Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G177950.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R7I6
Pfam -
Panther DB PTHR33186 PTHR33186:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g23900.1 : OsFBX234 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G204400 OsFBX309 - F-box domain containing protein, expressed -
2 Sobic.005G127300 expressed protein K14289: exportin-5
3 Sobic.009G101600 ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed -
4 Sobic.004G132100 ATP binding protein, putative, expressed -
5 Sobic.004G005400 U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase, putative, expressed K12854: SNRNP200, pre-mRNA-splicing helicase BRR2
6 Sobic.002G400900 expressed protein -
7 Sobic.002G289000 expressed protein -
8 Sobic.003G439501 - -
9 Sobic.004G005900 expressed protein -
10 Sobic.K010000 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.005G142200 expressed protein -
12 Sobic.005G015100 OsFBX291 - F-box domain containing protein, expressed -
13 Sobic.001G022100 expressed protein -
14 Sobic.003G366850 - -
15 Sobic.007G080500 MBTB20 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
16 Sobic.004G199600 DUF581 domain containing protein, expressed -
17 Sobic.004G121000 aldose 1-epimerase, putative, expressed K01785: galM, aldose 1-epimerase
18 Sobic.001G262900 hhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein, putative, expressed K10801: methyl-CpG-binding domain protein 4
19 Sobic.002G431200 - -
20 Sobic.009G026400 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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