Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G080900.1
Synonym Sb01g007290
Functional annotation heat shock protein DnaJ, putative, expressed
UniProt C5X046
Pfam PF00226
Panther DB PTHR24078 PTHR24078:SF229
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G37480 : Chaperone DnaJ-domain superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g55360.1 : heat shock protein DnaJ, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a016748
Brachypodium KQK13071
Barley HORVU5Hr1G097170.9 , HORVU5Hr1G097170.8 , HORVU5Hr1G097170.3 , HORVU5Hr1G097170.2 , HORVU5Hr1G097170.1 , HORVU5Hr1G097170.7 , HORVU5Hr1G097170.6 , HORVU5Hr1G097170.5 , HORVU5Hr1G097170.4 , HORVU5Hr1G097170.22 , HORVU5Hr1G097170.20 , HORVU5Hr1G097170.21 , HORVU5Hr1G097170.19 , HORVU5Hr1G097170.18 , HORVU5Hr1G097170.13 , HORVU5Hr1G097170.12 , HORVU5Hr1G097170.11 , HORVU5Hr1G097170.10 , HORVU5Hr1G097170.17 , HORVU5Hr1G097170.16 , HORVU5Hr1G097170.15 , HORVU5Hr1G097170.14
Wheat TraesCS5B02G404700 , TraesCS5A02G399900 , TraesCS5D02G409800
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G080900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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19 Sobic.001G290100 expressed protein -
20 Sobic.004G048800 - K12599: SKI2, antiviral helicase SKI2


Gene co-expression network
sample Sobic001G080900 Sobic001G080900 Sobic005G133500 Sobic005G133500 Sobic001G080900--Sobic005G133500 Sobic001G504200 Sobic001G504200 Sobic001G080900--Sobic001G504200 Sobic010G201500 Sobic010G201500 Sobic001G080900--Sobic010G201500 Sobic008G153000 Sobic008G153000 Sobic001G080900--Sobic008G153000 Sobic008G084700 Sobic008G084700 Sobic001G080900--Sobic008G084700 Sobic002G423200 Sobic002G423200 Sobic001G080900--Sobic002G423200 Sobic007G026000 Sobic007G026000 Sobic001G080900--Sobic007G026000 Sobic004G138000 Sobic004G138000 Sobic001G080900--Sobic004G138000 Sobic009G151200 Sobic009G151200 Sobic001G080900--Sobic009G151200 Sobic005G133500--Sobic009G151200 Sobic005G133500--Sobic002G423200 Sobic003G267800 Sobic003G267800 Sobic005G133500--Sobic003G267800 Sobic002G259800 Sobic002G259800 Sobic005G133500--Sobic002G259800 Sobic006G217200 Sobic006G217200 Sobic005G133500--Sobic006G217200 Sobic008G131000 Sobic008G131000 Sobic005G133500--Sobic008G131000 Sobic004G246100 Sobic004G246100 Sobic005G133500--Sobic004G246100 Sobic010G236400 Sobic010G236400 Sobic005G133500--Sobic010G236400 Sobic005G133500--Sobic001G080900 Sobic001G504200--Sobic010G201500 Sobic006G046700 Sobic006G046700 Sobic001G504200--Sobic006G046700 Sobic001G504200--Sobic008G153000 Sobic002G071500 Sobic002G071500 Sobic001G504200--Sobic002G071500 Sobic005G118600 Sobic005G118600 Sobic001G504200--Sobic005G118600 Sobic001G504200--Sobic008G084700 Sobic001G306900 Sobic001G306900 Sobic001G504200--Sobic001G306900 Sobic001G504200--Sobic004G246100 Sobic004G031700 Sobic004G031700 Sobic001G504200--Sobic004G031700 Sobic010G201500--Sobic002G071500 Sobic007G065400 Sobic007G065400 Sobic010G201500--Sobic007G065400 Sobic004G271000 Sobic004G271000 Sobic010G201500--Sobic004G271000 Sobic003G372700 Sobic003G372700 Sobic010G201500--Sobic003G372700 Sobic002G006900 Sobic002G006900 Sobic010G201500--Sobic002G006900 Sobic002G191800 Sobic002G191800 Sobic010G201500--Sobic002G191800 Sobic010G065300 Sobic010G065300 Sobic010G201500--Sobic010G065300 Sobic010G069100 Sobic010G069100 Sobic010G201500--Sobic010G069100 Sobic001G155000 Sobic001G155000 Sobic010G201500--Sobic001G155000 Sobic006G116100 Sobic006G116100 Sobic008G153000--Sobic006G116100 Sobic008G153000--Sobic006G046700 Sobic008G149800 Sobic008G149800 Sobic008G153000--Sobic008G149800 Sobic002G264200 Sobic002G264200 Sobic008G153000--Sobic002G264200 Sobic008G153000--Sobic001G155000 Sobic003G445400 Sobic003G445400 Sobic008G153000--Sobic003G445400 Sobic003G059750 Sobic003G059750 Sobic008G153000--Sobic003G059750 Sobic008G153000--Sobic007G026000 Sobic008G153000--Sobic010G069100 Sobic009G104201 Sobic009G104201 Sobic008G084700--Sobic009G104201 Sobic008G084700--Sobic003G372700 Sobic008G084700--Sobic005G118600 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic008G084700--Sobic004G007100 Sobic009G086900 Sobic009G086900 Sobic008G084700--Sobic009G086900 Sobic002G180666 Sobic002G180666 Sobic008G084700--Sobic002G180666 Sobic006G032500 Sobic006G032500 Sobic008G084700--Sobic006G032500 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic008G084700--Sobic002G243900 Sobic003G225700 Sobic003G225700 Sobic008G084700--Sobic003G225700 Sobic002G423200--Sobic002G259800 Sobic002G423200--Sobic005G133500 Sobic002G423200--Sobic004G246100 Sobic006G248500 Sobic006G248500 Sobic002G423200--Sobic006G248500 Sobic008G127400 Sobic008G127400 Sobic002G423200--Sobic008G127400 Sobic002G423200--Sobic010G236400 Sobic003G353600 Sobic003G353600 Sobic002G423200--Sobic003G353600 Sobic001G138400 Sobic001G138400 Sobic002G423200--Sobic001G138400 Sobic006G138000 Sobic006G138000 Sobic002G423200--Sobic006G138000 Sobic007G026000--Sobic008G153000 Sobic007G026000--Sobic006G046700 Sobic005G059100 Sobic005G059100 Sobic007G026000--Sobic005G059100 Sobic007G026000--Sobic003G445400 Sobic009G119000 Sobic009G119000 Sobic007G026000--Sobic009G119000 Sobic002G153700 Sobic002G153700 Sobic007G026000--Sobic002G153700 Sobic001G206100 Sobic001G206100 Sobic007G026000--Sobic001G206100 Sobic006G013500 Sobic006G013500 Sobic007G026000--Sobic006G013500 Sobic007G026000--Sobic004G031700 Sobic004G138000--Sobic001G306900 Sobic004G138000--Sobic010G201500 Sobic004G138000--Sobic007G065400 Sobic004G145500 Sobic004G145500 Sobic004G138000--Sobic004G145500 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic004G138000--Sobic001G094000 Sobic008G009700 Sobic008G009700 Sobic004G138000--Sobic008G009700 Sobic004G138000--Sobic010G065300 Sobic001G511500 Sobic001G511500 Sobic004G138000--Sobic001G511500 Sobic008G063000 Sobic008G063000 Sobic004G138000--Sobic008G063000 Sobic009G151200--Sobic006G248500 Sobic009G151200--Sobic002G259800 Sobic009G151200--Sobic005G133500 Sobic004G285000 Sobic004G285000 Sobic009G151200--Sobic004G285000 Sobic001G424600 Sobic001G424600 Sobic009G151200--Sobic001G424600 Sobic004G085300 Sobic004G085300 Sobic009G151200--Sobic004G085300 Sobic008G100100 Sobic008G100100 Sobic009G151200--Sobic008G100100 Sobic004G086200 Sobic004G086200 Sobic009G151200--Sobic004G086200 Sobic004G156500 Sobic004G156500 Sobic009G151200--Sobic004G156500
Octagon: transcription factors


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