Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G126300.2,Sobic.002G126300.1
Synonym Sb02g010890
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0W3P6 , A0A1B6QAX2
Pfam -
Panther DB PTHR36071 PTHR36071:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G40520 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g01600.2 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G088000 expressed protein -
2 Sobic.004G246100 nicalin, putative, expressed K06171: nicastrin
3 Sobic.004G048800 - K12599: SKI2, antiviral helicase SKI2
4 Sobic.008G002500 RCD1, putative, expressed -
5 Sobic.010G209400 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K03130: transcription initiation factor TFIID subunit 5
6 Sobic.008G098300 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, putative, expressed K11858: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48
7 Sobic.010G236400 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase domain containing protein, expressed K12847: USP39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2
8 Sobic.001G522600 PHD-finger domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.008G014500 RNA recognition motif containing protein, expressed K13161: heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R
10 Sobic.005G110409 - -
11 Sobic.001G542300 expressed protein -
12 Sobic.006G040800 expressed protein -
13 Sobic.002G260400 - -
14 Sobic.002G137200 ZOS9-21 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
15 Sobic.002G317200 uncharacterized ACR, COG1590 family protein, expressed K15450: tRNA wybutosine-synthesizing protein 3
16 Sobic.001G363500 DIRP family protein, putative, expressed -
17 Sobic.002G164300 ZOS9-03 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
18 Sobic.002G063900 zinc ion binding protein, putative, expressed -
19 Sobic.007G071200 KH domain-containing protein, putative, expressed K13162: poly(rC)-binding protein 2
20 Sobic.001G433800 lissencephaly type-1-like homology motif, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G126300 Sobic002G126300 Sobic009G088000 Sobic009G088000 Sobic002G126300--Sobic009G088000 Sobic004G246100 Sobic004G246100 Sobic002G126300--Sobic004G246100 Sobic004G048800 Sobic004G048800 Sobic002G126300--Sobic004G048800 Sobic008G002500 Sobic008G002500 Sobic002G126300--Sobic008G002500 Sobic010G209400 Sobic010G209400 Sobic002G126300--Sobic010G209400 Sobic008G098300 Sobic008G098300 Sobic002G126300--Sobic008G098300 Sobic010G236400 Sobic010G236400 Sobic002G126300--Sobic010G236400 Sobic001G522600 Sobic001G522600 Sobic002G126300--Sobic001G522600 Sobic008G014500 Sobic008G014500 Sobic002G126300--Sobic008G014500 Sobic009G088000--Sobic008G002500 Sobic006G040800 Sobic006G040800 Sobic009G088000--Sobic006G040800 Sobic009G088000--Sobic002G126300 Sobic003G294600 Sobic003G294600 Sobic009G088000--Sobic003G294600 Sobic003G164200 Sobic003G164200 Sobic009G088000--Sobic003G164200 Sobic005G200900 Sobic005G200900 Sobic009G088000--Sobic005G200900 Sobic002G137200 Sobic002G137200 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Octagon: transcription factors


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