Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G003900.1,Sobic.008G003900.2,Sobic.008G003900.3
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PAR7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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cDNA sequences
Sobic.008G003900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G189500 - -
2 Sobic.002G116800 expressed protein -
3 Sobic.007G010000 OsFBL6 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
4 Sobic.007G105400 ubiquitin-conjugating enzyme, putative, expressed K10579: UBE2M, ubiquitin-conjugating enzyme E2 M
5 Sobic.002G273700 Upregulated in cold susceptible sorghum under stress(PubMedID : 26645959)@cytochrome P450, putative, expressed -
6 Sobic.006G213500 potassium transporter, putative, expressed K03549: KUP system potassium uptake protein
7 Sobic.001G101100 mitochondrial carrier protein, putative, expressed K15115: SLC25A32, solute carrier family 25 (mitochondrial folate transporter), member 32
8 Sobic.009G008100 lysine ketoglutarate reductase trans-splicing related 1, putative, expressed -
9 Sobic.003G086900 C2 domain containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.004G004200 expressed protein -
11 Sobic.001G284800 histone H3, putative, expressed K11253: histone H3
12 Sobic.004G337200 dehydrogenase, putative, expressed -
13 Sobic.004G119100 expressed protein -
14 Sobic.004G347400 pumilio-family RNA binding protein, putative, expressed K17943: pumilio RNA-binding family
15 Sobic.001G413200 expressed protein -
16 Sobic.007G203300 CDK-activating kinase assembly factor MAT1 family protein, expressed K10842: CDK-activating kinase assembly factor MAT1
17 Sobic.002G373100 strictosidine synthase, putative, expressed -
18 Sobic.007G216700 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed -
19 Sobic.004G135300 - -
20 Sobic.006G043300 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G003900 Sobic008G003900 Sobic007G189500 Sobic007G189500 Sobic008G003900--Sobic007G189500 Sobic002G116800 Sobic002G116800 Sobic008G003900--Sobic002G116800 Sobic007G010000 Sobic007G010000 Sobic008G003900--Sobic007G010000 Sobic007G105400 Sobic007G105400 Sobic008G003900--Sobic007G105400 Sobic002G273700 Sobic002G273700 Sobic008G003900--Sobic002G273700 Sobic006G213500 Sobic006G213500 Sobic008G003900--Sobic006G213500 Sobic001G101100 Sobic001G101100 Sobic008G003900--Sobic001G101100 Sobic009G008100 Sobic009G008100 Sobic008G003900--Sobic009G008100 Sobic003G086900 Sobic003G086900 Sobic008G003900--Sobic003G086900 Sobic007G189500--Sobic002G116800 Sobic007G189500--Sobic001G101100 Sobic007G189500--Sobic008G003900 Sobic004G119100 Sobic004G119100 Sobic007G189500--Sobic004G119100 Sobic010G276900 Sobic010G276900 Sobic007G189500--Sobic010G276900 Sobic010G080100 Sobic010G080100 Sobic007G189500--Sobic010G080100 Sobic005G019600 Sobic005G019600 Sobic007G189500--Sobic005G019600 Sobic009G233300 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Octagon: transcription factors


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