Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G010000.1
Synonym
Functional annotation OsFBL6 - F-box domain and LRR containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PEV1
Pfam -
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF85
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G03100 : F-box/RNI-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g01550.1 : OsFBL6 - F-box domain and LRR containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.007G010000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G319400 - -
2 Sobic.001G127000 alkaline phytoceramidase, putative, expressed K04711: ACER3, dihydroceramidase
3 Sobic.009G229600 tRNA-binding arm, putative, expressed -
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6 Sobic.003G126600 rab GDP dissociation inhibitor alpha, putative, expressed -
7 Sobic.004G072100 centromere/kinetochore protein zw10, putative, expressed K11578: ZW10, protein transport protein DSL1/ZW10
8 Sobic.001G096000 CWF19-like 2, cell cycle control, putative, expressed -
9 Sobic.003G427600 villin protein, putative, expressed -
10 Sobic.004G135300 - -
11 Sobic.006G281700 DUF803 domain containing, putative, expressed -
12 Sobic.004G068500 CUE domain containing protein, expressed -
13 Sobic.007G041500 diacylglycerol kinase, putative, expressed -
14 Sobic.003G270600 adaptor complexes medium subunit family domain containing protein, expressed K12393: AP-1 complex subunit mu
15 Sobic.008G003900 - -
16 Sobic.002G067100 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K14411: RNA-binding protein Musashi
17 Sobic.007G213000 beta 1,2-xylosyltransferase, putative, expressed K03714: glycoprotein 2-beta-D-xylosyltransferase
18 Sobic.004G002100 G-protein alpha subunit, putative, expressed -
19 Sobic.004G351100 signal peptide peptidase-like 2B, putative, expressed K09597: signal peptide peptidase-like 2B
20 Sobic.001G281100 START domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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