Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G173900.2,Sobic.010G173900.4,Sobic.010G173900.3
Synonym Sb10g022630
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YJT4 , A0A1W0VTI9
Pfam PF11510
Panther DB PTHR32094
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G29560 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g37570.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a051142
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G046400 glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase, putative, expressed -
2 Sobic.004G227500 WD-40 repeat family protein, putative, expressed -
3 Sobic.002G334600 OsFBX251 - F-box domain containing protein, expressed -
4 Sobic.001G045700 "CESA3-like homologous to the Arabidopsis, up-regulated in addition of GA3"(PubMedID : 26198258)@CESA2 - cellulose synthase, expressed K10999: cellulose synthase A
5 Sobic.009G011500 expressed protein -
6 Sobic.010G208500 - -
7 Sobic.002G050500 type I inositol-1,4,5-trisphosphate 5-phosphatase, putative, expressed -
8 Sobic.002G157200 expressed protein -
9 Sobic.002G367300 "qGW7/GL7(Ortholog in rice:Wang et al., 2015a(PubMedID : 31659862)@expressed protein -
10 Sobic.004G077000 expressed protein -
11 Sobic.001G065300 GRF zinc finger family protein, expressed -
12 Sobic.007G191100 zinc finger DHHC domain-containing protein, putative, expressed K16675: palmitoyltransferase ZDHHC9/14/18
13 Sobic.003G156766 - -
14 Sobic.005G148400 OsFBX404 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.009G164900 Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain containing protein, putative, expressed K11251: histone H2A
16 Sobic.007G224900 RNA recognition motif containing protein, expressed K12891: splicing factor, arginine/serine-rich 2
17 Sobic.010G235500 OsFBLD1 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
18 Sobic.008G034600 protein kinase PKN/PRK1, effector, putative, expressed -
19 Sobic.010G050700 protein kinase, putative, expressed -
20 Sobic.002G073300 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G173900 Sobic010G173900 Sobic010G046400 Sobic010G046400 Sobic010G173900--Sobic010G046400 Sobic004G227500 Sobic004G227500 Sobic010G173900--Sobic004G227500 Sobic002G334600 Sobic002G334600 Sobic010G173900--Sobic002G334600 Sobic001G045700 Sobic001G045700 Sobic010G173900--Sobic001G045700 Sobic009G011500 Sobic009G011500 Sobic010G173900--Sobic009G011500 Sobic010G208500 Sobic010G208500 Sobic010G173900--Sobic010G208500 Sobic002G050500 Sobic002G050500 Sobic010G173900--Sobic002G050500 Sobic002G157200 Sobic002G157200 Sobic010G173900--Sobic002G157200 Sobic002G367300 Sobic002G367300 Sobic010G173900--Sobic002G367300 Sobic010G046400--Sobic010G173900 Sobic010G046400--Sobic004G227500 Sobic010G046400--Sobic002G334600 Sobic002G218700 Sobic002G218700 Sobic010G046400--Sobic002G218700 Sobic007G070300 Sobic007G070300 Sobic010G046400--Sobic007G070300 Sobic010G046400--Sobic002G367300 Sobic010G046400--Sobic009G011500 Sobic008G099500 Sobic008G099500 Sobic010G046400--Sobic008G099500 Sobic001G247200 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Sobic004G205500 Sobic004G205500 Sobic002G367300--Sobic004G205500
Octagon: transcription factors


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