Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G439501.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W1G3
Pfam PF12274
Panther DB PTHR33120 PTHR33120:SF11
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g09850.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK21092 , KQK21091
Barley -
Wheat TraesCS6D02G014000 , TraesCS7A02G079000 , TraesCS7A02G079000 , TraesCS6B02G017600
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G028901 - -
2 Sobic.001G186850 - -
3 Sobic.003G088700 - -
4 Sobic.001G111900 - -
5 Sobic.004G039700 OsFBX188 - F-box domain containing protein, expressed -
6 Sobic.007G189500 - -
7 Sobic.004G003501 - -
8 Sobic.006G051700 WRKY123, expressed -
9 Sobic.010G056000 GAGA-binding protein, putative, expressed -
10 Sobic.005G015100 OsFBX291 - F-box domain containing protein, expressed -
11 Sobic.008G125600 - -
12 Sobic.007G010000 OsFBL6 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
13 Sobic.001G186500 expressed protein -
14 Sobic.007G216700 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed -
15 Sobic.010G235600 OsFBLD1 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
16 Sobic.003G205801 - -
17 Sobic.007G096000 expressed protein -
18 Sobic.002G144966 - K02997: RP-S9e, small subunit ribosomal protein S9e
19 Sobic.005G019600 rp3 protein, putative, expressed -
20 Sobic.003G084900 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic003G439501 Sobic003G439501 Sobic009G028901 Sobic009G028901 Sobic003G439501--Sobic009G028901 Sobic001G186850 Sobic001G186850 Sobic003G439501--Sobic001G186850 Sobic003G088700 Sobic003G088700 Sobic003G439501--Sobic003G088700 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic003G439501--Sobic001G111900 Sobic004G039700 Sobic004G039700 Sobic003G439501--Sobic004G039700 Sobic007G189500 Sobic007G189500 Sobic003G439501--Sobic007G189500 Sobic004G003501 Sobic004G003501 Sobic003G439501--Sobic004G003501 Sobic006G051700 Sobic006G051700 Sobic003G439501--Sobic006G051700 Sobic010G056000 Sobic010G056000 Sobic003G439501--Sobic010G056000 Sobic006G215900 Sobic006G215900 Sobic009G028901--Sobic006G215900 Sobic009G028901--Sobic003G439501 Sobic009G251200 Sobic009G251200 Sobic009G028901--Sobic009G251200 Sobic003G133900 Sobic003G133900 Sobic009G028901--Sobic003G133900 Sobic008G098600 Sobic008G098600 Sobic009G028901--Sobic008G098600 Sobic009G028901--Sobic004G039700 Sobic009G137100 Sobic009G137100 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Octagon: transcription factors


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