Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G197200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PA48
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G291800 - -
2 Sobic.004G020401 - -
3 Sobic.009G110366 - -
4 Sobic.009G109450 - -
5 Sobic.008G068400 - -
6 Sobic.006G273100 - -
7 Sobic.008G091671 - -
8 Sobic.010G144100 - -
9 Sobic.002G212800 - -
10 Sobic.009G002500 polygalacturonase inhibitor precursor, putative, expressed -
11 Sobic.009G113600 - -
12 Sobic.008G079100 - -
13 Sobic.001G046600 cycloartenol-C-24-methyltransferase 1, putative, expressed -
14 Sobic.008G153600 WRKY94, expressed -
15 Sobic.003G031750 - -
16 Sobic.007G130100 armadillo/beta-catenin repeat family protein, putative, expressed -
17 Sobic.002G051400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@flavin-containing monooxygenase family protein, putative, expressed K00485: dimethylaniline monooxygenase (N-oxide forming)
18 Sobic.006G046000 - -
19 Sobic.006G068400 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@B-block binding subunit of TFIIIC("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@seed storage 2S albumin superfamily("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@transcription factor-related, putative, expressed K15199: general transcription factor 3C polypeptide 1
20 Sobic.009G004700 stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G197200 Sobic009G197200 Sobic004G291800 Sobic004G291800 Sobic009G197200--Sobic004G291800 Sobic004G020401 Sobic004G020401 Sobic009G197200--Sobic004G020401 Sobic009G110366 Sobic009G110366 Sobic009G197200--Sobic009G110366 Sobic009G109450 Sobic009G109450 Sobic009G197200--Sobic009G109450 Sobic008G068400 Sobic008G068400 Sobic009G197200--Sobic008G068400 Sobic006G273100 Sobic006G273100 Sobic009G197200--Sobic006G273100 Sobic008G091671 Sobic008G091671 Sobic009G197200--Sobic008G091671 Sobic010G144100 Sobic010G144100 Sobic009G197200--Sobic010G144100 Sobic002G212800 Sobic002G212800 Sobic009G197200--Sobic002G212800 Sobic004G291800--Sobic004G020401 Sobic004G291800--Sobic009G197200 Sobic004G291800--Sobic009G110366 Sobic004G291800--Sobic002G212800 Sobic007G112900 Sobic007G112900 Sobic004G291800--Sobic007G112900 Sobic004G291800--Sobic009G109450 Sobic007G130100 Sobic007G130100 Sobic004G291800--Sobic007G130100 Sobic004G291800--Sobic006G273100 Sobic003G057800 Sobic003G057800 Sobic004G291800--Sobic003G057800 Sobic004G020401--Sobic004G291800 Sobic004G020401--Sobic009G110366 Sobic004G020401--Sobic009G109450 Sobic004G020401--Sobic009G197200 Sobic004G020401--Sobic003G057800 Sobic004G020401--Sobic007G130100 Sobic001G479500 Sobic001G479500 Sobic004G020401--Sobic001G479500 Sobic003G357500 Sobic003G357500 Sobic004G020401--Sobic003G357500 Sobic008G161401 Sobic008G161401 Sobic004G020401--Sobic008G161401 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic009G110366--Sobic007G073400 Sobic009G110366--Sobic004G020401 Sobic009G110366--Sobic009G109450 Sobic003G258400 Sobic003G258400 Sobic009G110366--Sobic003G258400 Sobic006G196000 Sobic006G196000 Sobic009G110366--Sobic006G196000 Sobic004G143700 Sobic004G143700 Sobic009G110366--Sobic004G143700 Sobic009G110366--Sobic004G291800 Sobic009G180200 Sobic009G180200 Sobic009G110366--Sobic009G180200 Sobic009G198900 Sobic009G198900 Sobic009G110366--Sobic009G198900 Sobic009G078500 Sobic009G078500 Sobic009G109450--Sobic009G078500 Sobic004G199600 Sobic004G199600 Sobic009G109450--Sobic004G199600 Sobic009G109450--Sobic009G180200 Sobic005G130100 Sobic005G130100 Sobic009G109450--Sobic005G130100 Sobic009G231300 Sobic009G231300 Sobic009G109450--Sobic009G231300 Sobic009G109450--Sobic006G196000 Sobic005G121800 Sobic005G121800 Sobic009G109450--Sobic005G121800 Sobic002G376900 Sobic002G376900 Sobic009G109450--Sobic002G376900 Sobic009G109450--Sobic009G110366 Sobic008G068400--Sobic009G197200 Sobic006G132200 Sobic006G132200 Sobic008G068400--Sobic006G132200 Sobic007G115000 Sobic007G115000 Sobic008G068400--Sobic007G115000 Sobic005G212500 Sobic005G212500 Sobic008G068400--Sobic005G212500 Sobic009G004700 Sobic009G004700 Sobic008G068400--Sobic009G004700 Sobic008G068400--Sobic010G144100 Sobic003G031750 Sobic003G031750 Sobic008G068400--Sobic003G031750 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic008G068400--Sobic002G062300 Sobic003G424100 Sobic003G424100 Sobic008G068400--Sobic003G424100 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic006G273100--Sobic009G113600 Sobic002G051400 Sobic002G051400 Sobic006G273100--Sobic002G051400 Sobic006G273100--Sobic009G109450 Sobic006G273100--Sobic009G110366 Sobic009G196700 Sobic009G196700 Sobic006G273100--Sobic009G196700 Sobic006G273100--Sobic005G121800 Sobic008G079100 Sobic008G079100 Sobic006G273100--Sobic008G079100 Sobic006G273100--Sobic006G132200 Sobic008G108900 Sobic008G108900 Sobic006G273100--Sobic008G108900 Sobic008G091671--Sobic009G197200 Sobic006G068400 Sobic006G068400 Sobic008G091671--Sobic006G068400 Sobic008G091671--Sobic007G112900 Sobic008G091671--Sobic002G212800 Sobic008G091671--Sobic004G291800 Sobic009G067501 Sobic009G067501 Sobic008G091671--Sobic009G067501 Sobic003G159450 Sobic003G159450 Sobic008G091671--Sobic003G159450 Sobic005G099150 Sobic005G099150 Sobic008G091671--Sobic005G099150 Sobic010G139301 Sobic010G139301 Sobic008G091671--Sobic010G139301 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic010G144100--Sobic002G056100 Sobic010G144100--Sobic003G031750 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic010G144100--Sobic001G240400 Sobic009G045700 Sobic009G045700 Sobic010G144100--Sobic009G045700 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic010G144100--Sobic001G305400 Sobic005G141801 Sobic005G141801 Sobic010G144100--Sobic005G141801 Sobic008G091900 Sobic008G091900 Sobic010G144100--Sobic008G091900 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic010G144100--Sobic002G221200 Sobic008G036500 Sobic008G036500 Sobic010G144100--Sobic008G036500 Sobic002G212800--Sobic007G112900 Sobic002G212800--Sobic004G291800 Sobic006G046000 Sobic006G046000 Sobic002G212800--Sobic006G046000 Sobic002G212800--Sobic003G159450 Sobic006G048775 Sobic006G048775 Sobic002G212800--Sobic006G048775 Sobic002G212800--Sobic009G197200 Sobic002G212800--Sobic008G091671 Sobic002G212800--Sobic009G110366 Sobic002G212800--Sobic004G020401
Octagon: transcription factors


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