Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G000100.1
Synonym NTL9
Functional annotation no apical meristem protein, putative, expressed
UniProt C5Z212
Pfam PF02365
Panther DB PTHR31989 PTHR31989:SF10
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006355; regulation of transcription, DNA-templated GO:0003677DNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G35580 : NAC transcription factor-like 9
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g01230.1 : no apical meristem protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a049194 , Zm00025a050352 , Zm00025a051844 , Zm00025a011117 , Zm00025a009747
Brachypodium KQJ82981 , KQJ82980 , KQJ97887
Barley HORVU7Hr1G000910.4 , HORVU7Hr1G000910.3 , HORVU7Hr1G000910.2 , HORVU7Hr1G000910.1
Wheat TraesCS7A02G000300 , TraesCS7D02G000200 , TraesCS4A02G499900 , TraesCS4A02G499900
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.010G000100


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G307000 RNA recognition motif containing protein, expressed K18667: activating signal cointegrator complex subunit 2
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19 Sobic.006G209850 - -
20 Sobic.002G151600 R-interacting factor 1, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G000100 Sobic010G000100 Sobic003G307000 Sobic003G307000 Sobic010G000100--Sobic003G307000 Sobic002G396000 Sobic002G396000 Sobic010G000100--Sobic002G396000 Sobic001G511500 Sobic001G511500 Sobic010G000100--Sobic001G511500 Sobic001G303675 Sobic001G303675 Sobic010G000100--Sobic001G303675 Sobic009G000500 Sobic009G000500 Sobic010G000100--Sobic009G000500 Sobic006G128900 Sobic006G128900 Sobic010G000100--Sobic006G128900 Sobic004G031700 Sobic004G031700 Sobic010G000100--Sobic004G031700 Sobic001G306900 Sobic001G306900 Sobic010G000100--Sobic001G306900 Sobic002G144966 Sobic002G144966 Sobic010G000100--Sobic002G144966 Sobic007G000100 Sobic007G000100 Sobic003G307000--Sobic007G000100 Sobic002G153700 Sobic002G153700 Sobic003G307000--Sobic002G153700 Sobic003G445400 Sobic003G445400 Sobic003G307000--Sobic003G445400 Sobic003G307000--Sobic009G000500 Sobic003G307000--Sobic001G511500 Sobic003G307000--Sobic001G306900 Sobic003G307000--Sobic004G031700 Sobic003G394300 Sobic003G394300 Sobic003G307000--Sobic003G394300 Sobic010G065300 Sobic010G065300 Sobic003G307000--Sobic010G065300 Sobic002G158700 Sobic002G158700 Sobic002G396000--Sobic002G158700 Sobic002G396000--Sobic006G128900 Sobic007G096000 Sobic007G096000 Sobic002G396000--Sobic007G096000 Sobic003G280800 Sobic003G280800 Sobic002G396000--Sobic003G280800 Sobic002G396000--Sobic001G511500 Sobic009G210500 Sobic009G210500 Sobic002G396000--Sobic009G210500 Sobic004G018300 Sobic004G018300 Sobic002G396000--Sobic004G018300 Sobic008G131000 Sobic008G131000 Sobic002G396000--Sobic008G131000 Sobic001G090400 Sobic001G090400 Sobic002G396000--Sobic001G090400 Sobic001G511500--Sobic007G000100 Sobic006G209850 Sobic006G209850 Sobic001G511500--Sobic006G209850 Sobic001G511500--Sobic006G128900 Sobic003G119000 Sobic003G119000 Sobic001G511500--Sobic003G119000 Sobic001G511500--Sobic004G031700 Sobic001G511500--Sobic001G306900 Sobic001G511500--Sobic003G445400 Sobic001G511500--Sobic003G307000 Sobic006G032400 Sobic006G032400 Sobic001G511500--Sobic006G032400 Sobic001G303675--Sobic001G306900 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic001G303675--Sobic001G094000 Sobic002G144933 Sobic002G144933 Sobic001G303675--Sobic002G144933 Sobic009G100050 Sobic009G100050 Sobic001G303675--Sobic009G100050 Sobic005G015900 Sobic005G015900 Sobic001G303675--Sobic005G015900 Sobic002G320500 Sobic002G320500 Sobic001G303675--Sobic002G320500 Sobic004G096500 Sobic004G096500 Sobic001G303675--Sobic004G096500 Sobic002G151600 Sobic002G151600 Sobic001G303675--Sobic002G151600 Sobic003G170100 Sobic003G170100 Sobic001G303675--Sobic003G170100 Sobic009G000500--Sobic004G031700 Sobic009G000500--Sobic003G445400 Sobic009G000500--Sobic002G320500 Sobic009G000500--Sobic006G128900 Sobic006G133800 Sobic006G133800 Sobic009G000500--Sobic006G133800 Sobic009G000500--Sobic001G090400 Sobic009G000500--Sobic003G307000 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic009G000500--Sobic008G173900 Sobic001G206100 Sobic001G206100 Sobic009G000500--Sobic001G206100 Sobic006G128900--Sobic006G209850 Sobic006G128900--Sobic001G511500 Sobic006G128900--Sobic004G031700 Sobic006G128900--Sobic009G000500 Sobic006G128900--Sobic001G090400 Sobic006G128900--Sobic003G445400 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic006G128900--Sobic003G268300 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic006G128900--Sobic001G477800 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic006G128900--Sobic002G157000 Sobic004G031700--Sobic009G000500 Sobic004G031700--Sobic003G445400 Sobic001G544200 Sobic001G544200 Sobic004G031700--Sobic001G544200 Sobic004G031700--Sobic001G477800 Sobic006G080300 Sobic006G080300 Sobic004G031700--Sobic006G080300 Sobic004G031700--Sobic006G128900 Sobic004G031700--Sobic001G094000 Sobic004G031700--Sobic001G511500 Sobic004G031700--Sobic002G158700 Sobic004G138000 Sobic004G138000 Sobic001G306900--Sobic004G138000 Sobic001G306900--Sobic010G065300 Sobic001G306900--Sobic001G303675 Sobic007G065400 Sobic007G065400 Sobic001G306900--Sobic007G065400 Sobic001G306900--Sobic001G511500 Sobic004G145500 Sobic004G145500 Sobic001G306900--Sobic004G145500 Sobic001G306900--Sobic002G153700 Sobic006G013500 Sobic006G013500 Sobic001G306900--Sobic006G013500 Sobic001G306900--Sobic001G094000 Sobic001G464200 Sobic001G464200 Sobic002G144966--Sobic001G464200 Sobic006G262200 Sobic006G262200 Sobic002G144966--Sobic006G262200 Sobic005G077466 Sobic005G077466 Sobic002G144966--Sobic005G077466 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic002G144966--Sobic001G111900 Sobic003G087400 Sobic003G087400 Sobic002G144966--Sobic003G087400 Sobic009G065100 Sobic009G065100 Sobic002G144966--Sobic009G065100 Sobic006G076300 Sobic006G076300 Sobic002G144966--Sobic006G076300 Sobic004G039700 Sobic004G039700 Sobic002G144966--Sobic004G039700 Sobic002G144966--Sobic001G511500
Octagon: transcription factors


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