Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G261521.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A109NDT4 , C6JRR6 , A0A1Z5S7M6 , C6JRR5 , A0A125QUI9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g01140.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a040585 , Zm00025a040580 , Zm00025a040588
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G006500 MBTB44 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
2 Sobic.004G239901 - -
3 Sobic.010G152850 - -
4 Sobic.003G185250 - -
5 Sobic.009G239351 - -
6 Sobic.001G245900 expressed protein -
7 Sobic.001G511500 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K12837: splicing factor U2AF 65 kDa subunit
8 Sobic.009G100050 - -
9 Sobic.002G060450 - -
10 Sobic.002G144966 - K02997: RP-S9e, small subunit ribosomal protein S9e
11 Sobic.001G303675 - -
12 Sobic.010G000100 no apical meristem protein, putative, expressed -
13 Sobic.002G154551 - -
14 Sobic.001G454301 - -
15 Sobic.003G422300 recA protein, expressed K03553: recombination protein RecA
16 Sobic.003G163100 expressed protein K08819: cyclin-dependent kinase 12/13
17 Sobic.009G178800 bZIP transcription factor, putative, expressed K14432: ABA responsive element binding factor
18 Sobic.006G032400 expressed protein -
19 Sobic.003G088700 - -
20 Sobic.005G077466 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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