Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G266300.3,Sobic.004G266300.1,Sobic.004G266300.2
Synonym Sb04g030430
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
tetratricopeptide-like helical, putative, expressed
UniProt C5Y0A6
Pfam PF01535 PF13041
Panther DB PTHR24015 PTHR24015:SF508
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G01580 : Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g56850.1 : pentatricopeptide, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a032472
Brachypodium -
Barley HORVU6Hr1G069210.8 , HORVU6Hr1G069210.4 , HORVU6Hr1G069210.5 , HORVU6Hr1G069210.6 , HORVU6Hr1G069210.7 , HORVU6Hr1G069210.1 , HORVU6Hr1G069210.2 , HORVU6Hr1G069210.3
Wheat TraesCS6D02G254100 , TraesCS6A02G273900
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic004G266300 Sobic004G266300 Sobic010G144100 Sobic010G144100 Sobic004G266300--Sobic010G144100 Sobic009G026400 Sobic009G026400 Sobic004G266300--Sobic009G026400 Sobic005G110523 Sobic005G110523 Sobic004G266300--Sobic005G110523 Sobic008G091900 Sobic008G091900 Sobic004G266300--Sobic008G091900 Sobic003G031750 Sobic003G031750 Sobic004G266300--Sobic003G031750 Sobic007G059300 Sobic007G059300 Sobic004G266300--Sobic007G059300 Sobic006G132200 Sobic006G132200 Sobic004G266300--Sobic006G132200 Sobic004G005400 Sobic004G005400 Sobic004G266300--Sobic004G005400 Sobic003G176100 Sobic003G176100 Sobic004G266300--Sobic003G176100 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic010G144100--Sobic002G056100 Sobic010G144100--Sobic003G031750 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic010G144100--Sobic001G240400 Sobic009G045700 Sobic009G045700 Sobic010G144100--Sobic009G045700 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic010G144100--Sobic001G305400 Sobic005G141801 Sobic005G141801 Sobic010G144100--Sobic005G141801 Sobic010G144100--Sobic008G091900 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic010G144100--Sobic002G221200 Sobic008G036500 Sobic008G036500 Sobic010G144100--Sobic008G036500 Sobic002G060500 Sobic002G060500 Sobic009G026400--Sobic002G060500 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic009G026400--Sobic009G101600 Sobic009G026400--Sobic007G059300 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic009G026400--Sobic002G062300 Sobic004G196500 Sobic004G196500 Sobic009G026400--Sobic004G196500 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic009G026400--Sobic009G113600 Sobic005G054600 Sobic005G054600 Sobic009G026400--Sobic005G054600 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic009G026400--Sobic005G142200 Sobic005G054300 Sobic005G054300 Sobic009G026400--Sobic005G054300 Sobic009G004700 Sobic009G004700 Sobic005G110523--Sobic009G004700 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic005G110523--Sobic006G009400 Sobic005G005000 Sobic005G005000 Sobic005G110523--Sobic005G005000 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic005G110523--Sobic001G477800 Sobic001G464200 Sobic001G464200 Sobic005G110523--Sobic001G464200 Sobic005G110523--Sobic007G059300 Sobic004G169501 Sobic004G169501 Sobic005G110523--Sobic004G169501 Sobic003G089650 Sobic003G089650 Sobic005G110523--Sobic003G089650 Sobic005G110523--Sobic009G113600 Sobic005G117801 Sobic005G117801 Sobic008G091900--Sobic005G117801 Sobic008G091900--Sobic002G221200 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic008G091900--Sobic001G253100 Sobic008G091900--Sobic001G305400 Sobic008G091900--Sobic003G031750 Sobic008G091900--Sobic001G240400 Sobic008G091900--Sobic002G062300 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic008G091900--Sobic005G110430 Sobic005G212600 Sobic005G212600 Sobic008G091900--Sobic005G212600 Sobic003G031750--Sobic002G062300 Sobic003G031750--Sobic007G059300 Sobic003G031750--Sobic008G091900 Sobic003G031750--Sobic009G113600 SobicK024000 SobicK024000 Sobic003G031750--SobicK024000 Sobic003G031750--Sobic002G221200 Sobic009G196700 Sobic009G196700 Sobic003G031750--Sobic009G196700 Sobic003G031750--Sobic001G253100 Sobic008G079100 Sobic008G079100 Sobic003G031750--Sobic008G079100 Sobic007G059300--Sobic002G062300 Sobic007G059300--Sobic009G113600 Sobic007G059300--Sobic009G196700 Sobic007G059300--Sobic003G031750 Sobic007G059300--SobicK024000 Sobic008G108900 Sobic008G108900 Sobic007G059300--Sobic008G108900 Sobic007G059300--Sobic009G026400 Sobic007G059300--Sobic006G132200 Sobic002G051400 Sobic002G051400 Sobic007G059300--Sobic002G051400 Sobic006G132200--Sobic008G108900 Sobic006G132200--Sobic009G196700 Sobic006G132200--Sobic002G062300 Sobic006G132200--Sobic009G113600 Sobic006G132200--Sobic005G212600 Sobic006G132200--Sobic007G059300 Sobic006G132200--Sobic003G031750 Sobic006G132200--Sobic008G091900 Sobic008G031350 Sobic008G031350 Sobic006G132200--Sobic008G031350 Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic004G005400--Sobic005G110427 Sobic006G262200 Sobic006G262200 Sobic004G005400--Sobic006G262200 Sobic004G005400--Sobic006G009400 Sobic010G263800 Sobic010G263800 Sobic004G005400--Sobic010G263800 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic004G005400--Sobic005G221425 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic004G005400--Sobic009G209800 Sobic003G346000 Sobic003G346000 Sobic004G005400--Sobic003G346000 Sobic004G005400--Sobic003G031750 Sobic004G005400--Sobic008G079100 Sobic010G146200 Sobic010G146200 Sobic003G176100--Sobic010G146200 Sobic003G176100--Sobic009G113600 Sobic003G176100--Sobic008G108900 Sobic003G176100--Sobic007G059300 Sobic003G176100--Sobic002G051400 Sobic010G050600 Sobic010G050600 Sobic003G176100--Sobic010G050600 Sobic003G176100--Sobic009G196700 Sobic003G176100--Sobic002G062300 Sobic003G176100--Sobic006G132200
Octagon: transcription factors


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