Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G135800.1
Synonym Sb09g020160
Functional annotation CUE domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5R3I9
Pfam -
Panther DB PTHR16223 PTHR16223:SF12
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G02880 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g16440.1 : CUE domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a037454 , Zm00025a043674 , Zm00025a037453 , Zm00025a007539
Brachypodium KQK06287
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.009G135800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G031700 expressed protein -
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10 Sobic.007G096000 expressed protein -
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17 Sobic.002G343800 - -
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19 Sobic.004G270000 coatomer subunit delta, putative, expressed -
20 Sobic.010G190600 zinc finger A20 and AN1 domain-containing stress-associated protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G135800 Sobic009G135800 Sobic004G031700 Sobic004G031700 Sobic009G135800--Sobic004G031700 Sobic002G340100 Sobic002G340100 Sobic009G135800--Sobic002G340100 Sobic008G024600 Sobic008G024600 Sobic009G135800--Sobic008G024600 Sobic006G128900 Sobic006G128900 Sobic009G135800--Sobic006G128900 Sobic002G053000 Sobic002G053000 Sobic009G135800--Sobic002G053000 Sobic003G445400 Sobic003G445400 Sobic009G135800--Sobic003G445400 Sobic002G158700 Sobic002G158700 Sobic009G135800--Sobic002G158700 Sobic006G173100 Sobic006G173100 Sobic009G135800--Sobic006G173100 Sobic009G000500 Sobic009G000500 Sobic009G135800--Sobic009G000500 Sobic004G031700--Sobic009G000500 Sobic004G031700--Sobic003G445400 Sobic001G544200 Sobic001G544200 Sobic004G031700--Sobic001G544200 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic004G031700--Sobic001G477800 Sobic006G080300 Sobic006G080300 Sobic004G031700--Sobic006G080300 Sobic004G031700--Sobic006G128900 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic004G031700--Sobic001G094000 Sobic001G511500 Sobic001G511500 Sobic004G031700--Sobic001G511500 Sobic004G031700--Sobic002G158700 Sobic001G292200 Sobic001G292200 Sobic002G340100--Sobic001G292200 Sobic001G071400 Sobic001G071400 Sobic002G340100--Sobic001G071400 Sobic006G245400 Sobic006G245400 Sobic002G340100--Sobic006G245400 Sobic002G315200 Sobic002G315200 Sobic002G340100--Sobic002G315200 Sobic002G340100--Sobic009G135800 Sobic001G114000 Sobic001G114000 Sobic002G340100--Sobic001G114000 Sobic007G217000 Sobic007G217000 Sobic002G340100--Sobic007G217000 Sobic004G052900 Sobic004G052900 Sobic002G340100--Sobic004G052900 Sobic001G474600 Sobic001G474600 Sobic002G340100--Sobic001G474600 Sobic006G209850 Sobic006G209850 Sobic008G024600--Sobic006G209850 Sobic008G024600--Sobic002G053000 Sobic008G024600--Sobic006G128900 Sobic009G040700 Sobic009G040700 Sobic008G024600--Sobic009G040700 Sobic010G129200 Sobic010G129200 Sobic008G024600--Sobic010G129200 Sobic008G024600--Sobic002G158700 Sobic002G343800 Sobic002G343800 Sobic008G024600--Sobic002G343800 Sobic003G280800 Sobic003G280800 Sobic008G024600--Sobic003G280800 Sobic005G045300 Sobic005G045300 Sobic008G024600--Sobic005G045300 Sobic006G128900--Sobic006G209850 Sobic006G128900--Sobic001G511500 Sobic006G128900--Sobic004G031700 Sobic006G128900--Sobic009G000500 Sobic001G090400 Sobic001G090400 Sobic006G128900--Sobic001G090400 Sobic006G128900--Sobic003G445400 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic006G128900--Sobic003G268300 Sobic006G128900--Sobic001G477800 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic006G128900--Sobic002G157000 Sobic002G053000--Sobic008G024600 Sobic002G053000--Sobic003G280800 Sobic002G053000--Sobic006G209850 Sobic002G053000--Sobic006G128900 Sobic009G210500 Sobic009G210500 Sobic002G053000--Sobic009G210500 Sobic002G053000--Sobic010G129200 Sobic002G053000--Sobic003G445400 Sobic007G167500 Sobic007G167500 Sobic002G053000--Sobic007G167500 Sobic002G053000--Sobic005G045300 Sobic003G445400--Sobic004G031700 Sobic003G445400--Sobic009G000500 Sobic008G067600 Sobic008G067600 Sobic003G445400--Sobic008G067600 Sobic003G307000 Sobic003G307000 Sobic003G445400--Sobic003G307000 Sobic003G445400--Sobic002G158700 Sobic003G445400--Sobic006G128900 Sobic007G096000 Sobic007G096000 Sobic003G445400--Sobic007G096000 Sobic003G445400--Sobic001G511500 Sobic008G153000 Sobic008G153000 Sobic003G445400--Sobic008G153000 Sobic003G401000 Sobic003G401000 Sobic002G158700--Sobic003G401000 Sobic001G464200 Sobic001G464200 Sobic002G158700--Sobic001G464200 Sobic001G167200 Sobic001G167200 Sobic002G158700--Sobic001G167200 Sobic002G158700--Sobic004G031700 Sobic002G158700--Sobic003G445400 Sobic007G000800 Sobic007G000800 Sobic002G158700--Sobic007G000800 Sobic007G061700 Sobic007G061700 Sobic002G158700--Sobic007G061700 Sobic008G149800 Sobic008G149800 Sobic002G158700--Sobic008G149800 Sobic002G396000 Sobic002G396000 Sobic002G158700--Sobic002G396000 Sobic006G173100--Sobic001G090400 Sobic002G157300 Sobic002G157300 Sobic006G173100--Sobic002G157300 Sobic003G187400 Sobic003G187400 Sobic006G173100--Sobic003G187400 Sobic002G197100 Sobic002G197100 Sobic006G173100--Sobic002G197100 Sobic004G021100 Sobic004G021100 Sobic006G173100--Sobic004G021100 Sobic006G032400 Sobic006G032400 Sobic006G173100--Sobic006G032400 Sobic001G512700 Sobic001G512700 Sobic006G173100--Sobic001G512700 Sobic004G067700 Sobic004G067700 Sobic006G173100--Sobic004G067700 Sobic002G370900 Sobic002G370900 Sobic006G173100--Sobic002G370900 Sobic009G000500--Sobic004G031700 Sobic009G000500--Sobic003G445400 Sobic002G320500 Sobic002G320500 Sobic009G000500--Sobic002G320500 Sobic009G000500--Sobic006G128900 Sobic006G133800 Sobic006G133800 Sobic009G000500--Sobic006G133800 Sobic009G000500--Sobic001G090400 Sobic009G000500--Sobic003G307000 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic009G000500--Sobic008G173900 Sobic001G206100 Sobic001G206100 Sobic009G000500--Sobic001G206100
Octagon: transcription factors


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