Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G186850.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt C6JSJ0 , A0A1Z5S6D6 , A0A120GUL6
Pfam PF07762
Panther DB PTHR33074 PTHR33074:SF8
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g29090.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G439501 - -
2 Sobic.007G010000 OsFBL6 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
3 Sobic.005G096700 - -
4 Sobic.001G283000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@-(PubMedID : 26976818)@lrgB-like family protein, expressed -
5 Sobic.002G363000 csAtPR5, putative, expressed -
6 Sobic.003G036500 fruit protein PKIWI502, putative, expressed -
7 Sobic.002G400300 expressed protein -
8 Sobic.004G305200 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.004G351100 signal peptide peptidase-like 2B, putative, expressed K09597: signal peptide peptidase-like 2B
10 Sobic.007G037301 - -
11 Sobic.001G014100 expressed protein -
12 Sobic.006G174975 - -
13 Sobic.003G374500 pentatricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.002G289000 expressed protein -
15 Sobic.001G251200 phospholipid-transporting ATPase, putative, expressed K14802: DRS2, phospholipid-transporting ATPase
16 Sobic.003G436000 expressed protein -
17 Sobic.003G362600 AT hook motif family protein, expressed K15200: general transcription factor 3C polypeptide 2
18 Sobic.002G400900 expressed protein -
19 Sobic.004G010800 - -
20 Sobic.010G116700 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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