Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G011500.2,Sobic.009G011500.1
Synonym Sb09g001173
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YYH0 , A0A1Z5R0C3
Pfam PF08234
Panther DB PTHR14281 PTHR14281:SF0
NCBI CDD KOG4657; Uncharacterized conserved protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G48210 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g74170.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a038268
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.009G011500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G045700 "CESA3-like homologous to the Arabidopsis, up-regulated in addition of GA3"(PubMedID : 26198258)@CESA2 - cellulose synthase, expressed K10999: cellulose synthase A
2 Sobic.009G164900 Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain containing protein, putative, expressed K11251: histone H2A
3 Sobic.002G367300 "qGW7/GL7(Ortholog in rice:Wang et al., 2015a(PubMedID : 31659862)@expressed protein -
4 Sobic.002G060450 - -
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8 Sobic.010G173900 expressed protein -
9 Sobic.001G065300 GRF zinc finger family protein, expressed -
10 Sobic.010G050700 protein kinase, putative, expressed -
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14 Sobic.002G334600 OsFBX251 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.002G216600 "DEP1(Ortholog in rice:Huang et al., 2009(PubMedID : 31659854)@keratin-associated protein 5-4, putative, expressed -
16 Sobic.010G046400 glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase, putative, expressed -
17 Sobic.001G448100 DNA-directed RNA polymerase subunit, putative, expressed K16252: NRPD2, DNA-directed RNA polymerase IV and V subunit 2
18 Sobic.002G033600 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
19 Sobic.002G297800 growth regulating factor protein, putative, expressed -
20 Sobic.001G393401 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G011500 Sobic009G011500 Sobic001G045700 Sobic001G045700 Sobic009G011500--Sobic001G045700 Sobic009G164900 Sobic009G164900 Sobic009G011500--Sobic009G164900 Sobic002G367300 Sobic002G367300 Sobic009G011500--Sobic002G367300 Sobic002G060450 Sobic002G060450 Sobic009G011500--Sobic002G060450 Sobic004G227500 Sobic004G227500 Sobic009G011500--Sobic004G227500 Sobic006G022500 Sobic006G022500 Sobic009G011500--Sobic006G022500 Sobic002G049000 Sobic002G049000 Sobic009G011500--Sobic002G049000 Sobic010G173900 Sobic010G173900 Sobic009G011500--Sobic010G173900 Sobic001G065300 Sobic001G065300 Sobic009G011500--Sobic001G065300 Sobic002G157200 Sobic002G157200 Sobic001G045700--Sobic002G157200 Sobic007G224900 Sobic007G224900 Sobic001G045700--Sobic007G224900 Sobic003G185250 Sobic003G185250 Sobic001G045700--Sobic003G185250 Sobic006G006500 Sobic006G006500 Sobic001G045700--Sobic006G006500 Sobic001G045700--Sobic002G049000 Sobic001G045700--Sobic002G060450 Sobic002G050500 Sobic002G050500 Sobic001G045700--Sobic002G050500 Sobic002G297800 Sobic002G297800 Sobic001G045700--Sobic002G297800 Sobic010G208500 Sobic010G208500 Sobic001G045700--Sobic010G208500 Sobic002G007200 Sobic002G007200 Sobic009G164900--Sobic002G007200 Sobic003G380500 Sobic003G380500 Sobic009G164900--Sobic003G380500 Sobic001G216600 Sobic001G216600 Sobic009G164900--Sobic001G216600 Sobic003G356200 Sobic003G356200 Sobic009G164900--Sobic003G356200 Sobic001G217100 Sobic001G217100 Sobic009G164900--Sobic001G217100 Sobic004G229100 Sobic004G229100 Sobic009G164900--Sobic004G229100 Sobic009G164900--Sobic009G011500 Sobic007G195400 Sobic007G195400 Sobic009G164900--Sobic007G195400 Sobic009G164900--Sobic002G157200 Sobic006G262600 Sobic006G262600 Sobic002G367300--Sobic006G262600 Sobic010G091700 Sobic010G091700 Sobic002G367300--Sobic010G091700 Sobic001G184400 Sobic001G184400 Sobic002G367300--Sobic001G184400 Sobic002G367300--Sobic009G011500 Sobic002G367300--Sobic003G380500 Sobic004G154600 Sobic004G154600 Sobic002G367300--Sobic004G154600 Sobic004G199700 Sobic004G199700 Sobic002G367300--Sobic004G199700 Sobic003G174900 Sobic003G174900 Sobic002G367300--Sobic003G174900 Sobic004G205500 Sobic004G205500 Sobic002G367300--Sobic004G205500 Sobic002G060450--Sobic003G185250 Sobic002G060450--Sobic002G049000 Sobic007G046900 Sobic007G046900 Sobic002G060450--Sobic007G046900 Sobic006G210200 Sobic006G210200 Sobic002G060450--Sobic006G210200 Sobic002G060450--Sobic006G006500 Sobic002G060450--Sobic001G045700 Sobic002G060450--Sobic002G050500 Sobic002G060450--Sobic006G022500 Sobic003G346000 Sobic003G346000 Sobic002G060450--Sobic003G346000 Sobic004G227500--Sobic006G022500 Sobic002G316500 Sobic002G316500 Sobic004G227500--Sobic002G316500 Sobic010G046400 Sobic010G046400 Sobic004G227500--Sobic010G046400 Sobic001G494100 Sobic001G494100 Sobic004G227500--Sobic001G494100 Sobic004G135500 Sobic004G135500 Sobic004G227500--Sobic004G135500 Sobic004G227500--Sobic010G173900 Sobic001G315400 Sobic001G315400 Sobic004G227500--Sobic001G315400 Sobic001G367100 Sobic001G367100 Sobic004G227500--Sobic001G367100 Sobic002G334600 Sobic002G334600 Sobic004G227500--Sobic002G334600 Sobic006G022500--Sobic004G227500 Sobic004G148600 Sobic004G148600 Sobic006G022500--Sobic004G148600 Sobic001G384600 Sobic001G384600 Sobic006G022500--Sobic001G384600 Sobic002G073300 Sobic002G073300 Sobic006G022500--Sobic002G073300 Sobic006G022500--Sobic002G060450 Sobic004G189700 Sobic004G189700 Sobic006G022500--Sobic004G189700 Sobic006G022500--Sobic001G045700 Sobic006G022400 Sobic006G022400 Sobic006G022500--Sobic006G022400 Sobic005G177900 Sobic005G177900 Sobic006G022500--Sobic005G177900 Sobic002G049000--Sobic003G346000 Sobic002G049000--Sobic002G297800 Sobic002G090400 Sobic002G090400 Sobic002G049000--Sobic002G090400 Sobic008G068800 Sobic008G068800 Sobic002G049000--Sobic008G068800 Sobic007G011400 Sobic007G011400 Sobic002G049000--Sobic007G011400 Sobic002G061400 Sobic002G061400 Sobic002G049000--Sobic002G061400 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic002G049000--Sobic001G094000 Sobic008G034600 Sobic008G034600 Sobic002G049000--Sobic008G034600 Sobic001G394400 Sobic001G394400 Sobic002G049000--Sobic001G394400 Sobic010G173900--Sobic010G046400 Sobic010G173900--Sobic004G227500 Sobic010G173900--Sobic002G334600 Sobic010G173900--Sobic001G045700 Sobic010G173900--Sobic009G011500 Sobic010G173900--Sobic010G208500 Sobic010G173900--Sobic002G050500 Sobic010G173900--Sobic002G157200 Sobic010G173900--Sobic002G367300 Sobic001G065300--Sobic002G050500 Sobic001G065300--Sobic006G022500 Sobic001G065300--Sobic009G011500 Sobic001G065300--Sobic006G022400 Sobic001G065300--Sobic002G060450 Sobic001G065300--Sobic001G384600 Sobic002G223300 Sobic002G223300 Sobic001G065300--Sobic002G223300 Sobic001G065300--Sobic010G173900 Sobic001G065300--Sobic005G177900
Octagon: transcription factors


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