Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G080500.2
Synonym BPM2, ATBPM2, Sb07g006450
Functional annotation MBTB20 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed
UniProt A0A1B6PGC3
Pfam PF00651
Panther DB PTHR26379 PTHR26379:SF157
NCBI CDD -
KEGG Orthology K10523; speckle-type POZ protein
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G06190 : BTB-POZ and MATH domain 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g13000.1 : MBTB20 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK17056 , PNT66899
Barley HORVU6Hr1G069480.1
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G177950 - -
2 Sobic.001G045700 "CESA3-like homologous to the Arabidopsis, up-regulated in addition of GA3"(PubMedID : 26198258)@CESA2 - cellulose synthase, expressed K10999: cellulose synthase A
3 Sobic.009G004700 stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed -
4 Sobic.005G015100 OsFBX291 - F-box domain containing protein, expressed -
5 Sobic.005G121800 expressed protein -
6 Sobic.004G291800 - -
7 Sobic.002G060450 - -
8 Sobic.009G180200 SNF1-related protein kinase regulatory subunit beta-1, putative, expressed K07199: 5'-AMP-activated protein kinase, regulatory beta subunit
9 Sobic.003G422000 "Glucan endo-1,3-beta-d-glucosidase"(PubMedID : 24906815)@"beta-1,3-glucanase "(PubMedID : 25311645)@glycosyl hydrolases family 17, putative, expressed -
10 Sobic.002G331000 OsFBX462 - F-box domain containing protein, expressed -
11 Sobic.006G273100 - -
12 Sobic.009G066100 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
13 Sobic.006G006500 MBTB44 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
14 Sobic.009G109450 - -
15 Sobic.009G110366 - -
16 Sobic.004G005400 U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase, putative, expressed K12854: SNRNP200, pre-mRNA-splicing helicase BRR2
17 Sobic.005G110523 - -
18 Sobic.007G224900 RNA recognition motif containing protein, expressed K12891: splicing factor, arginine/serine-rich 2
19 Sobic.009G178800 bZIP transcription factor, putative, expressed K14432: ABA responsive element binding factor
20 Sobic.004G199600 DUF581 domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G080500 Sobic007G080500 Sobic008G177950 Sobic008G177950 Sobic007G080500--Sobic008G177950 Sobic001G045700 Sobic001G045700 Sobic007G080500--Sobic001G045700 Sobic009G004700 Sobic009G004700 Sobic007G080500--Sobic009G004700 Sobic005G015100 Sobic005G015100 Sobic007G080500--Sobic005G015100 Sobic005G121800 Sobic005G121800 Sobic007G080500--Sobic005G121800 Sobic004G291800 Sobic004G291800 Sobic007G080500--Sobic004G291800 Sobic002G060450 Sobic002G060450 Sobic007G080500--Sobic002G060450 Sobic009G180200 Sobic009G180200 Sobic007G080500--Sobic009G180200 Sobic003G422000 Sobic003G422000 Sobic007G080500--Sobic003G422000 Sobic004G204400 Sobic004G204400 Sobic008G177950--Sobic004G204400 Sobic005G127300 Sobic005G127300 Sobic008G177950--Sobic005G127300 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic008G177950--Sobic009G101600 Sobic004G132100 Sobic004G132100 Sobic008G177950--Sobic004G132100 Sobic004G005400 Sobic004G005400 Sobic008G177950--Sobic004G005400 Sobic002G400900 Sobic002G400900 Sobic008G177950--Sobic002G400900 Sobic002G289000 Sobic002G289000 Sobic008G177950--Sobic002G289000 Sobic003G439501 Sobic003G439501 Sobic008G177950--Sobic003G439501 Sobic004G005900 Sobic004G005900 Sobic008G177950--Sobic004G005900 Sobic002G157200 Sobic002G157200 Sobic001G045700--Sobic002G157200 Sobic007G224900 Sobic007G224900 Sobic001G045700--Sobic007G224900 Sobic003G185250 Sobic003G185250 Sobic001G045700--Sobic003G185250 Sobic006G006500 Sobic006G006500 Sobic001G045700--Sobic006G006500 Sobic002G049000 Sobic002G049000 Sobic001G045700--Sobic002G049000 Sobic001G045700--Sobic002G060450 Sobic002G050500 Sobic002G050500 Sobic001G045700--Sobic002G050500 Sobic002G297800 Sobic002G297800 Sobic001G045700--Sobic002G297800 Sobic010G208500 Sobic010G208500 Sobic001G045700--Sobic010G208500 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic009G004700--Sobic009G113600 Sobic003G089650 Sobic003G089650 Sobic009G004700--Sobic003G089650 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic009G004700--Sobic002G062300 Sobic005G110523 Sobic005G110523 Sobic009G004700--Sobic005G110523 Sobic007G059300 Sobic007G059300 Sobic009G004700--Sobic007G059300 Sobic009G026400 Sobic009G026400 Sobic009G004700--Sobic009G026400 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic009G004700--Sobic006G009400 Sobic005G212500 Sobic005G212500 Sobic009G004700--Sobic005G212500 Sobic003G031750 Sobic003G031750 Sobic009G004700--Sobic003G031750 Sobic002G051450 Sobic002G051450 Sobic005G015100--Sobic002G051450 Sobic008G034600 Sobic008G034600 Sobic005G015100--Sobic008G034600 Sobic002G158700 Sobic002G158700 Sobic005G015100--Sobic002G158700 Sobic001G464200 Sobic001G464200 Sobic005G015100--Sobic001G464200 Sobic006G128900 Sobic006G128900 Sobic005G015100--Sobic006G128900 Sobic006G145000 Sobic006G145000 Sobic005G015100--Sobic006G145000 Sobic002G421700 Sobic002G421700 Sobic005G015100--Sobic002G421700 Sobic004G271900 Sobic004G271900 Sobic005G015100--Sobic004G271900 Sobic004G256600 Sobic004G256600 Sobic005G015100--Sobic004G256600 Sobic002G376900 Sobic002G376900 Sobic005G121800--Sobic002G376900 Sobic009G109450 Sobic009G109450 Sobic005G121800--Sobic009G109450 Sobic005G121800--Sobic009G180200 Sobic002G376800 Sobic002G376800 Sobic005G121800--Sobic002G376800 Sobic004G199600 Sobic004G199600 Sobic005G121800--Sobic004G199600 Sobic003G258400 Sobic003G258400 Sobic005G121800--Sobic003G258400 Sobic009G078500 Sobic009G078500 Sobic005G121800--Sobic009G078500 Sobic009G110366 Sobic009G110366 Sobic005G121800--Sobic009G110366 Sobic006G273100 Sobic006G273100 Sobic005G121800--Sobic006G273100 Sobic004G020401 Sobic004G020401 Sobic004G291800--Sobic004G020401 Sobic009G197200 Sobic009G197200 Sobic004G291800--Sobic009G197200 Sobic004G291800--Sobic009G110366 Sobic002G212800 Sobic002G212800 Sobic004G291800--Sobic002G212800 Sobic007G112900 Sobic007G112900 Sobic004G291800--Sobic007G112900 Sobic004G291800--Sobic009G109450 Sobic007G130100 Sobic007G130100 Sobic004G291800--Sobic007G130100 Sobic004G291800--Sobic006G273100 Sobic003G057800 Sobic003G057800 Sobic004G291800--Sobic003G057800 Sobic002G060450--Sobic003G185250 Sobic002G060450--Sobic002G049000 Sobic007G046900 Sobic007G046900 Sobic002G060450--Sobic007G046900 Sobic006G210200 Sobic006G210200 Sobic002G060450--Sobic006G210200 Sobic002G060450--Sobic006G006500 Sobic002G060450--Sobic001G045700 Sobic002G060450--Sobic002G050500 Sobic006G022500 Sobic006G022500 Sobic002G060450--Sobic006G022500 Sobic003G346000 Sobic003G346000 Sobic002G060450--Sobic003G346000 Sobic009G180200--Sobic004G199600 Sobic001G363100 Sobic001G363100 Sobic009G180200--Sobic001G363100 Sobic009G180200--Sobic009G109450 Sobic009G180200--Sobic009G078500 Sobic007G023700 Sobic007G023700 Sobic009G180200--Sobic007G023700 Sobic009G231300 Sobic009G231300 Sobic009G180200--Sobic009G231300 Sobic005G130100 Sobic005G130100 Sobic009G180200--Sobic005G130100 Sobic009G180200--Sobic003G258400 Sobic009G180200--Sobic005G121800 Sobic008G108900 Sobic008G108900 Sobic003G422000--Sobic008G108900 Sobic006G132200 Sobic006G132200 Sobic003G422000--Sobic006G132200 Sobic003G422000--Sobic002G062300 Sobic003G422000--Sobic007G059300 Sobic003G422000--Sobic009G113600 Sobic002G051400 Sobic002G051400 Sobic003G422000--Sobic002G051400 Sobic005G212600 Sobic005G212600 Sobic003G422000--Sobic005G212600 Sobic007G115000 Sobic007G115000 Sobic003G422000--Sobic007G115000 Sobic007G094600 Sobic007G094600 Sobic003G422000--Sobic007G094600
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.