Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G110400.1,Sobic.006G110400.3,Sobic.006G110400.4,Sobic.006G110400.2
Synonym Sb06g019270
Functional annotation csAtPR5, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RDE1 , C5YA74 , A0A1Z5REB0 , A0A1Z5RDB8
Pfam -
Panther DB PTHR33065 PTHR33065:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g34614.1,LOC_Os01g66230.2 : csAtPR5, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G414500 OsFBK19 - F-box domain and kelch repeat containing protein, expressed -
2 Sobic.001G107900 fip1 motif family protein, expressed -
3 Sobic.004G216500 hypothetical protein -
4 Sobic.004G151700 cyclin-L1-1, putative, expressed -
5 Sobic.003G088700 - -
6 Sobic.001G261521 - -
7 Sobic.001G542700 expressed protein -
8 Sobic.006G251900 - -
9 Sobic.008G192600 serine/threonine-protein kinase PRP4, putative, expressed K08827: serine/threonine-protein kinase PRP4
10 Sobic.001G014100 expressed protein -
11 Sobic.008G054500 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed -
12 Sobic.004G005900 expressed protein -
13 Sobic.009G083400 RNA recognition motif family protein, expressed -
14 Sobic.001G511500 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K12837: splicing factor U2AF 65 kDa subunit
15 Sobic.006G159900 DTA2, putative, expressed -
16 Sobic.001G080900 heat shock protein DnaJ, putative, expressed -
17 Sobic.003G012100 smr domain containing protein, expressed -
18 Sobic.001G452000 heat shock protein DnaJ, putative, expressed K03686: molecular chaperone DnaJ
19 Sobic.009G178800 bZIP transcription factor, putative, expressed K14432: ABA responsive element binding factor
20 Sobic.001G040500 RING finger protein 126, putative, expressed K11982: E3 ubiquitin-protein ligase RNF115/126


Gene co-expression network
sample Sobic006G110400 Sobic006G110400 Sobic002G414500 Sobic002G414500 Sobic006G110400--Sobic002G414500 Sobic001G107900 Sobic001G107900 Sobic006G110400--Sobic001G107900 Sobic004G216500 Sobic004G216500 Sobic006G110400--Sobic004G216500 Sobic004G151700 Sobic004G151700 Sobic006G110400--Sobic004G151700 Sobic003G088700 Sobic003G088700 Sobic006G110400--Sobic003G088700 Sobic001G261521 Sobic001G261521 Sobic006G110400--Sobic001G261521 Sobic001G542700 Sobic001G542700 Sobic006G110400--Sobic001G542700 Sobic006G251900 Sobic006G251900 Sobic006G110400--Sobic006G251900 Sobic008G192600 Sobic008G192600 Sobic006G110400--Sobic008G192600 Sobic010G189000 Sobic010G189000 Sobic002G414500--Sobic010G189000 Sobic006G183800 Sobic006G183800 Sobic002G414500--Sobic006G183800 Sobic008G054500 Sobic008G054500 Sobic002G414500--Sobic008G054500 Sobic009G178800 Sobic009G178800 Sobic002G414500--Sobic009G178800 Sobic002G288000 Sobic002G288000 Sobic002G414500--Sobic002G288000 Sobic002G370900 Sobic002G370900 Sobic002G414500--Sobic002G370900 Sobic007G079200 Sobic007G079200 Sobic002G414500--Sobic007G079200 Sobic006G082900 Sobic006G082900 Sobic002G414500--Sobic006G082900 Sobic007G026000 Sobic007G026000 Sobic002G414500--Sobic007G026000 Sobic001G107900--Sobic001G542700 Sobic001G107900--Sobic004G216500 Sobic009G138800 Sobic009G138800 Sobic001G107900--Sobic009G138800 Sobic004G065100 Sobic004G065100 Sobic001G107900--Sobic004G065100 Sobic001G107900--Sobic008G192600 Sobic001G014100 Sobic001G014100 Sobic001G107900--Sobic001G014100 Sobic001G241200 Sobic001G241200 Sobic001G107900--Sobic001G241200 Sobic007G117400 Sobic007G117400 Sobic001G107900--Sobic007G117400 Sobic002G277600 Sobic002G277600 Sobic001G107900--Sobic002G277600 Sobic004G216500--Sobic008G054500 Sobic007G126600 Sobic007G126600 Sobic004G216500--Sobic007G126600 Sobic001G511500 Sobic001G511500 Sobic004G216500--Sobic001G511500 Sobic003G119000 Sobic003G119000 Sobic004G216500--Sobic003G119000 Sobic004G216500--Sobic009G138800 Sobic003G108700 Sobic003G108700 Sobic004G216500--Sobic003G108700 Sobic004G216500--Sobic008G192600 Sobic007G167500 Sobic007G167500 Sobic004G216500--Sobic007G167500 Sobic004G216500--Sobic001G107900 Sobic006G245400 Sobic006G245400 Sobic004G151700--Sobic006G245400 Sobic004G151700--Sobic004G216500 Sobic004G151700--Sobic003G119000 Sobic007G172400 Sobic007G172400 Sobic004G151700--Sobic007G172400 Sobic004G257400 Sobic004G257400 Sobic004G151700--Sobic004G257400 Sobic006G182200 Sobic006G182200 Sobic004G151700--Sobic006G182200 Sobic007G119200 Sobic007G119200 Sobic004G151700--Sobic007G119200 Sobic003G038500 Sobic003G038500 Sobic004G151700--Sobic003G038500 Sobic001G509500 Sobic001G509500 Sobic004G151700--Sobic001G509500 Sobic010G056000 Sobic010G056000 Sobic003G088700--Sobic010G056000 Sobic003G205801 Sobic003G205801 Sobic003G088700--Sobic003G205801 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic003G088700--Sobic001G111900 Sobic003G088700--Sobic009G178800 Sobic003G084900 Sobic003G084900 Sobic003G088700--Sobic003G084900 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic003G088700--Sobic009G127900 Sobic008G125600 Sobic008G125600 Sobic003G088700--Sobic008G125600 Sobic004G039700 Sobic004G039700 Sobic003G088700--Sobic004G039700 Sobic003G088700--Sobic006G183800 Sobic006G006500 Sobic006G006500 Sobic001G261521--Sobic006G006500 Sobic004G239901 Sobic004G239901 Sobic001G261521--Sobic004G239901 Sobic010G152850 Sobic010G152850 Sobic001G261521--Sobic010G152850 Sobic003G185250 Sobic003G185250 Sobic001G261521--Sobic003G185250 Sobic009G239351 Sobic009G239351 Sobic001G261521--Sobic009G239351 Sobic001G245900 Sobic001G245900 Sobic001G261521--Sobic001G245900 Sobic001G261521--Sobic001G511500 Sobic009G100050 Sobic009G100050 Sobic001G261521--Sobic009G100050 Sobic002G060450 Sobic002G060450 Sobic001G261521--Sobic002G060450 Sobic004G009600 Sobic004G009600 Sobic001G542700--Sobic004G009600 Sobic010G065300 Sobic010G065300 Sobic001G542700--Sobic010G065300 Sobic001G542700--Sobic001G241200 Sobic002G299700 Sobic002G299700 Sobic001G542700--Sobic002G299700 Sobic001G542700--Sobic007G117400 Sobic003G293200 Sobic003G293200 Sobic001G542700--Sobic003G293200 Sobic009G040600 Sobic009G040600 Sobic001G542700--Sobic009G040600 Sobic007G061700 Sobic007G061700 Sobic001G542700--Sobic007G061700 Sobic010G209400 Sobic010G209400 Sobic001G542700--Sobic010G209400 Sobic001G347300 Sobic001G347300 Sobic006G251900--Sobic001G347300 Sobic006G251900--Sobic007G126600 Sobic009G083400 Sobic009G083400 Sobic006G251900--Sobic009G083400 Sobic006G251900--Sobic003G108700 Sobic006G251900--Sobic001G511500 Sobic006G251900--Sobic004G216500 Sobic002G127100 Sobic002G127100 Sobic006G251900--Sobic002G127100 Sobic006G251900--Sobic008G192600 Sobic006G251900--Sobic003G038500 Sobic008G192600--Sobic007G126600 Sobic008G192600--Sobic001G241200 Sobic009G026500 Sobic009G026500 Sobic008G192600--Sobic009G026500 Sobic002G404700 Sobic002G404700 Sobic008G192600--Sobic002G404700 Sobic008G192600--Sobic003G119000 Sobic003G372700 Sobic003G372700 Sobic008G192600--Sobic003G372700 Sobic008G192600--Sobic007G117400 Sobic008G192600--Sobic009G138800 Sobic004G314000 Sobic004G314000 Sobic008G192600--Sobic004G314000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.