Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G422366.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5SA84
Pfam PF08137
Panther DB PTHR33102
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G36985 : DVL family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g16600.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a001812
Brachypodium KQK22352 , KQK10536
Barley HORVU4Hr1G059950.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G059600 KIP1, putative, expressed -
2 Sobic.004G212800 - -
3 Sobic.009G231300 drought induced 19 protein, putative, expressed -
4 Sobic.007G073400 SHR5-receptor-like kinase, putative, expressed -
5 Sobic.002G051400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@flavin-containing monooxygenase family protein, putative, expressed K00485: dimethylaniline monooxygenase (N-oxide forming)
6 Sobic.001G046600 cycloartenol-C-24-methyltransferase 1, putative, expressed -
7 Sobic.008G167300 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
8 Sobic.004G076732 - K14800: pre-rRNA-processing protein TSR2
9 Sobic.002G410200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
10 Sobic.008G009500 pentatricopeptide, putative, expressed -
11 Sobic.006G273100 - -
12 Sobic.008G031350 - -
13 Sobic.009G113600 - -
14 Sobic.008G161401 - -
15 Sobic.003G204000 expressed protein -
16 Sobic.003G424100 sulfotransferase domain containing protein, expressed -
17 Sobic.004G016500 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.001G024200 lipase class 3 family protein, putative, expressed -
19 Sobic.002G297800 growth regulating factor protein, putative, expressed -
20 Sobic.007G156500 alpha-amylase precursor, putative, expressed K01176: AMY, amyA, alpha-amylase


Gene co-expression network
sample Sobic001G422366 Sobic001G422366 Sobic009G059600 Sobic009G059600 Sobic001G422366--Sobic009G059600 Sobic004G212800 Sobic004G212800 Sobic001G422366--Sobic004G212800 Sobic009G231300 Sobic009G231300 Sobic001G422366--Sobic009G231300 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic001G422366--Sobic007G073400 Sobic002G051400 Sobic002G051400 Sobic001G422366--Sobic002G051400 Sobic001G046600 Sobic001G046600 Sobic001G422366--Sobic001G046600 Sobic008G167300 Sobic008G167300 Sobic001G422366--Sobic008G167300 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic001G422366--Sobic004G076732 Sobic002G410200 Sobic002G410200 Sobic001G422366--Sobic002G410200 Sobic004G164600 Sobic004G164600 Sobic009G059600--Sobic004G164600 Sobic007G099500 Sobic007G099500 Sobic009G059600--Sobic007G099500 Sobic009G059600--Sobic004G212800 Sobic009G059600--Sobic007G073400 Sobic008G068800 Sobic008G068800 Sobic009G059600--Sobic008G068800 Sobic003G128600 Sobic003G128600 Sobic009G059600--Sobic003G128600 Sobic003G424100 Sobic003G424100 Sobic009G059600--Sobic003G424100 Sobic007G142050 Sobic007G142050 Sobic009G059600--Sobic007G142050 Sobic009G059600--Sobic004G076732 Sobic004G212800--Sobic007G073400 Sobic004G212800--Sobic004G164600 Sobic001G024200 Sobic001G024200 Sobic004G212800--Sobic001G024200 Sobic001G345333 Sobic001G345333 Sobic004G212800--Sobic001G345333 Sobic002G007250 Sobic002G007250 Sobic004G212800--Sobic002G007250 Sobic010G248200 Sobic010G248200 Sobic004G212800--Sobic010G248200 Sobic004G212800--Sobic004G076732 Sobic008G161401 Sobic008G161401 Sobic004G212800--Sobic008G161401 Sobic004G112500 Sobic004G112500 Sobic004G212800--Sobic004G112500 Sobic005G130100 Sobic005G130100 Sobic009G231300--Sobic005G130100 Sobic009G180200 Sobic009G180200 Sobic009G231300--Sobic009G180200 Sobic009G109450 Sobic009G109450 Sobic009G231300--Sobic009G109450 Sobic009G078500 Sobic009G078500 Sobic009G231300--Sobic009G078500 Sobic007G156500 Sobic007G156500 Sobic009G231300--Sobic007G156500 Sobic005G003200 Sobic005G003200 Sobic009G231300--Sobic005G003200 Sobic003G258400 Sobic003G258400 Sobic009G231300--Sobic003G258400 Sobic004G199600 Sobic004G199600 Sobic009G231300--Sobic004G199600 Sobic010G050600 Sobic010G050600 Sobic009G231300--Sobic010G050600 Sobic007G073400--Sobic004G212800 Sobic007G073400--Sobic004G164600 Sobic007G073400--Sobic004G076732 Sobic008G009500 Sobic008G009500 Sobic007G073400--Sobic008G009500 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic007G073400--Sobic009G113600 Sobic008G031350 Sobic008G031350 Sobic007G073400--Sobic008G031350 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic007G073400--Sobic008G042250 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic007G073400--Sobic005G110430 Sobic004G143700 Sobic004G143700 Sobic007G073400--Sobic004G143700 Sobic002G051400--Sobic009G113600 Sobic007G059300 Sobic007G059300 Sobic002G051400--Sobic007G059300 Sobic008G108900 Sobic008G108900 Sobic002G051400--Sobic008G108900 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic002G051400--Sobic002G062300 Sobic003G176100 Sobic003G176100 Sobic002G051400--Sobic003G176100 Sobic009G196700 Sobic009G196700 Sobic002G051400--Sobic009G196700 Sobic010G146200 Sobic010G146200 Sobic002G051400--Sobic010G146200 SobicK024000 SobicK024000 Sobic002G051400--SobicK024000 Sobic002G051400--Sobic008G009500 Sobic004G016500 Sobic004G016500 Sobic001G046600--Sobic004G016500 Sobic001G046600--Sobic004G212800 Sobic001G046600--Sobic004G164600 Sobic001G046600--Sobic007G073400 Sobic001G046600--Sobic003G424100 Sobic001G046600--Sobic004G112500 Sobic001G046600--Sobic008G167300 Sobic008G157950 Sobic008G157950 Sobic001G046600--Sobic008G157950 Sobic008G176732 Sobic008G176732 Sobic001G046600--Sobic008G176732 Sobic008G167300--Sobic004G212800 Sobic008G167300--Sobic004G016500 Sobic008G167300--Sobic001G046600 Sobic008G167300--Sobic001G024200 Sobic008G167300--Sobic008G161401 Sobic008G167300--Sobic004G164600 Sobic008G167300--Sobic004G112500 Sobic008G167300--Sobic002G007250 Sobic008G167300--Sobic003G424100 SobicK009900 SobicK009900 Sobic004G076732--SobicK009900 Sobic004G076732--Sobic002G410200 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic004G076732--Sobic001G253100 Sobic004G076732--Sobic008G009500 Sobic004G076732--Sobic007G073400 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic004G076732--Sobic009G209800 Sobic004G076732--Sobic008G042250 Sobic004G076732--Sobic005G110430 Sobic004G076732--Sobic004G212800 Sobic002G410200--Sobic004G076732 Sobic002G410200--Sobic009G209800 Sobic002G410200--SobicK009900 Sobic002G410200--Sobic001G253100 Sobic003G244800 Sobic003G244800 Sobic002G410200--Sobic003G244800 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic002G410200--Sobic005G139800 Sobic002G410200--Sobic008G042250 Sobic002G410200--Sobic008G009500 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic002G410200--Sobic008G049701
Octagon: transcription factors


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