Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G289000.1
Synonym Sb02g032085
Functional annotation expressed protein
UniProt C5X7N1
Pfam PF14551
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G27090 : glycine-rich protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g02250.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G127300 expressed protein K14289: exportin-5
2 Sobic.004G204400 OsFBX309 - F-box domain containing protein, expressed -
3 Sobic.004G132100 ATP binding protein, putative, expressed -
4 Sobic.002G400900 expressed protein -
5 Sobic.004G005400 U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase, putative, expressed K12854: SNRNP200, pre-mRNA-splicing helicase BRR2
6 Sobic.005G154700 OsFBX407 - F-box domain containing protein, expressed -
7 Sobic.002G316500 GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed -
8 Sobic.003G092500 seven in absentia protein family protein, expressed K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
9 Sobic.003G066700 OsFBX164 - F-box domain containing protein, expressed -
10 Sobic.004G227500 WD-40 repeat family protein, putative, expressed -
11 Sobic.004G005900 expressed protein -
12 Sobic.002G060450 - -
13 Sobic.010G229000 "domain confirmed by Pfam database, expressed in leaf and root"(PubMedID : 20499123)@auxin response factor, putative, expressed -
14 Sobic.001G186600 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein, expressed -
15 Sobic.009G000400 expressed protein -
16 Sobic.007G199300 MBTB32 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed -
17 Sobic.009G011500 expressed protein -
18 Sobic.006G022500 OsFBD9 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
19 Sobic.005G096800 - -
20 Sobic.004G266300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@tetratricopeptide-like helical, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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