Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G096700.2,Sobic.005G096700.3,Sobic.005G096700.4
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PRC4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G112000 3,4-dihydroxy-2-butanone kinase, putative, expressed K00863: DAK, triose/dihydroxyacetone kinase / FAD-AMP lyase (cyclizing)
2 Sobic.009G183000 - -
3 Sobic.002G110300 Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@UBX domain-containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.008G031300 nucleotidyltransferase, putative, expressed -
5 Sobic.002G079801 - -
6 Sobic.006G199700 ara54-like RING finger protein, putative, expressed K11971: RNF14, E3 ubiquitin-protein ligase RNF14
7 Sobic.006G251000 STE_MEKK_ste11_MAP3K.1 - STE kinases include homologs to sterile 7, sterile 11 and sterile 20 from yeast, expressed -
8 Sobic.001G095500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@transcription factor(PubMedID : 30367619)@WRKY121, expressed -
9 Sobic.006G174975 - -
10 Sobic.009G099200 VHS and GAT domain containing protein, expressed -
11 Sobic.001G140200 Homeobox domain containing protein, expressed -
12 Sobic.002G019750 - -
13 Sobic.002G342100 no apical meristem protein, putative, expressed -
14 Sobic.001G186850 - -
15 Sobic.008G044750 - -
16 Sobic.003G272400 DUF292 domain containing protein, expressed -
17 Sobic.008G010900 DNA repair protein Rad51, putative, expressed K10872: meiotic recombination protein DMC1
18 Sobic.003G198150 - -
19 Sobic.005G096800 - -
20 Sobic.009G128300 CUE domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G096700 Sobic005G096700 Sobic001G112000 Sobic001G112000 Sobic005G096700--Sobic001G112000 Sobic009G183000 Sobic009G183000 Sobic005G096700--Sobic009G183000 Sobic002G110300 Sobic002G110300 Sobic005G096700--Sobic002G110300 Sobic008G031300 Sobic008G031300 Sobic005G096700--Sobic008G031300 Sobic002G079801 Sobic002G079801 Sobic005G096700--Sobic002G079801 Sobic006G199700 Sobic006G199700 Sobic005G096700--Sobic006G199700 Sobic006G251000 Sobic006G251000 Sobic005G096700--Sobic006G251000 Sobic001G095500 Sobic001G095500 Sobic005G096700--Sobic001G095500 Sobic006G174975 Sobic006G174975 Sobic005G096700--Sobic006G174975 Sobic002G342100 Sobic002G342100 Sobic001G112000--Sobic002G342100 Sobic009G128300 Sobic009G128300 Sobic001G112000--Sobic009G128300 Sobic001G112000--Sobic008G031300 Sobic003G227600 Sobic003G227600 Sobic001G112000--Sobic003G227600 Sobic004G211301 Sobic004G211301 Sobic001G112000--Sobic004G211301 Sobic001G509400 Sobic001G509400 Sobic001G112000--Sobic001G509400 Sobic002G331450 Sobic002G331450 Sobic001G112000--Sobic002G331450 Sobic002G182800 Sobic002G182800 Sobic001G112000--Sobic002G182800 Sobic001G112000--Sobic005G096700 Sobic010G260300 Sobic010G260300 Sobic009G183000--Sobic010G260300 Sobic009G183000--Sobic002G079801 Sobic003G198150 Sobic003G198150 Sobic009G183000--Sobic003G198150 Sobic009G183000--Sobic002G110300 Sobic008G044750 Sobic008G044750 Sobic009G183000--Sobic008G044750 Sobic009G183000--Sobic009G128300 Sobic009G183000--Sobic008G031300 Sobic009G183000--Sobic001G095500 Sobic007G025800 Sobic007G025800 Sobic009G183000--Sobic007G025800 Sobic007G037301 Sobic007G037301 Sobic002G110300--Sobic007G037301 Sobic002G110300--Sobic001G095500 Sobic002G110300--Sobic009G183000 Sobic010G089100 Sobic010G089100 Sobic002G110300--Sobic010G089100 Sobic001G083800 Sobic001G083800 Sobic002G110300--Sobic001G083800 Sobic004G226600 Sobic004G226600 Sobic002G110300--Sobic004G226600 Sobic003G119800 Sobic003G119800 Sobic002G110300--Sobic003G119800 Sobic007G006900 Sobic007G006900 Sobic002G110300--Sobic007G006900 Sobic002G134600 Sobic002G134600 Sobic002G110300--Sobic002G134600 Sobic008G031300--Sobic001G509400 Sobic008G031300--Sobic001G112000 Sobic008G031300--Sobic008G044750 Sobic008G031300--Sobic004G211301 Sobic008G031300--Sobic009G128300 Sobic008G031300--Sobic002G331450 Sobic002G325600 Sobic002G325600 Sobic008G031300--Sobic002G325600 Sobic003G066900 Sobic003G066900 Sobic008G031300--Sobic003G066900 Sobic010G085400 Sobic010G085400 Sobic008G031300--Sobic010G085400 Sobic003G079800 Sobic003G079800 Sobic002G079801--Sobic003G079800 Sobic002G079801--Sobic008G044750 Sobic001G184500 Sobic001G184500 Sobic002G079801--Sobic001G184500 Sobic002G079801--Sobic003G198150 Sobic002G079801--Sobic009G183000 Sobic001G140200 Sobic001G140200 Sobic002G079801--Sobic001G140200 Sobic002G079801--Sobic009G128300 Sobic010G101700 Sobic010G101700 Sobic002G079801--Sobic010G101700 Sobic002G079801--Sobic001G509400 Sobic003G435400 Sobic003G435400 Sobic006G199700--Sobic003G435400 Sobic002G373600 Sobic002G373600 Sobic006G199700--Sobic002G373600 Sobic003G385000 Sobic003G385000 Sobic006G199700--Sobic003G385000 Sobic001G284425 Sobic001G284425 Sobic006G199700--Sobic001G284425 Sobic006G069200 Sobic006G069200 Sobic006G199700--Sobic006G069200 Sobic003G223800 Sobic003G223800 Sobic006G199700--Sobic003G223800 Sobic008G010900 Sobic008G010900 Sobic006G199700--Sobic008G010900 Sobic004G098800 Sobic004G098800 Sobic006G199700--Sobic004G098800 Sobic002G019750 Sobic002G019750 Sobic006G199700--Sobic002G019750 Sobic001G251200 Sobic001G251200 Sobic006G251000--Sobic001G251200 Sobic007G180600 Sobic007G180600 Sobic006G251000--Sobic007G180600 Sobic001G477700 Sobic001G477700 Sobic006G251000--Sobic001G477700 Sobic001G096000 Sobic001G096000 Sobic006G251000--Sobic001G096000 Sobic005G143900 Sobic005G143900 Sobic006G251000--Sobic005G143900 Sobic001G538700 Sobic001G538700 Sobic006G251000--Sobic001G538700 Sobic007G196900 Sobic007G196900 Sobic006G251000--Sobic007G196900 Sobic006G251000--Sobic002G134600 Sobic006G251000--Sobic002G110300 Sobic001G095500--Sobic002G110300 Sobic001G095500--Sobic001G251200 Sobic001G095500--Sobic007G196900 Sobic001G095500--Sobic001G538700 Sobic001G095500--Sobic009G183000 Sobic007G047700 Sobic007G047700 Sobic001G095500--Sobic007G047700 Sobic001G037150 Sobic001G037150 Sobic001G095500--Sobic001G037150 Sobic001G095500--Sobic006G251000 Sobic001G521500 Sobic001G521500 Sobic001G095500--Sobic001G521500 Sobic006G174975--Sobic002G110300 Sobic002G067100 Sobic002G067100 Sobic006G174975--Sobic002G067100 Sobic006G174975--Sobic005G096700 Sobic004G003501 Sobic004G003501 Sobic006G174975--Sobic004G003501 Sobic003G043800 Sobic003G043800 Sobic006G174975--Sobic003G043800 Sobic002G067600 Sobic002G067600 Sobic006G174975--Sobic002G067600 Sobic006G174975--Sobic007G006900 Sobic003G119700 Sobic003G119700 Sobic006G174975--Sobic003G119700 Sobic003G392550 Sobic003G392550 Sobic006G174975--Sobic003G392550
Octagon: transcription factors


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