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Transcriptome id Sobic.002G343800.1
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UniProt C5XBM2
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cDNA sequences
Sobic.002G343800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G024600 expressed protein -
2 Sobic.006G128900 cyclin-dependent kinase G-2, putative, expressed K08818: cell division cycle 2-like
3 Sobic.005G177800 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
4 Sobic.001G543800 ethylene-responsive element-binding protein, putative, expressed -
5 Sobic.010G001600 homogentisate 1,2-dioxygenase, putative, expressed K00451: HGD, homogentisate 1,2-dioxygenase
6 Sobic.006G159900 DTA2, putative, expressed -
7 Sobic.009G135800 CUE domain containing protein, expressed -
8 Sobic.006G209850 - -
9 Sobic.009G040700 "OsPPKL2(Ortholog in rice:Zhan et al., 2012)"(PubMedID : 31659919)@serine/threonine protein phosphatase, putative, expressed K01090: protein phosphatase
10 Sobic.006G021250 - -
11 Sobic.006G124900 MA3 domain containing protein, expressed -
12 Sobic.010G276800 pollen signalling protein with adenylyl cyclase activity, putative, expressed -
13 Sobic.003G422300 recA protein, expressed K03553: recombination protein RecA
14 Sobic.003G268300 surp module family protein, putative, expressed -
15 Sobic.002G053000 expressed protein -
16 Sobic.001G477800 expressed protein -
17 Sobic.003G113200 5-nucleotidase domain-containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.005G013000 OsFBX181 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.003G174475 - -
20 Sobic.002G300400 serine/threonine-protein kinase CTR1, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G343800 Sobic002G343800 Sobic008G024600 Sobic008G024600 Sobic002G343800--Sobic008G024600 Sobic006G128900 Sobic006G128900 Sobic002G343800--Sobic006G128900 Sobic005G177800 Sobic005G177800 Sobic002G343800--Sobic005G177800 Sobic001G543800 Sobic001G543800 Sobic002G343800--Sobic001G543800 Sobic010G001600 Sobic010G001600 Sobic002G343800--Sobic010G001600 Sobic006G159900 Sobic006G159900 Sobic002G343800--Sobic006G159900 Sobic009G135800 Sobic009G135800 Sobic002G343800--Sobic009G135800 Sobic006G209850 Sobic006G209850 Sobic002G343800--Sobic006G209850 Sobic009G040700 Sobic009G040700 Sobic002G343800--Sobic009G040700 Sobic008G024600--Sobic006G209850 Sobic002G053000 Sobic002G053000 Sobic008G024600--Sobic002G053000 Sobic008G024600--Sobic006G128900 Sobic008G024600--Sobic009G040700 Sobic010G129200 Sobic010G129200 Sobic008G024600--Sobic010G129200 Sobic002G158700 Sobic002G158700 Sobic008G024600--Sobic002G158700 Sobic008G024600--Sobic002G343800 Sobic003G280800 Sobic003G280800 Sobic008G024600--Sobic003G280800 Sobic005G045300 Sobic005G045300 Sobic008G024600--Sobic005G045300 Sobic006G128900--Sobic006G209850 Sobic001G511500 Sobic001G511500 Sobic006G128900--Sobic001G511500 Sobic004G031700 Sobic004G031700 Sobic006G128900--Sobic004G031700 Sobic009G000500 Sobic009G000500 Sobic006G128900--Sobic009G000500 Sobic001G090400 Sobic001G090400 Sobic006G128900--Sobic001G090400 Sobic003G445400 Sobic003G445400 Sobic006G128900--Sobic003G445400 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic006G128900--Sobic003G268300 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic006G128900--Sobic001G477800 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic006G128900--Sobic002G157000 Sobic006G124900 Sobic006G124900 Sobic005G177800--Sobic006G124900 Sobic004G196700 Sobic004G196700 Sobic005G177800--Sobic004G196700 Sobic005G177800--Sobic010G001600 Sobic005G177800--Sobic001G543800 Sobic005G177800--Sobic004G031700 Sobic005G177800--Sobic001G477800 Sobic007G078000 Sobic007G078000 Sobic005G177800--Sobic007G078000 Sobic002G313300 Sobic002G313300 Sobic005G177800--Sobic002G313300 Sobic005G177800--Sobic009G000500 Sobic001G543800--Sobic010G001600 Sobic001G543800--Sobic005G177800 Sobic001G543800--Sobic006G128900 Sobic001G543800--Sobic006G124900 Sobic001G194900 Sobic001G194900 Sobic001G543800--Sobic001G194900 Sobic001G543800--Sobic004G196700 Sobic001G543800--Sobic008G024600 Sobic001G543800--Sobic009G040700 Sobic004G256600 Sobic004G256600 Sobic001G543800--Sobic004G256600 Sobic008G160700 Sobic008G160700 Sobic010G001600--Sobic008G160700 Sobic010G001600--Sobic006G124900 Sobic010G001600--Sobic001G194900 Sobic010G001600--Sobic005G177800 Sobic010G001600--Sobic001G543800 Sobic005G130200 Sobic005G130200 Sobic010G001600--Sobic005G130200 Sobic002G300400 Sobic002G300400 Sobic010G001600--Sobic002G300400 Sobic010G276800 Sobic010G276800 Sobic010G001600--Sobic010G276800 Sobic010G001600--Sobic008G024600 Sobic006G159900--Sobic006G128900 Sobic006G159900--Sobic001G477800 Sobic006G159900--Sobic001G511500 Sobic006G159900--Sobic004G031700 Sobic006G159900--Sobic005G177800 Sobic007G000100 Sobic007G000100 Sobic006G159900--Sobic007G000100 Sobic006G159900--Sobic001G543800 Sobic008G054500 Sobic008G054500 Sobic006G159900--Sobic008G054500 Sobic008G078100 Sobic008G078100 Sobic006G159900--Sobic008G078100 Sobic009G135800--Sobic004G031700 Sobic002G340100 Sobic002G340100 Sobic009G135800--Sobic002G340100 Sobic009G135800--Sobic008G024600 Sobic009G135800--Sobic006G128900 Sobic009G135800--Sobic002G053000 Sobic009G135800--Sobic003G445400 Sobic009G135800--Sobic002G158700 Sobic006G173100 Sobic006G173100 Sobic009G135800--Sobic006G173100 Sobic009G135800--Sobic009G000500 Sobic006G209850--Sobic006G128900 Sobic006G209850--Sobic001G511500 Sobic006G209850--Sobic003G280800 Sobic010G277500 Sobic010G277500 Sobic006G209850--Sobic010G277500 Sobic006G209850--Sobic008G024600 Sobic006G209850--Sobic002G053000 Sobic006G209850--Sobic010G129200 Sobic004G145500 Sobic004G145500 Sobic006G209850--Sobic004G145500 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic006G209850--Sobic002G243900 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic009G040700--Sobic001G094000 Sobic003G187400 Sobic003G187400 Sobic009G040700--Sobic003G187400 Sobic005G149500 Sobic005G149500 Sobic009G040700--Sobic005G149500 Sobic007G011400 Sobic007G011400 Sobic009G040700--Sobic007G011400 Sobic002G157300 Sobic002G157300 Sobic009G040700--Sobic002G157300 Sobic009G040700--Sobic001G477800 Sobic006G145000 Sobic006G145000 Sobic009G040700--Sobic006G145000 Sobic009G040700--Sobic004G196700 Sobic009G040700--Sobic008G078100
Octagon: transcription factors


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