sobic001G271801 Sobic001G271801 Sobic005G096800--Sobic001G271801
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.