Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G088000.2,Sobic.009G088000.1
Synonym Sb09g008110, WIT1
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6P7D3 , A0A1Z5R2M6
Pfam -
Panther DB PTHR35705 PTHR35705:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G11390 : WPP domain-interacting protein 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g15140.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a050865 , Zm00025a037170
Brachypodium KQK03471
Barley -
Wheat TraesCS7D02G038700 , TraesCS7A02G042800 , TraesCSU02G064900
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G002500 RCD1, putative, expressed -
2 Sobic.006G040800 expressed protein -
3 Sobic.002G126300 expressed protein -
4 Sobic.003G294600 Homeobox domain containing protein, expressed -
5 Sobic.003G164200 cullin, putative, expressed K03347: CUL1, cullin 1
6 Sobic.005G200900 SCC3, putative, expressed K06671: STAG1_2, SCC3, cohesin complex subunit SA-1/2
7 Sobic.002G137200 ZOS9-21 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
8 Sobic.004G355800 expressed protein -
9 Sobic.010G236400 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase domain containing protein, expressed K12847: USP39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2
10 Sobic.004G048800 - K12599: SKI2, antiviral helicase SKI2
11 Sobic.001G363500 DIRP family protein, putative, expressed -
12 Sobic.003G360400 ulp1 protease family protein, putative, expressed K08596: sentrin-specific protease 7
13 Sobic.008G098300 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, putative, expressed K11858: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48
14 Sobic.002G154000 EDM2, putative, expressed -
15 Sobic.009G040600 expressed protein K11647: SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 2/4
16 Sobic.001G065100 cullin, putative, expressed K10609: cullin 4
17 Sobic.005G191900 transporter family protein, putative, expressed -
18 Sobic.004G135400 expressed protein -
19 Sobic.001G334700 OsWAK28 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
20 Sobic.003G187500 ATP-binding region, ATPase-like domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G088000 Sobic009G088000 Sobic008G002500 Sobic008G002500 Sobic009G088000--Sobic008G002500 Sobic006G040800 Sobic006G040800 Sobic009G088000--Sobic006G040800 Sobic002G126300 Sobic002G126300 Sobic009G088000--Sobic002G126300 Sobic003G294600 Sobic003G294600 Sobic009G088000--Sobic003G294600 Sobic003G164200 Sobic003G164200 Sobic009G088000--Sobic003G164200 Sobic005G200900 Sobic005G200900 Sobic009G088000--Sobic005G200900 Sobic002G137200 Sobic002G137200 Sobic009G088000--Sobic002G137200 Sobic004G355800 Sobic004G355800 Sobic009G088000--Sobic004G355800 Sobic010G236400 Sobic010G236400 Sobic009G088000--Sobic010G236400 Sobic008G002500--Sobic006G040800 Sobic001G063700 Sobic001G063700 Sobic008G002500--Sobic001G063700 Sobic001G354600 Sobic001G354600 Sobic008G002500--Sobic001G354600 Sobic003G360400 Sobic003G360400 Sobic008G002500--Sobic003G360400 Sobic008G002500--Sobic009G088000 Sobic003G188400 Sobic003G188400 Sobic008G002500--Sobic003G188400 Sobic001G522600 Sobic001G522600 Sobic008G002500--Sobic001G522600 Sobic001G433800 Sobic001G433800 Sobic008G002500--Sobic001G433800 Sobic004G332400 Sobic004G332400 Sobic008G002500--Sobic004G332400 Sobic006G040800--Sobic008G002500 Sobic006G040800--Sobic001G063700 Sobic006G040800--Sobic004G332400 Sobic006G040800--Sobic009G088000 Sobic006G040800--Sobic003G360400 Sobic008G164600 Sobic008G164600 Sobic006G040800--Sobic008G164600 Sobic006G040800--Sobic001G354600 Sobic006G040800--Sobic001G433800 Sobic007G225100 Sobic007G225100 Sobic006G040800--Sobic007G225100 Sobic002G126300--Sobic009G088000 Sobic004G246100 Sobic004G246100 Sobic002G126300--Sobic004G246100 Sobic004G048800 Sobic004G048800 Sobic002G126300--Sobic004G048800 Sobic002G126300--Sobic008G002500 Sobic010G209400 Sobic010G209400 Sobic002G126300--Sobic010G209400 Sobic008G098300 Sobic008G098300 Sobic002G126300--Sobic008G098300 Sobic002G126300--Sobic010G236400 Sobic002G126300--Sobic001G522600 Sobic008G014500 Sobic008G014500 Sobic002G126300--Sobic008G014500 Sobic003G294600--Sobic008G002500 Sobic009G142000 Sobic009G142000 Sobic003G294600--Sobic009G142000 Sobic003G294600--Sobic009G088000 Sobic001G453000 Sobic001G453000 Sobic003G294600--Sobic001G453000 Sobic010G148932 Sobic010G148932 Sobic003G294600--Sobic010G148932 Sobic007G077900 Sobic007G077900 Sobic003G294600--Sobic007G077900 Sobic003G294600--Sobic006G040800 Sobic003G445500 Sobic003G445500 Sobic003G294600--Sobic003G445500 Sobic010G053600 Sobic010G053600 Sobic003G294600--Sobic010G053600 Sobic008G118200 Sobic008G118200 Sobic003G164200--Sobic008G118200 Sobic001G392300 Sobic001G392300 Sobic003G164200--Sobic001G392300 Sobic008G089100 Sobic008G089100 Sobic003G164200--Sobic008G089100 Sobic003G164200--Sobic009G088000 Sobic004G039600 Sobic004G039600 Sobic003G164200--Sobic004G039600 Sobic006G041600 Sobic006G041600 Sobic003G164200--Sobic006G041600 Sobic002G133300 Sobic002G133300 Sobic003G164200--Sobic002G133300 Sobic010G275500 Sobic010G275500 Sobic003G164200--Sobic010G275500 Sobic010G112100 Sobic010G112100 Sobic003G164200--Sobic010G112100 Sobic005G200900--Sobic004G355800 Sobic002G154000 Sobic002G154000 Sobic005G200900--Sobic002G154000 Sobic005G200900--Sobic003G360400 Sobic009G251500 Sobic009G251500 Sobic005G200900--Sobic009G251500 Sobic005G200900--Sobic009G088000 Sobic006G118700 Sobic006G118700 Sobic005G200900--Sobic006G118700 Sobic006G210000 Sobic006G210000 Sobic005G200900--Sobic006G210000 Sobic004G156500 Sobic004G156500 Sobic005G200900--Sobic004G156500 Sobic005G200900--Sobic008G002500 Sobic002G137200--Sobic009G088000 Sobic002G137200--Sobic001G354600 Sobic002G137200--Sobic008G002500 Sobic002G068100 Sobic002G068100 Sobic002G137200--Sobic002G068100 Sobic002G137200--Sobic001G522600 Sobic002G137200--Sobic004G048800 Sobic010G278800 Sobic010G278800 Sobic002G137200--Sobic010G278800 Sobic002G137200--Sobic002G126300 Sobic007G146100 Sobic007G146100 Sobic002G137200--Sobic007G146100 Sobic004G355800--Sobic005G200900 Sobic004G355800--Sobic006G118700 Sobic004G355800--Sobic006G210000 Sobic004G355800--Sobic002G154000 Sobic004G155600 Sobic004G155600 Sobic004G355800--Sobic004G155600 Sobic005G191900 Sobic005G191900 Sobic004G355800--Sobic005G191900 Sobic006G067600 Sobic006G067600 Sobic004G355800--Sobic006G067600 Sobic004G355800--Sobic004G156500 Sobic004G355800--Sobic008G002500 Sobic004G084300 Sobic004G084300 Sobic010G236400--Sobic004G084300 Sobic002G264200 Sobic002G264200 Sobic010G236400--Sobic002G264200 Sobic010G069100 Sobic010G069100 Sobic010G236400--Sobic010G069100 Sobic002G126500 Sobic002G126500 Sobic010G236400--Sobic002G126500 Sobic004G274200 Sobic004G274200 Sobic010G236400--Sobic004G274200 Sobic010G116600 Sobic010G116600 Sobic010G236400--Sobic010G116600 Sobic007G183900 Sobic007G183900 Sobic010G236400--Sobic007G183900 Sobic002G071500 Sobic002G071500 Sobic010G236400--Sobic002G071500 Sobic003G401100 Sobic003G401100 Sobic010G236400--Sobic003G401100
Octagon: transcription factors


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