Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G393401.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5SAD7
Pfam -
Panther DB PTHR33448 PTHR33448:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G15095 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g24540.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a052542
Brachypodium KQK04842
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G023400 SCAR-like protein 2, putative, expressed -
2 Sobic.001G384700 RNA-binding zinc finger protein, putative, expressed -
3 Sobic.002G216600 "DEP1(Ortholog in rice:Huang et al., 2009(PubMedID : 31659854)@keratin-associated protein 5-4, putative, expressed -
4 Sobic.002G060450 - -
5 Sobic.010G190400 ZOS6-05 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
6 Sobic.005G204100 kelch repeat protein, putative, expressed -
7 Sobic.001G184400 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR55 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed -
8 Sobic.002G049000 frigida, putative, expressed -
9 Sobic.004G052800 DUF640 domain containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.009G011500 expressed protein -
11 Sobic.001G045700 "CESA3-like homologous to the Arabidopsis, up-regulated in addition of GA3"(PubMedID : 26198258)@CESA2 - cellulose synthase, expressed K10999: cellulose synthase A
12 Sobic.001G367100 pleckstrin homology domain-containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.002G098500 H-BTB6 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with H family conserved sequence, expressed -
14 Sobic.009G259500 receptor protein kinase CLAVATA1 precursor, putative, expressed -
15 Sobic.006G046600 expressed protein -
16 Sobic.009G141700 expressed protein -
17 Sobic.003G402700 expressed protein -
18 Sobic.003G185250 - -
19 Sobic.004G227500 WD-40 repeat family protein, putative, expressed -
20 Sobic.003G174900 fimbrin-like protein 2, putative, expressed K17336: plastin-3


Gene co-expression network
sample Sobic001G393401 Sobic001G393401 Sobic003G023400 Sobic003G023400 Sobic001G393401--Sobic003G023400 Sobic001G384700 Sobic001G384700 Sobic001G393401--Sobic001G384700 Sobic002G216600 Sobic002G216600 Sobic001G393401--Sobic002G216600 Sobic002G060450 Sobic002G060450 Sobic001G393401--Sobic002G060450 Sobic010G190400 Sobic010G190400 Sobic001G393401--Sobic010G190400 Sobic005G204100 Sobic005G204100 Sobic001G393401--Sobic005G204100 Sobic001G184400 Sobic001G184400 Sobic001G393401--Sobic001G184400 Sobic002G049000 Sobic002G049000 Sobic001G393401--Sobic002G049000 Sobic004G052800 Sobic004G052800 Sobic001G393401--Sobic004G052800 Sobic004G193800 Sobic004G193800 Sobic003G023400--Sobic004G193800 Sobic003G023400--Sobic002G049000 Sobic006G210200 Sobic006G210200 Sobic003G023400--Sobic006G210200 Sobic003G185250 Sobic003G185250 Sobic003G023400--Sobic003G185250 Sobic002G090400 Sobic002G090400 Sobic003G023400--Sobic002G090400 Sobic008G068800 Sobic008G068800 Sobic003G023400--Sobic008G068800 Sobic001G367100 Sobic001G367100 Sobic003G023400--Sobic001G367100 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic003G023400--Sobic001G094000 Sobic003G163100 Sobic003G163100 Sobic003G023400--Sobic003G163100 Sobic001G384700--Sobic002G216600 Sobic001G079900 Sobic001G079900 Sobic001G384700--Sobic001G079900 Sobic009G141700 Sobic009G141700 Sobic001G384700--Sobic009G141700 Sobic006G046600 Sobic006G046600 Sobic001G384700--Sobic006G046600 Sobic001G384700--Sobic005G204100 Sobic001G384700--Sobic004G052800 Sobic005G168400 Sobic005G168400 Sobic001G384700--Sobic005G168400 Sobic001G379900 Sobic001G379900 Sobic001G384700--Sobic001G379900 Sobic001G434100 Sobic001G434100 Sobic001G384700--Sobic001G434100 Sobic002G216600--Sobic005G204100 Sobic002G216600--Sobic001G384700 Sobic004G144100 Sobic004G144100 Sobic002G216600--Sobic004G144100 Sobic009G259500 Sobic009G259500 Sobic002G216600--Sobic009G259500 Sobic004G199700 Sobic004G199700 Sobic002G216600--Sobic004G199700 Sobic002G216600--Sobic001G079900 Sobic002G216600--Sobic009G141700 Sobic003G174900 Sobic003G174900 Sobic002G216600--Sobic003G174900 Sobic002G348700 Sobic002G348700 Sobic002G216600--Sobic002G348700 Sobic002G060450--Sobic003G185250 Sobic002G060450--Sobic002G049000 Sobic007G046900 Sobic007G046900 Sobic002G060450--Sobic007G046900 Sobic002G060450--Sobic006G210200 Sobic006G006500 Sobic006G006500 Sobic002G060450--Sobic006G006500 Sobic001G045700 Sobic001G045700 Sobic002G060450--Sobic001G045700 Sobic002G050500 Sobic002G050500 Sobic002G060450--Sobic002G050500 Sobic006G022500 Sobic006G022500 Sobic002G060450--Sobic006G022500 Sobic003G346000 Sobic003G346000 Sobic002G060450--Sobic003G346000 Sobic010G190400--Sobic001G393401 Sobic008G038200 Sobic008G038200 Sobic010G190400--Sobic008G038200 Sobic007G065300 Sobic007G065300 Sobic010G190400--Sobic007G065300 Sobic010G190400--Sobic001G384700 Sobic009G173200 Sobic009G173200 Sobic010G190400--Sobic009G173200 Sobic010G190400--Sobic009G141700 Sobic010G190400--Sobic006G046600 Sobic001G482300 Sobic001G482300 Sobic010G190400--Sobic001G482300 Sobic010G190400--Sobic005G204100 Sobic005G204100--Sobic002G216600 Sobic005G204100--Sobic009G259500 Sobic002G072700 Sobic002G072700 Sobic005G204100--Sobic002G072700 Sobic007G142900 Sobic007G142900 Sobic005G204100--Sobic007G142900 Sobic002G098500 Sobic002G098500 Sobic005G204100--Sobic002G098500 Sobic001G221900 Sobic001G221900 Sobic005G204100--Sobic001G221900 Sobic005G204100--Sobic001G384700 Sobic006G272500 Sobic006G272500 Sobic005G204100--Sobic006G272500 Sobic007G189400 Sobic007G189400 Sobic005G204100--Sobic007G189400 Sobic001G184400--Sobic002G049000 Sobic010G091700 Sobic010G091700 Sobic001G184400--Sobic010G091700 Sobic002G367300 Sobic002G367300 Sobic001G184400--Sobic002G367300 Sobic001G184400--Sobic002G090400 Sobic010G208500 Sobic010G208500 Sobic001G184400--Sobic010G208500 Sobic002G297800 Sobic002G297800 Sobic001G184400--Sobic002G297800 Sobic005G195700 Sobic005G195700 Sobic001G184400--Sobic005G195700 Sobic001G184400--Sobic001G393401 Sobic001G422366 Sobic001G422366 Sobic001G184400--Sobic001G422366 Sobic002G049000--Sobic003G346000 Sobic002G049000--Sobic002G297800 Sobic002G049000--Sobic002G090400 Sobic002G049000--Sobic008G068800 Sobic007G011400 Sobic007G011400 Sobic002G049000--Sobic007G011400 Sobic002G061400 Sobic002G061400 Sobic002G049000--Sobic002G061400 Sobic002G049000--Sobic001G094000 Sobic008G034600 Sobic008G034600 Sobic002G049000--Sobic008G034600 Sobic001G394400 Sobic001G394400 Sobic002G049000--Sobic001G394400 Sobic004G052800--Sobic001G079900 Sobic004G052800--Sobic001G384700 Sobic004G052800--Sobic002G216600 Sobic005G177900 Sobic005G177900 Sobic004G052800--Sobic005G177900 Sobic007G197100 Sobic007G197100 Sobic004G052800--Sobic007G197100 Sobic004G052800--Sobic005G204100 Sobic005G032600 Sobic005G032600 Sobic004G052800--Sobic005G032600 Sobic004G012700 Sobic004G012700 Sobic004G052800--Sobic004G012700 Sobic003G302000 Sobic003G302000 Sobic004G052800--Sobic003G302000
Octagon: transcription factors


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