Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G159900.1
Synonym Sb06g023680
Functional annotation DTA2, putative, expressed
UniProt C5YCX6
Pfam PF05686
Panther DB PTHR12203 PTHR12203:SF33
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G23850 : Arabidopsis thaliana protein of unknown function (DUF821)
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g45160.1 : DTA2, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a010436 , Zm00025a032137
Brachypodium PNT69133 , PNT69132 , PNT69131 , PNT69130 , KQK00519 , KQK00518
Barley -
Wheat TraesCS2A02G368900 , TraesCS2A02G368900 , TraesCS6B02G266000 , TraesCSU02G025200 , TraesCS2B02G093400 , TraesCS6D02G220200 , TraesCS6D02G220200 , TraesCS2B02G386200 , TraesCS6A02G237500 , TraesCS2D02G365600
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.006G159900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G128900 cyclin-dependent kinase G-2, putative, expressed K08818: cell division cycle 2-like
2 Sobic.001G477800 expressed protein -
3 Sobic.001G511500 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K12837: splicing factor U2AF 65 kDa subunit
4 Sobic.004G031700 expressed protein -
5 Sobic.005G177800 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
6 Sobic.007G000100 PWWP domain containing protein, expressed -
7 Sobic.001G543800 ethylene-responsive element-binding protein, putative, expressed -
8 Sobic.008G054500 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed -
9 Sobic.008G078100 EDM2, putative, expressed -
10 Sobic.003G445400 vacuolar fusion protein MON1 homolog A, putative, expressed -
11 Sobic.006G209850 - -
12 Sobic.001G544200 endonuclease, putative, expressed K10848: ERCC4, DNA excision repair protein ERCC-4
13 Sobic.001G464200 flap endonuclease, putative, expressed K10846: ERCC5, XPG, DNA excision repair protein ERCC-5
14 Sobic.008G024600 expressed protein -
15 Sobic.002G343800 - -
16 Sobic.005G045300 PX domain containing protein, putative, expressed K17925: sorting nexin-13
17 Sobic.006G080300 SET domain containing protein, expressed -
18 Sobic.009G040700 "OsPPKL2(Ortholog in rice:Zhan et al., 2012)"(PubMedID : 31659919)@serine/threonine protein phosphatase, putative, expressed K01090: protein phosphatase
19 Sobic.003G268300 surp module family protein, putative, expressed -
20 Sobic.002G053000 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic006G159900 Sobic006G159900 Sobic006G128900 Sobic006G128900 Sobic006G159900--Sobic006G128900 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic006G159900--Sobic001G477800 Sobic001G511500 Sobic001G511500 Sobic006G159900--Sobic001G511500 Sobic004G031700 Sobic004G031700 Sobic006G159900--Sobic004G031700 Sobic005G177800 Sobic005G177800 Sobic006G159900--Sobic005G177800 Sobic007G000100 Sobic007G000100 Sobic006G159900--Sobic007G000100 Sobic001G543800 Sobic001G543800 Sobic006G159900--Sobic001G543800 Sobic008G054500 Sobic008G054500 Sobic006G159900--Sobic008G054500 Sobic008G078100 Sobic008G078100 Sobic006G159900--Sobic008G078100 Sobic006G209850 Sobic006G209850 Sobic006G128900--Sobic006G209850 Sobic006G128900--Sobic001G511500 Sobic006G128900--Sobic004G031700 Sobic009G000500 Sobic009G000500 Sobic006G128900--Sobic009G000500 Sobic001G090400 Sobic001G090400 Sobic006G128900--Sobic001G090400 Sobic003G445400 Sobic003G445400 Sobic006G128900--Sobic003G445400 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic006G128900--Sobic003G268300 Sobic006G128900--Sobic001G477800 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic006G128900--Sobic002G157000 Sobic002G313300 Sobic002G313300 Sobic001G477800--Sobic002G313300 Sobic001G477800--Sobic004G031700 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic001G477800--Sobic001G094000 Sobic001G544200 Sobic001G544200 Sobic001G477800--Sobic001G544200 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic001G477800--Sobic001G543900 Sobic006G080300 Sobic006G080300 Sobic001G477800--Sobic006G080300 Sobic009G040700 Sobic009G040700 Sobic001G477800--Sobic009G040700 Sobic007G011400 Sobic007G011400 Sobic001G477800--Sobic007G011400 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic001G477800--Sobic006G009400 Sobic001G511500--Sobic007G000100 Sobic001G511500--Sobic006G209850 Sobic001G511500--Sobic006G128900 Sobic003G119000 Sobic003G119000 Sobic001G511500--Sobic003G119000 Sobic001G511500--Sobic004G031700 Sobic001G306900 Sobic001G306900 Sobic001G511500--Sobic001G306900 Sobic001G511500--Sobic003G445400 Sobic003G307000 Sobic003G307000 Sobic001G511500--Sobic003G307000 Sobic006G032400 Sobic006G032400 Sobic001G511500--Sobic006G032400 Sobic004G031700--Sobic009G000500 Sobic004G031700--Sobic003G445400 Sobic004G031700--Sobic001G544200 Sobic004G031700--Sobic001G477800 Sobic004G031700--Sobic006G080300 Sobic004G031700--Sobic006G128900 Sobic004G031700--Sobic001G094000 Sobic004G031700--Sobic001G511500 Sobic002G158700 Sobic002G158700 Sobic004G031700--Sobic002G158700 Sobic006G124900 Sobic006G124900 Sobic005G177800--Sobic006G124900 Sobic004G196700 Sobic004G196700 Sobic005G177800--Sobic004G196700 Sobic010G001600 Sobic010G001600 Sobic005G177800--Sobic010G001600 Sobic005G177800--Sobic001G543800 Sobic005G177800--Sobic004G031700 Sobic005G177800--Sobic001G477800 Sobic007G078000 Sobic007G078000 Sobic005G177800--Sobic007G078000 Sobic005G177800--Sobic002G313300 Sobic005G177800--Sobic009G000500 Sobic007G000100--Sobic001G511500 Sobic007G000100--Sobic003G307000 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic007G000100--Sobic008G173900 Sobic007G000100--Sobic003G445400 Sobic007G000100--Sobic003G119000 Sobic002G153700 Sobic002G153700 Sobic007G000100--Sobic002G153700 Sobic007G000100--Sobic009G000500 Sobic003G241800 Sobic003G241800 Sobic007G000100--Sobic003G241800 Sobic007G000100--Sobic004G031700 Sobic001G543800--Sobic010G001600 Sobic001G543800--Sobic005G177800 Sobic001G543800--Sobic006G128900 Sobic001G543800--Sobic006G124900 Sobic001G194900 Sobic001G194900 Sobic001G543800--Sobic001G194900 Sobic001G543800--Sobic004G196700 Sobic008G024600 Sobic008G024600 Sobic001G543800--Sobic008G024600 Sobic001G543800--Sobic009G040700 Sobic004G256600 Sobic004G256600 Sobic001G543800--Sobic004G256600 Sobic008G054500--Sobic008G173900 Sobic003G200200 Sobic003G200200 Sobic008G054500--Sobic003G200200 Sobic008G054500--Sobic003G268300 Sobic002G248400 Sobic002G248400 Sobic008G054500--Sobic002G248400 Sobic008G054500--Sobic008G078100 Sobic008G054500--Sobic002G157000 Sobic008G054500--Sobic003G445400 Sobic007G185900 Sobic007G185900 Sobic008G054500--Sobic007G185900 Sobic003G397800 Sobic003G397800 Sobic008G054500--Sobic003G397800 Sobic008G078100--Sobic001G094000 Sobic008G078100--Sobic008G054500 Sobic008G078100--Sobic009G040700 Sobic008G078100--Sobic001G477800 Sobic003G187400 Sobic003G187400 Sobic008G078100--Sobic003G187400 Sobic008G078100--Sobic001G544200 Sobic008G078100--Sobic007G185900 Sobic003G422300 Sobic003G422300 Sobic008G078100--Sobic003G422300 Sobic008G078100--Sobic004G196700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.