Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G273100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PP71
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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TAIR -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G113600 - -
2 Sobic.002G051400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@flavin-containing monooxygenase family protein, putative, expressed K00485: dimethylaniline monooxygenase (N-oxide forming)
3 Sobic.009G109450 - -
4 Sobic.009G110366 - -
5 Sobic.009G196700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@cytochrome P450, putative, expressed -
6 Sobic.005G121800 expressed protein -
7 Sobic.008G079100 - -
8 Sobic.006G132200 CHIT3 - Chitinase family protein precursor, expressed K01183: chitinase
9 Sobic.008G108900 GRF zinc finger family protein, expressed -
10 Sobic.002G062300 expressed protein -
11 Sobic.001G132500 - -
12 Sobic.007G073400 SHR5-receptor-like kinase, putative, expressed -
13 Sobic.007G059300 - -
14 Sobic.008G031350 - -
15 Sobic.009G197200 - -
16 Sobic.001G422366 - -
17 Sobic.003G031750 - -
18 Sobic.003G176100 expressed protein -
19 Sobic.002G376900 EF hand family protein, putative -
20 Sobic.002G285200 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR53 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G273100 Sobic006G273100 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic006G273100--Sobic009G113600 Sobic002G051400 Sobic002G051400 Sobic006G273100--Sobic002G051400 Sobic009G109450 Sobic009G109450 Sobic006G273100--Sobic009G109450 Sobic009G110366 Sobic009G110366 Sobic006G273100--Sobic009G110366 Sobic009G196700 Sobic009G196700 Sobic006G273100--Sobic009G196700 Sobic005G121800 Sobic005G121800 Sobic006G273100--Sobic005G121800 Sobic008G079100 Sobic008G079100 Sobic006G273100--Sobic008G079100 Sobic006G132200 Sobic006G132200 Sobic006G273100--Sobic006G132200 Sobic008G108900 Sobic008G108900 Sobic006G273100--Sobic008G108900 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic009G113600--Sobic002G062300 Sobic007G059300 Sobic007G059300 Sobic009G113600--Sobic007G059300 SobicK024000 SobicK024000 Sobic009G113600--SobicK024000 Sobic009G113600--Sobic009G196700 Sobic008G009500 Sobic008G009500 Sobic009G113600--Sobic008G009500 Sobic009G113600--Sobic008G108900 Sobic003G031750 Sobic003G031750 Sobic009G113600--Sobic003G031750 Sobic008G031350 Sobic008G031350 Sobic009G113600--Sobic008G031350 Sobic010G146200 Sobic010G146200 Sobic009G113600--Sobic010G146200 Sobic002G051400--Sobic009G113600 Sobic002G051400--Sobic007G059300 Sobic002G051400--Sobic008G108900 Sobic002G051400--Sobic002G062300 Sobic003G176100 Sobic003G176100 Sobic002G051400--Sobic003G176100 Sobic002G051400--Sobic009G196700 Sobic002G051400--Sobic010G146200 Sobic002G051400--SobicK024000 Sobic002G051400--Sobic008G009500 Sobic009G078500 Sobic009G078500 Sobic009G109450--Sobic009G078500 Sobic004G199600 Sobic004G199600 Sobic009G109450--Sobic004G199600 Sobic009G180200 Sobic009G180200 Sobic009G109450--Sobic009G180200 Sobic005G130100 Sobic005G130100 Sobic009G109450--Sobic005G130100 Sobic009G231300 Sobic009G231300 Sobic009G109450--Sobic009G231300 Sobic006G196000 Sobic006G196000 Sobic009G109450--Sobic006G196000 Sobic009G109450--Sobic005G121800 Sobic002G376900 Sobic002G376900 Sobic009G109450--Sobic002G376900 Sobic009G109450--Sobic009G110366 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic009G110366--Sobic007G073400 Sobic004G020401 Sobic004G020401 Sobic009G110366--Sobic004G020401 Sobic009G110366--Sobic009G109450 Sobic003G258400 Sobic003G258400 Sobic009G110366--Sobic003G258400 Sobic009G110366--Sobic006G196000 Sobic004G143700 Sobic004G143700 Sobic009G110366--Sobic004G143700 Sobic004G291800 Sobic004G291800 Sobic009G110366--Sobic004G291800 Sobic009G110366--Sobic009G180200 Sobic009G198900 Sobic009G198900 Sobic009G110366--Sobic009G198900 Sobic009G196700--Sobic009G113600 Sobic009G196700--Sobic008G108900 Sobic009G196700--Sobic007G059300 Sobic009G196700--Sobic006G132200 Sobic009G196700--Sobic002G062300 Sobic009G196700--Sobic003G031750 Sobic009G196700--SobicK024000 Sobic008G036500 Sobic008G036500 Sobic009G196700--Sobic008G036500 Sobic009G196700--Sobic003G176100 Sobic005G121800--Sobic002G376900 Sobic005G121800--Sobic009G109450 Sobic005G121800--Sobic009G180200 Sobic002G376800 Sobic002G376800 Sobic005G121800--Sobic002G376800 Sobic005G121800--Sobic004G199600 Sobic005G121800--Sobic003G258400 Sobic005G121800--Sobic009G078500 Sobic005G121800--Sobic009G110366 Sobic005G121800--Sobic006G273100 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic008G079100--Sobic008G042250 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic008G079100--Sobic009G209800 Sobic008G079100--SobicK024000 Sobic008G079100--Sobic003G031750 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic008G079100--Sobic001G253100 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic008G079100--Sobic005G110430 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic008G079100--Sobic008G049701 Sobic008G079100--Sobic002G062300 Sobic008G079100--Sobic008G009500 Sobic006G132200--Sobic008G108900 Sobic006G132200--Sobic009G196700 Sobic006G132200--Sobic002G062300 Sobic006G132200--Sobic009G113600 Sobic005G212600 Sobic005G212600 Sobic006G132200--Sobic005G212600 Sobic006G132200--Sobic007G059300 Sobic006G132200--Sobic003G031750 Sobic008G091900 Sobic008G091900 Sobic006G132200--Sobic008G091900 Sobic006G132200--Sobic008G031350 Sobic008G108900--Sobic006G132200 Sobic008G108900--Sobic009G196700 Sobic008G108900--Sobic002G062300 Sobic008G108900--Sobic009G113600 Sobic008G108900--Sobic007G059300 Sobic008G108900--Sobic005G212600 Sobic008G108900--Sobic003G176100 Sobic008G108900--Sobic002G051400 Sobic008G108900--Sobic003G031750
Octagon: transcription factors


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