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Transcriptome id Sobic.004G239901.1
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UniProt A0A194YRI8
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G396000 XPA-binding protein 2, putative, expressed K12867: SYF1, pre-mRNA-splicing factor SYF1
2 Sobic.001G261521 - -
3 Sobic.009G100050 - -
4 Sobic.010G000100 no apical meristem protein, putative, expressed -
5 Sobic.001G511500 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K12837: splicing factor U2AF 65 kDa subunit
6 Sobic.001G094000 expressed protein -
7 Sobic.001G303675 - -
8 Sobic.003G258900 ZOS3-17 - C2H2 zinc finger protein, expressed K12827: SF3A3, SAP61, splicing factor 3A subunit 3
9 Sobic.005G077466 - -
10 Sobic.010G056000 GAGA-binding protein, putative, expressed -
11 Sobic.001G306900 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed K12600: SKI3, superkiller protein 3
12 Sobic.001G245900 expressed protein -
13 Sobic.010G209400 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K03130: transcription initiation factor TFIID subunit 5
14 Sobic.007G071950 - -
15 Sobic.001G454301 - -
16 Sobic.005G110523 - -
17 Sobic.005G157100 THUMP domain-containing protein, putative, expressed K06963: TAN1, tRNA acetyltransferase TAN1
18 Sobic.003G422300 recA protein, expressed K03553: recombination protein RecA
19 Sobic.001G267900 - -
20 Sobic.008G131000 domain of unknown function family protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G239901 Sobic004G239901 Sobic002G396000 Sobic002G396000 Sobic004G239901--Sobic002G396000 Sobic001G261521 Sobic001G261521 Sobic004G239901--Sobic001G261521 Sobic009G100050 Sobic009G100050 Sobic004G239901--Sobic009G100050 Sobic010G000100 Sobic010G000100 Sobic004G239901--Sobic010G000100 Sobic001G511500 Sobic001G511500 Sobic004G239901--Sobic001G511500 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic004G239901--Sobic001G094000 Sobic001G303675 Sobic001G303675 Sobic004G239901--Sobic001G303675 Sobic003G258900 Sobic003G258900 Sobic004G239901--Sobic003G258900 Sobic005G077466 Sobic005G077466 Sobic004G239901--Sobic005G077466 Sobic002G158700 Sobic002G158700 Sobic002G396000--Sobic002G158700 Sobic006G128900 Sobic006G128900 Sobic002G396000--Sobic006G128900 Sobic007G096000 Sobic007G096000 Sobic002G396000--Sobic007G096000 Sobic003G280800 Sobic003G280800 Sobic002G396000--Sobic003G280800 Sobic002G396000--Sobic001G511500 Sobic009G210500 Sobic009G210500 Sobic002G396000--Sobic009G210500 Sobic004G018300 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Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic005G077466--Sobic008G173900
Octagon: transcription factors


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